Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001352129.2

Sequence Length

783 nt

GC Content

0.3525

CAAAAGAAAGAGGUAAGCGUGGCCUGACCUAGCCACCCACCAACAGGAAUAAUGGCUGAAAAAGCGGGGUCUACAUUUUCACACCUUCUGGUUCCUAUUCUUCUCCUGAUUGGCUGGAUUGUGGGCUGCAUCAUAAUGAUUUAUGUUGUCUUCUCUUAGAAAGGCAAGAAGAUAUCAGAUUGACAUCAUUUAGAAGAAUUAAGAAAACUAUGAACAUGACUGAUUAUUAAAUGUCUCAUGUUAAACAAUGCAAUGUUUGACAUCACUUUACAAACUUGGAUCAUAAACUGGCACUUUGGUAUGCAUAAGAAUUUCUUCAGGACAAUAAGAAAUUAUGAGUGAAUUUCUCUAUAUUCUGAGUGAGAAAAAUGUUUAGCUGUGAUGAAAAAUGCAUGUCAUUAAAAAAAGUUUGAUAAAUUUAAUCACAUUACAAAAAAUUAUCCCCCCUUCCCUCUGGAAAAAACUAUAGAGAAAGUGGGCUGAGGCUGUGCAAGGUGGCUCAUGCCUGUAAUCCCAGCACUUUGUGAGGAUCCUUUGAGCCCAGAAAUUGGAGACCUUCCUAGGCGACAGAGAGAGACCCCAUCUCUACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAAUGGGCUAGAGAUAAAAACAGACAAUUCAGAGAACAUAUAAUGUAAAAGUACACUUACUUAAUCUCUUGUUCACAAAAAGAGAAAUGUAAUUAAAACUACACUGAGGAAUUGUUGCUCACUUAUCAGAUGGGAAAAAAAUAAAGAUGUUUGACAACAUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-158.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -174.29

Frequency: 0.0000

Diversity: 192.00

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

..........((.((((((((((........)))))((((((((((((..(((((..(((..((.(((...............))).))..))))))))....))))).)))).)))(((((((......)))))))......((.(((((((((((....)))..)))))))).)).(((....((((((((((..((..(((((...((((((((.............)))).))))((((((((......)))))))).((((((......................(((........))).....((((((((.........))))))))..)))))).)))))..)).))))))))))....)))))))).))(((((...((((...(((((............))))).)))).))))).....................((((((((((...............((((((((..((((((.((......)).)).))))...((((..(((...)))..)))).((((.((((((.....((..(.(((....))))..)).(((((.......)))))......................................)))))))))).........((((((((.....((((...))))..(((((....)))))..((((((.........))))))..((((........)))).....)))))))))))))))).))))).)))))..........(((((....))))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

........{.(((((.(.((.((((..{.(((((..((((((((((((..(((((..(((..((.((({{..........,..))).))..)))))))}....))))).)))).)))(((((((......))))))}{{{,,.{,{((((((((,,..,.,)))}}),)}})})|}|,,{{,,..((((((((((..{{..(((({...,,{{{((({,..,,,......}}))}))}|((((((((......))))))))}{{{{{{..,,..{{||...{{,...,{,{,,...,},},}}}.,,,,{(((((((.,......,})))))))..}})))}.)))))..}}.))))))))))....,,}}},,,.,{(((((,..{{{{...(((((............))))).,}}}.}}}})),,,,..........,,(({{((..(((((,.......,.})))).}}).)))..,|))))).},.)))).)).).))))).}..(((((.......(((((.,,.((((.((((((....,((..(.(((....))))..))|(((((,......)))))......................................)))))))))).......,.((((((((.....((({...})))..(((((....)))))..((((((.........))))))..{(((........)))},}...)))))))),)))))........)))))...........(((({....})))).