Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001351162.2
Sequence Length
403 nt
GC Content
0.3945
AGUGGAAGAAGAUGGCGGAAGGCGGAGCGGCGGAUCUGGACACCCAGCGGUCUGACAUCGCGACGCUGCUCAAAACCUCGCUCCGGAAAGGGGACACCUGGUACCUAGUCGAUAGUCGCUGGUUCAAACAGUGGAAAAAAUAUGUUGGCUUUGACAGUUGGGACAAAUACCAGAUGGGAGAUCAAAAUGUGUAUCCUGGACCCAUUGAUAACUCUGGACUUCUCAAAGGUCAUUAUUUUCUUCCUUCAGUCAAGUUGUAAAUGUGUUAAAUUUCAUUAUAUAAAUGUCAGUGGGUUGAAUUUGGAAAAUGUUAGCGCAAAUAAGUUGAUAAAGUUUUGCAUUACAGAUUUUACCUAAUGAACUCAUUAUUCUAAUAAGUUAUUAAAAAUUUUAUUAGUUAUUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-94.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -103.32
Frequency: 0.0000
Diversity: 102.17
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...((((((((((((.(..(((..((((((((....(((....)))(((((.....)))))..))))))))....)))..).))(((..(((....)))..).)).((((((((.((((((.......))))))........)))))))).((((..((((((......(((((.(....(((((...((.((...)).))...)))))..))))))...))))))..))))..))))))))))....(((((.((((...((((((((....((((...(((((.(((......))))))))...)))))))))))).)))).)))))(((((((........)))))))...(((((....)))))..((((((((...........))))))))......
Thermodynamic Ensemble Prediction
...(((((((((((((({,{((..((((((((....(((....)))(((((.....)))))..))))))))....))),}}}}}|,...(({....}}}..}.)).((((((((.{(((((.......)))))}........)))))))).((((..((((((......(((((.(,,..((((,...{{,{,...,}.}).}}))))}..})))))...))))))..)))).)))))))))))....{{{{{.((((...((((({{{....{||{.,.{{(({.(((,.,,,|}}||||}|.,.|}|}|}||}}}}.}}}}.))))},{{{{|||,.....})})})),,,,|{{||,...)))}}..(((((((({,......}},))))))))......
Back