Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001350803.2

Sequence Length

2121 nt

GC Content

0.5823

AGCUGCUGGCUACAGCUUCCCGGGGGAGCCGGGUACCACCCGGGCCUGGAGACAUGAGGAGGCAGGGAUGUGAGGGGCGGGGGACAGGACAGCCGGCCUUCCGUUAAAUAUCUGCUCCUCGCGCUCGAGCCUCCCUGCCUAUUGUCGGGGCCGGAGGCGAGCCGACGCAGCAUCAGCUCGUCAACGGGAAGGAAGAUGCCUCCCUGCACGCCCGCCGCGCACAGAGCAUAAAGAAUCUGCGCUGAGGAGGCAGGAGAAGAAAGCCGAAUCUAUCUACCGCCGGGGAGCCAGAAGAUGGAGGAAGCUGUACCGUGCCAACGGCCACCUCUUCCAAGCCAAGCGCUUUAACAGGAGAGCGUACUGCGGUCAGUGCAGCGAGAGGAUAUGGGGCCUCGCGAGGCAAGGCUACAGGUGCAUCAACUGCAAACUGCUGGUCCAUAAGCGCUGCCACGGCCUCGUCCCGCUGACCUGCAGGAAGCAUAUGGAUUCUGUCAUGCCUUCCCAAGAGCCUCCAGUAGACGACAAGAACGAGGACGCCGACCUUCCUUCCGAGGAGACAGAUGGAAUUGCUUACAUUUCCUCAUCCCGGAAGCAUGACAGCAUUAAAGACGACUCGGAGGACCUUAAGCCAGUUAUCGAUGGGAUGGAUGGAAUCAAAAUCUCUCAGGGGCUUGGGCUGCAGGACUUUGACCUAAUCAGAGUCAUCGGGCGCGGGAGCUACGCCAAGGUUCUCCUGGUGCGGUUGAAGAAGAAUGACCAAAUUUACGCCAUGAAAGUGGUGAAGAAAGAGCUGGUGCAUGAUGACGAGGAUAUUGACUGGGUACAGACAGAGAAGCACGUGUUUGAGCAGGCAUCCAGCAACCCCUUCCUGGUCGGAUUACACUCCUGCUUCCAGACGACAAGUCGCCUCCGGCGCCUCUCUCCCUGCAGGUUGUUCCUGGUCAUUGAGUACGUCAACGGCGGGGACCUGAUGUUCCACAUGCAGAGGCAGAGGAAGCUCCCUGAGGAGCACGCCAGGUUCUACGCGGCCGAGAUCUGCAUCGCCCUCAACUUCCUGCACGAGAGGGGGAUCAUCUACAGGGACCUGAAGCUGGACAACGUCCUCCUGGAUGCGGACGGGCACAUCAAGCUCACAGACUACGGCAUGUGCAAGGAAGGCCUGGGCCCUGGUGACACAACGAGCACUUUCUGCGGAACCCCGAAUUACAUCGCCCCCGAAAUCCUGCGGGGAGAGGAGUACGGGUUCAGCGUGGACUGGUGGGCGCUGGGAGUCCUCAUGUUUGAGAUGAUGGCCGGGCGCUCCCCGUUCGACAUCAUCACCGACAACCCGGACAUGAACACAGAGGACUACCUUUUCCAAGUGAUCCUGGAGAAGCCCAUCCGGAUCCCCCGGUUCCUGUCCGUCAAAGCCUCCCAUGUUUUAAAAGGAUUUUUAAAUAAGGACCCCAAAGAGAGGCUCGGCUGCCGGCCACAGACUGGAUUUUCUGACAUCAAGUCCCACGCGUUCUUCCGCAGCAUAGACUGGGACUUGCUGGAGAAGAAGCAGGCGCUCCCUCCAUUCCAGCCACAGAUCACAGACGACUACGGUCUGGACAACUUUGACACACAGUUCACCAGCGAGCCCGUGCAGCUGACCCCAGACGAUGAGGAUGCCAUAAAGAGGAUCGACCAGUCAGAGUUCGAAGGCUUUGAGUAUAUCAACCCAUUAUUGCUGUCCACCGAGGAGUCGGUGUGAGGCCGCGUGCGUCUCUGUCGUGGACACGCGUGAUUGACCCUUUAACUGUAUCCUUAACCACCGCAUAUGCAUGCCAGGCUGGGCACGGCUCCGAGGGCGGCCAGGGACAGACGCUUGCGCCGAGACCGCAGAGGGAAGCGUCAGCGGGCGCUGCUGGGAGCAGAACAGUCCCUCACACCUGGGCCCGGGCAGGCCAGCUUCGUGCUGGAGGAACUUGCUGCUGUGCCUGCGUCGCGGCGGAUCCGCGGGGACCCUGCCGAGGGGGCUGUCAUGCGGUUUCCAAGGUGCACAUUUUCCACGGAAACAGAACUCGAUGCACUGACCUGCUCCGCCAGGAAAGUGAGCGUGUAGCGUCCUGAGGAAUAAAAUGUUCCGAUGAUGUGGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-809.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -848.19

