Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001350114.2

Sequence Length

2569 nt

GC Content

0.4609

GACUCCCGCGCGCGCUCGGCUGGUCCCAGUCCCCGGGAGAAGAAGCGGAGGAGGGAGAGAGCCAGCGAGGCGGCCCAGGGGAGCGGGCGCGAGUGGCGGCUGCCGGAGCCGCCUGUGCACGGGCGGCGGCGAGGCGAGGGUGGCGGUCGCCUGAGCAGCUAGAGCCGGGGCGGCGCGGAAUCCGCAUCCGCCGCGAGUGUGAUGAAGCUACCCUGCCUCGCUGCUCCGCUUGCCGCCAGCUGACACCGCCUGCACCCAGCCCGCCCGGGAGGGGAGACGCCGCGGGGCCGUGACCUUGGCGGAGGAGGGCACACUGAUAAUUCUUGUAUCUUGAGAGUGGACCAAGUUUUGGGUGACAUGGCCCAGGGGAAUAAUUAUGGGCAGACCAGCAACGGGGUGGCCGAUGAAUCACCCAACAUGCUGGUGUACAGAAAGAUGACAUGACCUUAUAUGUAGAAGAUCCCAGAGACUUCACAAAAAUUGUUAGAACUUGGAGCAGGAAAAUCAAUGGAAGACGUCAUAGCACGGAUGCAAGAUGAAAAAAAUGGAAUUCCUAUUCGUACGGUCAAAAGCUUUCUUUCCAAGAUACCUAGCGUCUUCUCUGGUUCAGACAUUGUUCAAUGGUUGAUAAAGAACUUAACUAUAGAAGAUCCAGUGGAGGCGCUCCAUUUGGGAACAUUAAUGGCUGCCCACGGCUACUUCUUUCCAAUCUCAGAUCAUGUCCUCACACUCAAGGAUGAUGGCACCUUUUACCGGUUUCAAACCCCCUAUUUUUGGCCAUCAAAUUGUUGGGAGCCGGAAAACACAGAUUAUGCCGUUUACCUCUGCAAGAGAACAAUGCAAAACAAGGCACGACUGGAGCUCGCAGACUAUGAGGCUGAGAGCCUGGCCAGGCUGCAGAGAGCAUUUGCCCGGAAGUGGGAGUUCAUUUUCAUGCAAGCAGAAGCACAAGCAAAAGUGGACAAGAAGAGAGACAAGAUUGAAAGGAAGAUCCUUGACAGCCAAGAGAGAGCGUUCUGGGACGUGCACAGGCCCGUGCCUGGAUGUGUAAAUACAACUGAAGUGGACAUUAAGAAGUCAUCCAGAAUGAGAAACCCCCACAAAACACGGAAGUCUGUCUAUGGUUUACAAAAUGAUAUUAGAAGUCACAGUCCUACCCACACACCCACACCAGAAACUAAACCUCCAACAGAAGAUGAGUUACAACAACAGAUAAAAUAUUGGCAAAUACAGUUAGAUAGACAUCGGUUAAAAAUGUCAAAAGUCGCUGACAGUCUACUAAGUUACACGGAACAGUAUUUAGAAUACGACCCGUUUCUUUUGCCACCUGACCCUUCUAACCCAUGGCUGUCCGAUGACACCACUUUCUGGGAACUUGAGGCAAGCAAAGAACCGAGCCAGCAGAGGGUAAAACGAUGGGGUUUUGGCAUGGACGAGGCAUUGAAAGACCCAGUUGGGAGAGAACAGUUCCUUAAAUUUCUAGAGUCAGAAUUCAGCUCGGAAAAUUUAAGAUUCUGGCUGGCAGUGGAGGACCUGAAAAAGAGGCCUAUUAAAGAAGUACCCUCAAGAGUUCAGGAAAUAUGGCAAGAGUUUCUGGCUCCCGGAGCCCCCAGUGCUAUUAACUUGGAUUCCAAGAGUUAUGACAAAACCACACAGAACGUGAAGGAACCUGGACGAUACACAUUUGAAGAUGCUCAGGAGCACAUUUACAAACUGAUGAAAAGUGAUUCAUACCCACGUUUUAUAAGAUCCAGUGCCUAUCAGGAGCUUCUACAGGCAAAGAAAAAGGGCAGAAACAUCCCUAUUUUCCCAUGCCAUAAAAACUGUACACCAACACUGAGGGCCAGCACUAACCUGUUAUGAAAAGAGGGGAAAUCUCUCACGUCCAAGAGGUUAACAAGCCUUGCUCAGUCUUACUAAACGGAUCAUCUUGUAGCAUGAAUGCAGACUGGAGUCACUGCACACACUUUGUAGCUCAAUGUUGUGACCUGGAGCAGAGGACAUUAGAACAAGAUGUUGCAUGAGCAAAGGACCUAAAUUGUUAUUUUUGUGUGUACAUUCCAUCUCCAAUGGACUCUUCCGUCUCAAUGCCUCCAUUCCAAACUGUUGUCUGCUUUCUUUCUCCUUCUACUAUGCUGGAUCUGUGUCUCUUCCUUUUUAACAAGUUCAAGUGAAGUAAAACCUUUUCUUUUUUUCCUUCUUUCUCUCUCUCUCUCUCUCAAAGCUUCAGUUAGACACACAGUUCACUGAAAAUUCAGUCAGUCAAAAACUGGAAGAACUGUAAAAGAAAAAAGUAUAUAUCAAUAAGUAUACAUGUGGCUUCACAUUUAUUAAACAAUAAAUUCCGCACAGAAAGUUUCAUUUCACCAAUGUGUCACAGUCAGAAACAAACUCAUGUCUUCGUCUGUUGUCUGUACAUUCUCCGUUAAUGUUUCUCGCAUUUAUUUUUAUACCAUAUUUAAAGAAGAAACACCUUUUACUCCAAAUGUAUUAAAGUUGAUCCCUUCUCUGUAAAUUUGUGUAUGUUUAUAUUGUUGUUUUAUCUUUCAUUAAAAGAUGCAGAAUCUCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-736.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -788.01

