Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001351373.2

Sequence Length

1027 nt

GC Content

0.4752

GCAUUUGCAGAGUGAGACAAAGCGGAGAACGCUGGUGGGCCUGUUGUGGAGUACGCUUUGGACUGAGAAGCAUCGAGGCUAUAGGACGCAGCUGUUGCCAUGACGGCCCAGGGGGGCCUGGUGGCUAACCGAGGCCGGCGCUUCAAGUGGGCCAUUGAGCUAAGCGGGCCUGGAGGAGGCAGCAGGGGUCGAAGUGACCGGGGCAGUGGCCAGGGAGACUCGCUCUACCCAGUCGGUUACUUGGACAAGCAAGUGCCUGAUACCAGCGUGCAAGAGACAGACCGGAUCCUGGUGGAGAAGGUACAGAGCGCUGCUGGGACAUCGCCUUGGGUCCCCUCAAACAGAUUCCCAUGAAUCUCUUCAUCAUGUACAUGGCAGGCAAUACUAUCUCCAUCUUCCCUACUAUGAUGGUGUGUAUGAUGGCCUGGCGACCCAUUCAGGCACUUAUGGCCAUUUCAGCCACUUUCAAGAUGUUAGAAAGUUCAAGCCAGAAGUUUCUUCAGGGUUUGGUCUAUCUCAUUGGGAACCUGAUGGGUUUGGCAUUGGCUGUUUACAAGUGCCAGUCCAUGGGACUGUUACCUACACAUGCAUCGGAUUGGUUAGCCUUCAUUGAGCCCCCUGAGAGAAUGGAGUUCAGUGGUGGAGGACUGCUUUUGUGAACAUGAGAAAGCAGCGCCUGGUCCCUAUGUAUUUGGGUCUUAUUUACAUCCUUCUUUAAGCCCAGUGGCUCCUCAGCAUACUCUUAAACUAAUCACUUAUGUUAAAAAGAACCAAAAGACUCUUUUCUCCAUGGUGGGGUGACAGGUCCUAGAAGGACAAUGUGCAUAUUACGACAAACACAAAGAAACUAUACCAUAACCCAAGGCUGAAAAUAAUGUAGAAAACUUUAUUUUUGUUUCCAGUACAGAGCAAAACAACAACAAAAAAACAUAACUAUGUAAACAAGAGAAUAACUGCUGCUAAAUCAAGAACUGUUGCAGCAUCUCCUUUCAAUAAAUUAAAUGGUUGAGAACAAUGCAUAAAAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-325.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -342.71

Frequency: 0.0000

Diversity: 291.53

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.....((((..((.......((((.....))))((....))((((((.......((((((.((((.(((((.((.(((((......(((((((((((((((.(.(((((....)))))).))))).)))(((((((.((.......)).)))).)))))))..)))))))).))..(((((......(((.((((((((((((.((.(((.((.....)).))))).)))...))))))))).))).......)))))(((.(((((((((.........(((...(((....)))...))).....)))).)))))...)))(((((((((..........((((((....)))))).......(((((((((.(((((.((..((((.(((((...........))))).).)))..)).))))).)(((((((.((((......((((.......))))..(((..((((..(((.((.(((((((.((((...))))..))))))).)).)))))))..))))))))))))))((((((((........).)))))))((((.((((((((((((((....((((((.((((((((...((.(((((((((.((.(......).)).))))))))).))..(.((((((((..........)))))))))))).)))))..))))))..(((.((((..............)))))))(((((((....))).))))...........((((.(((...((((((..(....)..))))))...))))))))))))))).))))))...)))).))))))))...............................))))))))).((((((((.((.....)).))))))))))))))))).))))))......)))))).....((((....))))......((((.....((((((................)))))))))).(((((((..........)))))))))..))))........

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((({{(((..((...,{..((((.....)))).|}...}}{(((((.......((((((.{(((.((((({((,{((({,,,,..{{{,{||||,|||{|,|,(((((.,,,}|||||,}|}}|,}}}{{{((((.((.......)).)))).}}}}))}..|||}|}}|,|}..(((((,,....(((.((((((((((((,{{.{||,{(,,,,,}}.}}))).)))...))))))))).)))...,...))))),.,.|||||{|||..,,,,.,,(((,,,(((,,,,|||,,.|||,....||}|{|||||,,.|||{{{((((({.......,..{(((((....)))))}.,,,.,.{({{{{{{{,|||||.,||||,||,|||{{...........||}}|,|.||}.,{|,|||}|.}({((({.,{{||......,|||,,.....)))),,,||,.{{{{..(((,({,(({{{{{.|||{.,,)))).,))))))),)).))))}})..)}|}))))}))))){(((((({........)}}}))))}((((.((((((((((((((.,,,{(({{{.(({{{(({,..((.{((((((((,({,{......|.)).))))))}}}.))||{.((((((((..........)))))))).,)),}|}}},.}}}}}}.,({{.{{{{..............}}}))))|(({(({....))).}}}}...........{{{,,{{|...{(((((..|....}..))))))...))))))))))))))),|)))))...)))).})))}}}}...............................})))}}))),|(((((((.((.....)).))))))))))))))))}.))))))....,.)))))).....{{{{....})))......((((.....((((((................)))))))))).(((((((..........))))))).,,}))).........