Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001351521.2
Sequence Length
769 nt
GC Content
0.4512
GCCGCCAUCUUGUAUUGGGGUUUCAUUGUUCCCGCUGGGCCGGGCGGUUUAGUGUAAUUGCCGCCGGAGGAGGAGGCGGAGUAACCUCUGGUCAGCCGAGAAACCCCACUAUCCUGUAGCCAUAACCGCUUAAACGAUUUGGGAGGUAGUGAAGGGCAGGGAGCUGGACCUGGAGGCGCCGCCGCGACAGCAGCAGCCAUGGAGGACGAGAUGCCCAAGACUCUAUACGUCGGUAACCUUUCCAGAGAUGUGACAGAAGCUCUAAUUCUGCAACUCUUUAGCCAGAUUGGACCUUGUAAAAACUGCAAAAUGAUUAUGGAUACAGCUGGAAAUGAUCCCUAUUGUUUUGUGGAGUUUCAUGAGCAUCGUCAUGCAGCUGCAGCAUUAGCUGCUAUGAAUGGACGGAAGAUAAUGGGUAAGGAAGUCAAAGUGAAUUGGGCAACAACCCCUAGCAGUCAAAAGAAAGAUACAAGCAAUCAUUUCCAUGUCUUUGUUGGUGAUCUCAGCCCAGAAAUUACAACUGAAGAUAUAAAAGCUGCUUUUGCACCAUUUGGAAGAAUAUCAGAUGCCCGAGUGGUAAAAGACAUGGCAACAGGAAAGUCUAAGGGAUAUGGCUUUGUCUCCUUUUUCAACAAAUGGGUGAGCUCAGUGAGAAGUGCAUGGAUAAUGCUUAAAGAGUAAAGAAUGGAAACACUCCGUUUUAAUUACUAAUCUUUUUUUCGUCUGCUGUUUAUUUUACUGAUGAUUAAAAUAAACCCUCACUAGAAGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-225.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -237.69
Frequency: 0.0000
Diversity: 276.74
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.......((((.((.((((((((.....(((.((((((((((((((((...........))))))(((((((((((((((((...(((.((....)))))....((((((.((((((.(((((.....(((..((.(((((((.(((.(((.....((((........))))....))).)))((((.((((((...(((....(((....((((((....(((...(((((((..((..((((((((.((..(((((.......)))))..))))))).)...))..))))).........((((((((((((...((((.((........))))))..))))))))))))((((.(((((......))))).))))(((((....)))))........))))..)))...)))))).....)))...)))....(((......))).............(((((((.......))).)))).((((((((((((.((((.((......)).)))))))).))))))))....)))))).))))..(((((((.......)))))))))))))).))..)))..))))).)))))).)))....))).....)))))))))))))))))..........)).)))))))).)))..((((.....))))......(((((((((((((.....))))))))..)))))....((((..(((((................)))))..)))).)))))).)).)).))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.......((((.((.((((((((..,,.{((.(((((((((,((((((...........))))))(((((((((((((((((...{((,((....)))))...,(({(((.((((((.(((((.....(((..((.(((((((.{{|,((|..,,|(({{...{{.,.|||}..{{||}.||}((,,.,||,||.}}}.,{{,||.}.,,.|||||{..|||||.,,({(((({,..{{,{((({{{{,(({.(((((({{{{{{||||{{...,,,,,.}||}}}}))),..,{{{,....{{({{{{{{(({,,.{(((.{(..,,,,,,||||}|,|||||||||}||}|||||{{{|{}|,,,.|||||{||||({{{{...,))))).}}},,,.,,)),})))},,))))},.,,..}||....,|..,}|||,.....}))}.,||,{,{....{{,,|||....,,.}}},}}))|{((({((({((,|((({,((....,,)}.,))))}}}.}}}}}}},....}}})))}))))||{{|||||,,,..,,}),))))))))))).))..)))..))))).)))))).)))....))).....)))))))))))))))))........,,)).)))))})),}))..((((.....))))......(((((((((((((.....))))))))..)))))..,,||||..{{|{|.,.,{,,,,,,,{|..}}}}).,)))),)))))),)).)).)))}
Back