Frequency: 0.0000

Diversity: 775.07

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((((((.(.(.(((.((......))))).))))))))..((((((((((((((((((((((((.(..(((((((.(.((.(((((((..(((((((((...((((((((((((....)))))))(((((((((.((((((((.(((((((..((.......))((.(((((.((((...))))..))))).)))).)))))...))))))))))))))))))))))...))))))).)).....))))))).(((..(((....)))..))).....)).).)))))))..).)))))(((((((((...((((....((((.(((((......((((((((.((((((((((((...(((((............)))))..(((((((...((((((........))))))....)))))))((.((......)))).((((......(((.((((.((.....)))))))))......)))).......(((.(((((..((.........((((...(((....)))..)))).........)).))))).)))(((((.(((...((((((((((((((......(((((((((.((((.((........(((.((((((((........)))))))).))))).)))).)))))))))...))))).........((((((..((.((.(.(((((((.((((((.......(((((((...(((((.(((((((((..........((((...))))...........)))))))..)).))))).(((((......(((.((.((((((((.....((((.........))))))))..)))).)))))..((((.(((.((....))))).)))))))))...(((......))).....((((....)))).(((((((((..(((..((....))....)))))))))))).....))).)))))))))).)))))))).)).)).)))))))))))))))....)))..))))).(((((....)))))(((((.((.............)).))))).....))))))))))))((.(.((..((.........))..)).).))..)))))))).....))))).))))....))))....)))...........(((((((.............(((((....(((.....)))...........(((((((...(.((((.(((((.(((((.................)))))..))))))))).)...((((....(((((...)))))...))))....))))))).......)))))......(((.((((....))))))).)))))))((((((((((.(((...(((((.((.(((((((((((((..(((((((...(((((.(((((...((((((((..(((......(((((((..(((...(((((((((((.((((.........)))))).)))))))))...)))..(((((.(((.((..(((.....((((..((((.....)))).))))..((((.((((((...(....)...)))))))))).)))..)).))).)))))....(((((...)))))..............(((((((((.(((((((..(((..............((.(((.((((..((((((.........((.((((((.(((.........))).)))))).)).....))))...))..)))).))).))((((..(((((((((.(......))))).)))))...)))).......((((........(((((((((..(...((((((.((..((...(((((.....)))))...)).)).)))))).)..)))...))))))........))))..((((((((.(((....)))...((((.(((.((((.(.((..(((((((.....)))))))..))).))))..))).)))).))))))))((((....))))))).)))......))))))))))))).....(((((.....)))))))))))))))))))))))))))).)))))))))))).)))))))...............)))))).)).)).)))))))))......)))))))(((.((((......)))).)))....))))))....)))))))))).))))....))))).....(((((((((((((((((....)))))((((.....))))...)))))))...........((((((........)))))).(((((......(((((((....))))))).)))))..((((......))))......)))))((((.(.((((((......))).)))).))))..((((((...(((...((((((......(((..(((...(((((((.(((((.(((((...((.(((((((.......)))..)))).))....)))))...))))).)).)))))...)))....))).........)))))).)))))))))...)).

