Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001351518.2

Sequence Length

995 nt

GC Content

0.4402

GCCGCCAUCUUGUAUUGGGGUUUCAUUGUUCCCGCUGGGCCGGGCGGUUUAGUGUAAUUGCCGCCGGAGGAGGAGGCGGAGUAACCUCUGGUCAGCCGAGAAACCCCACUAUCCUGUAGCCAUAACCGCUUAAACGAUUUGGGAGGUAGUGAAGGGCAGGGAGCUGGACCUGGAGGCGCCGCCGCGACAGCAGCAGCCAUGGAGGACGAGAUGCCCAAGACUCUAUACGUCGGUAACCUUUCCAGAGAUGUGACAGAAGCUCUAAUUCUGCAACUCUUUAGCCAGAUUGGACCUUGUAAAAACUGCAAAAUGAUUAUGGAUACAGCUGGAAAUGAUCCCUAUUGUUUUGUGGAGUUUCAUGAGCAUCGUCAUGCAGCUGCAGCAUUAGCUGCUAUGAAUGGACGGAAGAUAAUGGGUAAGGAAGUCAAAGUGAAUUGGGCAACAACCCCUAGCAGUCAAAAGAAAGAUACAAGCAGUAGUACCGUUGUCAGCACACAGCGUUCACAAGAUCAUUUCCAUGUCUUUGUUGGUGAUCUCAGCCCAGAAAUUACAACUGAAGAUAUAAAAGCUGCUUUUGCACCAUUUGGAAGAAUAUCAGAUGCCCGAGUGGUAAAAGACAUGGCAACAGGAAAGUCUAAGGGAUAUGGCUUUGUCUCCUUUUUCAACAAAUGGGAUGCUGAAAACGCCAUUCAACAGAUGGGUGGCCAGUGGCUUGGUGGAAGACAAAUCAGAACUAACUGGGCAACCCGAAAGCCUCCCGCUCCAAAGAGUACAUAUGAGUGUAGGUGUAUUGGAGAAGAAAAGGAAAUGUGGAAUUUUGGAGAAAAAUACGCUAGAUUUUAAAUGUUAGAGCUGUUCCCGGAGACUUAUUGCAGAAAUAGAUGAGAAGCAAAUCAAGACUACUAUUCAAAAAUGUACUUAGUUUUCAUUUUUGUAAUUAUAAAUAAUAUUAUUUCUAAUGUCAAGUCUCCUAUUAAAUAGAAAAUACUGGGUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-276.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -295.59

Frequency: 0.0000

Diversity: 241.82

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

......((((.(((((((((.....(((((.((((((((((.((((((...........))))))(((((((((((((((((...(((.((....)))))....((((((.((((((.(((((.....(((..((.(((((((.((.(((...(((((.....((.(.(((...(((...((.((....)).)).)))....))).).)).)))))...)))))...((((((((...((((((((...(((.((((((((((((((..((.........))..)))))))..((((((...(((......((((((.((((.(((((((((((((((((((((((((.((.((((.(((((......))))).))))(((((....)))))..........)).))))))))))).............((((((..((((((.((..((.((.(((........)))....))))..))...)))))).((.....))))))))..))))))))))).).)).)))).))))))......)))...)))))).................))))))))))..))))))))..)))).))))))))))).))..)))..))))).)))))).)))....))).....)))))))))))))))))............((((.....((((((((.....))))))))))))))))))))))..)))))..(((..(((((.((((.........))))....((((((....(((((....)))))......))))))........(((((.(((.(((((.....)))))...))).)))))....)))))..))).))))((((((((((...((((((((((((...(((((..(((((((.(((........)))..)))))))....)))))..))))........))))))))...)).))))))))............))))).))))..

Thermodynamic Ensemble Prediction

....,,{{{{.(((((((((((((.(((.....((({({(((((.((((........{{|((|((......}}.))))}},})))))))))))))))))))))))))(((.((((((.(((((.....(((..((.(((((((.{(.(((...(((((.....((.{.(((...(((,,.((.({....)).)).)))....})).).}}.)))))...)))))...((((((((..{{(((((((...(((.(((((((((((({{((((.........)}}))))))))..(((((,...,||}},...{{{{{{.{{{{.(((((((((((((((((((((((((.((.,{{({(((({,,....}}}))||}}}(((((....))))),,}},,....)).))))))))))).............(((({,.(((......}))|,.,,.{{{........}}},,..,,.,..},..((((((......))))))}))))..))))))))))|,|{||,||||.}||||}{{....,,),.,))))))}.}}}}},,,...,,,,))))))))))..))))))))..)))).))))))))))).))..)))..))))).)))))).)))....((((.(((((((({.,((((((((,......,((((.((({,.....,,,|||......|{|{||,(((((({.(((((.........})))}..}}.})))).).,))),..))).)))),((((((....(((((....}))))..,.}.))))))..)))))))},,{,(({,{{(((,,...,}}},.}.)}},)}}},....,.)))))))))))))(((((((({{.,,((((((((((((...{{{{{,.{{(({((.{{{.,,....,),,..)))))}),}}}))))).,)}}}........})))))))...)).))))))))............})))).))))..