Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001351761.2

Sequence Length

2037 nt

GC Content

0.6107

ACCCACUGUGCCAACAUGGCGGCGCCCAGGUCCUAAUUCGGGAAACGUGCACCUUGACUAAUUCGGUUUUCUGUGGCUACGAGAGCAGAGCCCGGUUUUUCGAGUGGCAGUCUCCAGGGCUGCCGAAUACAGCAGCGAUGGAGAACGGCACCGGGCCCUACGGAGAAGAACGUCCACGUGAAGUCCAGGAGACGACAGUCACCGAGGGGGCUGCCAAAAUCGCCUUUCCCAGUGCCAACGAGGUCUUUUAUAACCCGGUGCAGGAAUUCAAUCGGGACCUGACAUGUGCUGUGAUCACCGAGUUUGCUCGCAUUCAGCUUGGGGCCAAAGGAAUCCAGAUCAAGGUUCCAGGAGAGAAGGACACGCAAAAAGUGGUCGUGGACUUGUCAGAGCAAGAGGAGGAAAAGGUUGAACUGAAAGAGAGUGAAAACCUGGCCUCAGGAGACCAACCUCGCACAGCGGCCGUGGGGGAGAUCUGUGAGGAAGGCCUGCAUGUGCUGGAAGGCCUGGCAGCUUCAGGCCUACGUUCCAUUCGAUUUGCCCUAGAGGUGCCUGGGCUCAGAUCUGUGGUUGCAAACGAUGCCUCCACCCGGGCUGUGGAUCUCAUACGCCGGAAUGUCCAGCUCAAUGACGUGGCCCACCUGGUACAGCCGAGCCAAGCAGAUGCCCGGAUGCUGAUGUACCAGCACCAGAGGGUGUCGGAGAGGUUUGACGUCAUCGAUCUGGACCCCUAUGGCAGCCCAGCCACCUUCCUGGAUGCAGCUGUGCAGGCUGUGAGUGAAGGAGGGUUGCUGUGUGUGACCUGCACAGACAUGGCGGUGUUGGCGGGGAACAGCGGGGAGACGUGCUACAGCAAGUACGGGGCCAUGGCCCUCAAGAGCCGGGCCUGCCACGAGAUGGCCCUGAGAAUCGUCCUGCACAGCCUGGACCUCCGCGCCAACUGCUACCAGCGCUUCGUGGUGCCGCUGCUCAGCAUCAGCGCUGACUUCUACGUGCGUGUUUUUGUCCGUGUCUUCACCGGCCAGGCCAAGGUCAAGGCCUCAGCCAGCAAGCAGGCGCUGGUGUUCCAGUGUGUGGGCUGCGGGGCCUUCCACCUUCAGCGUCUCGGCAAAGCGUCAGGAGUCCCCAGCGGCCGGGCCAAGUUCUCUGCAGCCUGUGGUCCCCCUGUGACCCCCGAGUGUGAACACUGUGGGCAACGACACCAGCUUGGUGGCCCCAUGUGGGCAGAGCCCAUCCAUGACCUGGAUUUUGUGGGCCGUGUCCUGGAGGCUGUGAGCGCUAACCCCGGCCGCUUCCACACCUCGGAGCGGAUCCGAGGGGUCCUGAGCGUCAUCACUGAGGAGCUCCCGGACGUGCCUCUGUACUACACCCUGGACCAGCUGAGCAGCACCAUCCACUGCAACACACCAAGCCUCCUGCAGUUGCGGUCGGCCCUCCUCCACGCUGACUUCCGGGUCUCACUCUCCCACGCCUGUAAGAACGCUGUGAAGACGGAUGCCCCUGCCUCUGCCCUCUGGGACAUCAUGCGUUGCUGGGAGAAGGAAUGUCCGGUGAAACGGGAGCGACUAUCAGAGACUAGCCCAGCGUUCCGCAUUCUCAGUGUGGAGCCCAGGCUGCAGGCCAACUUCACCAUCCGGGAAGAUGCCAACCCCAGCUCCCGACAGCGAGGACUCAAGCGCUUCCAGGCUAACCCGGAGGCCAACUGGGGUCCCCGGCCUCGUGCCCGGCCAGGGGGCAAGGCGGCCGACGAAGCUAUGGAGGAGAGACGCAGGCUGCUUCAGAACAAGCGGAAGGAGCCGCCGGAAGAUGUGGCCCAGCGGGCUGCCCGGCUCAAGACAUUUCCUUGCAAGAGGUUUAAGGAGGGCACCUGUCAACGCGGGGACCAGUGCUGCUACUCCCACAGCCCCCCGACACCCAGGGUUUCUGCUGAUGCUGCCCCUGACUGUCCAGAGACCUCCAACCAGACCCCCCCUGGACCUGGGGCUGCCGCUGGGCCAGGCAUAGACUGAACCAAUAAAGAGAUGUCACGUCACCUUC

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-846.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -879.62