Frequency: 0.0000

Diversity: 467.31

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(((((..(((.((..((((.((.((((((((((...)))))).(((.........))).(((..(((...(((((((.(((.((.(((((((....((((((((.....((((((((((((((((..((((((..((((.......)))).)))))))))).((((.(((....)))))))..((((.(((......))).))))...((((..((.((.((((..........)))).))))..).))).((((((((........))).))).))).))))))).)))).))))))))..))))).)))).))..).))).)))).)))..)))..(((((((......))))))).....((((((((((.((((((((..(((.((((((.((((((((((.((((((.(((....(((...((((.((((....((((.....(((....)))..)))))))).))))...))).))).).)))))...))))).......)))))..((.....)).....))))).).)))....))))((((.(((((.....((((.((....)).)))))).))))))).((((((((((........((.((.(((((((......((((((.(((..((..((((((..(((....((((.((((((...(((((((((((((((((.....)))))))).((((.((((((((((..((..((((((((.....((.(((((.....((((((((......((((((....))))))........((....)).....(((.((((..(((.((((((.((((((..........)))))).......))))))))).....)))).)))(((..(((..(((((....(((.((...(.((((...))))).)))))....))))).)))))))))))))).......))))).))))))))))....((((...(((....)))..))))(((((....)))))..))..)))))).)))).))))...)))))..)))).....))))))...))))....)))))))))......))))))))))).....))))))).))...))..((((((((.((.((.......((.(((((((.((..((...((((((((((.((((........(((.((((((((((..(((((.......((..(((((........))))).))...((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((((.(((((..(((((((..((((((.....)))))).))))))).(((......)))....)))))..)))))))..((((((((........)))))))))))).((((.....))))...(((((((.((.((((((((.(..(((((((....)))))))..)))..........))))))....)).)))..)))).(((..((((((..((.(((((((((.(((......))).........))))))))).)).))))))..))))))))........(((((((..((.((......))))..)).))))).........))).))))))))..))))))))))))(((((..(((((....(((((((((..(((((.((.((((..(.((((((((....)))))))).)................(((.((((((((....)))))).)))))((((((.(((.(......)))).)))))).)))))))))))...))))))))).((...((((....))))..)))))))..))))).)).)))((((((((........)))).))))...)))))))))).((((((....)))))))))((((.........))))...)))).))))))))))...)).))..))))))).))......)))).))))))))(.((((((.....)))))).).((((....)))).)))))))))).((((((..((..........))..))))))....)))).))))))))))..)))).)).))))..)))))..)))))(((....((((((...))))))...)))......

Thermodynamic Ensemble Prediction

.(((((..(((.((..((((.((.((((((((((...)))))}.(((.,.....,.))).(((..(((...(((((((,,,({{(.(((((((...{((((((((.....((((((((((({((((..((((((..((((.......)))).)))))))))).((((.(((....)))))))..,(((.{((......)))}))||,..,{({.{,((((.,{((..........))))})).).)).))).((((((((........))).))).)))})))))))},))).))))))))..))))).))}).))..).))).)))).)))..)))..(((((((......))))))).....((((((((((.(((({(({..(((.((((((.((((((((((.((((({.{((,...(((...((((.((((....{(((..{,.,{{,,..)))..}))))))).))))...))).})),),)))))...))))).......)))))..,,.....,,.....))))).).)))..,,))}|((((.(((,,..,,.((((.((....)).)))))).))))))),((((((((((........({.{(,(((((((......((((((.((,..{{,.(((((({..((....((((,((((((...(((((((((((((((((.....)))))))).((((.((((((((({.{(((,{((....)))})}|,{((((,.....,,|||||...,{{.((((((....)))))).,},..{{((.{{{(|..,.{(((.((((..{((.((((({.({{,{{,.,,.,,...|}))}|..|,,,.}})))))}}.....)))),)))||,..,}}}.|||))}},..(({.....|}|{{{..,}))}|||||}|,,|||||||,,}}||||}|||,|||{.....))))}}))||||}||||.,,{{{{.,.{{{.,..)))}.))},(((((....))))).,)}},)))))).)))).))))...)))))..)))).....}}))))...)))),,..))))))))},.,...})})})))))).....))))))).}),,,}}..((((((((.{.{((.......({.(((((((.((..((...((((((((((.((((........{{{.((((((((((..(((((.......{(.,(((((........))))).),,,.((((((((((.((((((((((((((((,,,(({(((((((.(((((..(((((((..((((((.....)))))).))))))).(((......)))....}))))..))))))).)){((((((.,....,.))))))}))))}}||||..,..)})),.,,{{{,,(({{{(({{((((.({{(({((({....}))})))}}.))..........)}|||},(({,.}})))).{{{{{{{..{{.((({..(,(((((((((.(((......}}}.,....,..))))))))|{(((({,,{,{((....))).,,)}...}})))},..,|}|,.}}}}.}}...,))))))},...,}}}}}),}.))))))))..))))))))))))(((((..(((((....(((((((((..{((((.((.((((..{.((((((({....}))))))).}................(((.((((((((....)))))).},}))((((((.(((||....,.)))).)))))).))))))))))}...))))))))).|,.,,((((....))))..)))))))..))))).)).)))((((((((........)))).))))...)))))))))).{(((((....))))))}}}((({.|......}))))...)))).))))))))))...)).))..))))))).})......)))}.)))))))){.{({(((,,,.,}}})}},),{||{,,,,,))},)))))))))).((((((..((..........))..))))))....)))).)))))))))).})))).)).))))..)))))..))))),((,...((((({...})))))...}},..,,..