Thermodynamic Ensemble Prediction

..((((((.{.{,(((.((((..,{||}}||||||}}}}.....{|||,|||||||,,,||||||||.((((({...(((..(((((((.,(((((((((.{.((((((((((((....)))))))(((((((((.((((((((.(((((((..,,..,....))((.(((((.((((...))))..))))).))}).)))))...)))))))))))))))))))))),..))))))).)).....))))))).))).),)))))))||,|(((.((,((((.((((((((.(((((((.(,..(((((((....{{....,,.{{.((({{((((.((((......,{(((((......)))))}|{{{,,...,.((((((((((((((...((((((........))))))....)))))))....{(((((,.....(((((.{,{.{((.((((.((.....))))))))}.....,,,........,(({.(((((..{(.,{......((((.{.(({....}))..))))......,},}}.})))).)))}}}.)))))...,}}})))|||{,{{.,....(((((((((.((((.((........(((.((((((((........)))))))).))))).)))).))))))))),,|||||}}}.,,...,}}|))))))).}}.}}.}}}},)))).)))))))}}}}))))))...})))))).).))))).)}}.....}|||.}}...})}}},..,{{{{||,.|||{....}}))},)}}))}}}..,(({,{..{((({{{{...,,((({.,,......}}}}}}}}..)))}.{({(((((((.((((.((.{.(((((...))))).}..})})))){(((({......((({....)))).(((((((((..(((..((....))....)))})))))))).(({(((((((.((((..((((((((((,{.{,((((((({,{,{{{,{,(((({((,{{(,({.({{{{.,||}))|||||||{{....,..{{{,..{{{({{........|||,|||}}.,}|.,.......,.......,,}},.||||||||{,||||,......{{||..,.,..}})}},}}...,...,,,,...,...,}}|,|,,,...,|||....,|,,|..,,|||.....,,,..........,(((({{{...{.((((.(((((.{{{{{......{{,,,......}}))),,))))))))).}...((((..,.(((({...}))))...))))....}}))))}.,,|...}}}}}..,.,.}}|}||||.,,.}},.,|{{{{,.|,,((((((({((.(((...(({{(.({.(((((((((((|,{{(,(({{{{{,{{(((.(((((.,(((((((({.,(((......(((((((..((({{{((({{{{((({.{(((,,,,,,.,.}}}}|}|},,}}}}}).,})))|||{(((.(((.((.(((({{...((((.,({{{.....))},.))))..,,,||||||....,{,{{,...,|||||((|||,}})}}}).}}}.)))}}....{({{{..,))}}),||,..........,,(,{.....}}},|||}}},{{{{...,,{,{,,.,{,({,{((((,,{,{{{({|||{{{{,,({,(({{,,(((,,,,.....}}|,||||||,||,|,||||}||{.,}}}),}),,,}.,.((((..(((((((((.{......})))).)))))...))))........{{{...,,.,,|{{{{{|||,,|...((((((.((..((...(((((,...,)))))...)).)).)))))).,..}||{,,||||||.,.......,}},.{{{{{{{{,{{{....))}...{{{|,|||,||{{.|}||.,|||||{,..,},))}))},}})),,)))}..}||,||}}.}}}}))))||{|.,,}))}},}}.,......,}}}.,,,}})}))))},..|{{{{.....})))}))))))))))))))))))))}}},)))}}})))))}.}})}}))}}}..}}}}},....}))))).)).)).)))))))))......))))))).,}.}}||,.........))))))))))..)))))))))))}))))))))),..}))))))))}.(((((((((((((((((....)))))((((.....))))...)))))))...........((((((........)))))).((((,...,,,|((((((....))))))}.,,}}}..((((......)))).....,))))){(((.{.(({(({......))).}))},)))),)))))},,.,},}}}},..,{||||||.}|,,,,{,.,.{{{{,,,.,,,||.{{{{|,,,||.{{|||{{.......)))..}))).}}.}}})))))}}}),}},.|}{|||}},,|,}},||,,,|,,,{{{{{{.....)))))))))}},,.,,.