Frequency: 0.0000

Diversity: 511.62

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.....(((((((..(((((((((.(((((((((......(((....(((((............((((((((.(.(((((((.(.((((.(((((((((((.(((.(((..((((((..(((((........)))))..))))))..((((....(((((.(((.((....((((..(.((.....)).).))))....)).)))..)))))))))....((((..(((((..((((((((.((((((((....((((((...........))))))..((((((.((.(..(((((((....(((((((...(((..(((((((((.................))))))))).)))...))...)))))..))))))).).)).))))))........((((...(((((..(((.......)))...)))))..))))))))))))....(((((((((.(((((((((((((((((...((((((((((.(..((((((.....))))))..).)))))))....))).........((((.((......)))))).)))))))((((..(((.....)))..))))((((..((((.....))))..))))....(((((.((.(((((((.(((.....))).....((((((.....(((((((((.(((((......)))))))...))))))).....))))))))))))).)).))))))))))))))).)).((((.((((((((..((((((((.....))))))..))..)))))))).))))))))))).((((.((....)))))))))))))))))))..))))((...((((((......))))))...))...)))))))))))))))))))))).))...)))))).))))))))...)))))(((((((.((.(((((.....((((...))))......((((((.((.((((((......))))((((((...(((((.(((((.((((((.((((..((((((((((........)))))(((((......((.(((((((....))))))).))))))).(((((..(((..(((((((((((..(((..((((..((((.....((((((((((...(((.(((.(((((((..((((.......))))((((((((....)))).))))......(((((...)))))...(((...(((((..(((((((((.....)))).....)))))..)))))))))))))))))).)))...))))))))))......(((((((.....))))))).((((.((((.((........)).))))..))))((((....)))).....((((((.((((.(((.((..((..((((((((...............))))))...))..))..)).)))...))))...)))))).......)))).)))).))).)).))))..)))))..))).))))).((((.((((((((((........(((((.((......)).))))).((.((...(((((((.............(((((..(.((((((((((...)))))))))))..)))))..(((...((((.((....))))))..))).......))))))).)).)).((((((.((.((((((.((....)).))))))...)).))))))((((.(....).)))))))))))))))))))))))..)))).)))))).))))))))))((((.((((.(......).)))).))))(((((.....(((((((...)))))))))))).((((.......))))..))))))...)).))))))))......))))))).)))).)))(((........))).....((((..(((((...(.((....)).).)))))..))))..................))).....)))))))))))))))).)).....)))))))................((((...))))......

Thermodynamic Ensemble Prediction

.....(((((((..{,(((((((,(((((((((......(((....(((({....{{......((((((((.(.((((((,.{.((((.(((((((((((.(((.(((.,((((((..(((((........)))))..)))))).,((({,.,{{((((.(((.((....((((..(.{(.....))}}.))))....)).))).})))||)}}}....,(((..(((((..{(((((({.((((((({....((((((...........))))))..((((((.((.({,(((((((....(((((,,.,.(((..(((((((((....{,.......,,..)))))))))...)}}.),...)))))..))))))),)})).))))))........((((...(((((..(((.......)))...)))))..))))})))))))....{((((((((.((((((((({((((({(,({((,(((((((.{..((((((....,)|}))}....))))))).,.|}}}....|||||(|((|{(......}})))}.}))))),((((..(((.....)))..))))((((,,((((,...,)))).,))))...|{((((.((.(((((((|||{,.,,,||,...,.{(((((...,.(((((((((.(((((......)))))))...))))))).,...)))))}})))))).)).))))})))))))))).)).((((.((((((((..,(((((((.....))))))..,,..)))))))).))))))))))}.({((.((....))))))}))))))})))))..)))|((...((((((......)))))),,,|}...))))))})))))))))))))),.},...)))))).)))))))),,.))))}{{{{(((,{{,({(((,,...{{{{..((((((,...,(((((,,,,..,|{||}},}}})))),,.,,,...(((((.(((((.((((((.((((..((((({((((..,,....})))|{.{{((((...((.(((((((....))))))).)},))))}(((((..(((..(({((((((((,.(({..((((..((((.....((((((((((...(((.(((.(((((((..((((,....}.))))((({((((....)))).})))......(((({...})))).,,({{...(((((..(((((((((.....)))).....)))))..)))))))))))))))))).)))...))))))))))......(((((((.....)))))))}{(((,|((|,{{....,,}})).)))),,)))}({((,,,,}}}}.....((((((.((((,(((.((..((..{{((((((...............}}}})},),)),.))..)}.))}...))))...)))))),....,|)}||.}))).})}.}}||))),,,}}))..))).))))).||{|.||((({{{||}.,,}},.}|||||}||||||,.||,..,}|||,,,...{({((((.............(((((..(.((((((((({...}))))))))))..)))))..(((.{.((((.((....)))))).})))....,,.})))))).))})).{(((({.{{.((((((.((....}),))))))...)).))))))(((({(....,.}}))))}))))))}}))))))))..)))).)))))).)))),)))))((((.((((.{......).)))).))))(((((.....(((((((...)))))))))))).,,,{.....,{||||...|||||,|,}||}||||},,|||...})))))}.}}}}.}}}|,,..,,,,.,)))}}}}}|{{{..(((((...{.((....)).}.)))))..))))..,,},}}}}......,..}),....)))))))))))})))),)),,,,.)))))))..,,..........,.({{{...,)))......