Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001352912.1
Sequence Length
4270 nt
GC Content
0.4037
CUCAUGUGGGAGUUUGUCUUUUUUUUUUUAAACUAAAAUGGAGGCUGGUUUCUUGCCUUAAGGAGCCCAUUGCCUUUCCCGCUGAAGUCUAGAUGUUGACAUGUAAUAAAGCGGGCAGCAGGAUGGUGGUGGAUGCGGCCAACUCCAAUGGGCCUUUCCAGCCCGUGGUCCUUCUCCAUAUUCGAGAUGUUCCUCCUGCUGAUCAAGAGAAGCUUUUUAUCCAGAAGUUACGUCAGUGUUGCGUCCUCUUUGACUUUGUUUCUGAUCCACUAAGUGACCUAAAGUGGAAGGAAGUAAAACGAGCUGCUUUAAGUGAAAUGGUAGAAUAUAUCACCCAUAAUCGGAAUGUGAUCACAGAGCCUAUUUACCCAGAAGUAGUCCAUAUGUUUGCAGUUAACAUGUUUCGAACAUUACCACCUUCCUCCAAUCCUACGGGAGCGGAAUUUGACCCGGAGGAAGAUGAACCAACGUUAGAAGCAGCCUGGCCUCAUCUACAGCUUGUUUAUGAAUUUUUCUUAAGAUUUUUAGAGUCUCCAGAUUUCCAACCUAAUAUAGCGAAGAAAUAUAUUGAUCAGAAGUUUGUAUUGCAGCUUUUAGAGCUCUUUGACAGUGAAGAUCCUCGGGAGAGAGAUUUUCUUAAAACCACCCUUCACAGAAUCUAUGGGAAAUUCCUAGGCUUGAGAGCUUACAUCAGAAAACAGAUAAAUAAUAUAUUUUAUAGGUUUAUUUAUGAAACAGAGCAUCAUAAUGGCAUAGCAGAGUUACUGGAAAUAUUGGGAAGUAUAAUUAAUGGAUUUGCCUUACCACUAAAAGAAGAGCACAAGAUUUUCUUAUUGAAGGUGUUACUACCUUUGCACAAAGUGAAAUCUCUGAGUGUCUACCAUCCCCAGCUGGCAUACUGUGUAGUGCAGUUUUUAGAAAAGGACAGCACCCUCACGGAACCAGUGGUGAUGGCACUUCUCAAAUACUGGCCAAAGACUCACAGUCCAAAAGAAGUAAUGUUCUUAAACGAAUUAGAAGAGAUUUUAGAUGUCAUUGAACCAUCAGAAUUUGUGAAGAUCAUGGAACCCCUCUUCCGGCAGUUGGCCAAAUGUGUCUCCAGCCCACACUUCCAGGUGGCAGAGCGAGCUCUCUAUUACUGGAAUAAUGAAUACAUCAUGAGUUUAAUCAGUGACAACGCAGCGAAGAUUCUGCCCAUCAUGUUUCCUUCCUUGUACCGCAACUCAAAGACCCAUUGGAACAAGACAAUACAUGGCUUGAUAUACAACGCCCUGAAGCUCUUCAUGGAGAUGAACCAAAAGCUAUUUGAUGACUGUACACAACAGUUCAAAGCAGAGAAACUAAAAGAGAAGCUAAAAAUGAAAGAACGGGAAGAAGCAUGGGUUAAAAUAGAAAAUCUAGCCAAAGCCAAUCCCCAGGCACAGAAAGAUCCGAAGAAGGACCGUCCUCUUGCACGCCGCAAGUCCGAGCUGCCUCAGGACCCCCACACCAAGAAAGCCUUGGAAGCUCACUGCAGGGCCGAUGAGCUGGCCUCCCAGGACGGCCGCUAGCCUCCGGGGCGCCGCGUCGGGGCCGGGCCCGCCAGUUCUUUUCCGGAUUCUGUAGAAAAUACAUACUUCCUGUGCCAUACCAAUCAGUUACACUCAAAGCUUUCUUGGACCCCGUUCCGUAGGCAAUAACGUGCGUCCGCCUCAGCGCGAGAUUAGGAGUUCAAACAAUGGUGACUUCCCAGAGCCCGCUGGCAGAGCCGCGGGUUGACGACGGUGUCCUCGCAGUGUCGCCGCCACCCCAGCGUAGUCCAAGUCAGACUAUUUCACAAAGUCAGAGCGAUAGGAAAGCACCCUGCCCUUCAUCUUCAUGUUCUCCCAAAUGGAACUUAGGAUCUUUUAACAUAGGUGGUUCUGUGAUAACAUCAGUGUUUUCCAAAUCAAAGGAACGCUUUAAAAAAUAGGACCUAUUUUUUAAGACUUUACAGCCUUUGAAAUGGUUUCCACGUGAUUGUUACGCCAGCAGUUCUCGUUUUGUUUGUUUUUCAAUCUCAGUGAAAUGGCUCUUUGCUUUCGAGUUCUCACGCAACGUACUGGGCAAAUGACAAUCCUCAGCCGCUGGUAUUUUCUAAGGGGUCUCUUCACUUUGAUGAGUGACAUGAACACCGUGUCUCCUUCUCUUGUGUGUACCUAAAGCCAUAUUUCCAAGUCUGUGGUACUCCAGGAUUCCAGGAGUAAGCCUGUAGAAGAGAUUUAUUUUAAAAGAGAUUGCUCUGAAAUUUAUCUUAAAAGAGCUUGCUCUGUCUACCUUGACAGAAAUUGGAGUUUUAAAAUUAUGUGUUAAUAUUUUUAUUUGCAGAUUUCGUUUCCGUCAACUUAAACAUUGUUGCCCUUCAACAAGGCUCUUGAAUUAAUAAAAUUAUAGUCUCUAAGAAUUCCACAUUUUAUGGAAAGUUAGAGCAAAAUCAUUUUGAGUUAAGCCAGUUCUUAGCCUAAUGCAAACUGCAGCGCCUUUAAGCAUAAAGUAACACAACAGCAUUGCACGGGGCCGGCACUGCCGCUGCCUUCACUGAAGGCUGCAGUGCUGUUCUGAGAGCUUGGAGGAGGCACCAGCGAGGAUGACGUUUAGUGGAGCUCUUUCUGUUGAAAAGAGCUCACGUUAUCAACACCUUGUAAGGAAAAUACAGUGUCUGAGUUUUCAUCGGUCUUCACAUGCUGCUAUAUAUUCCACAGAGUUCCUUGCAUGUACUGAGCUUUUGUUUUAGAUGGAAUAGCACAAGGAGAAAAAUCUUUAAACUUAGUGCUUUGUCUAUUCUUUAUUUCUCUCAGGGUGGCCAGUAUUUUGACUUAUUUAUCCUGCUUGAAAGCUACUUGAGAUGUGUACUGCUAUUCUAAACACGUGAUCUAGUUUCUUUCAUCUCUGGCAUAAGAUUAUAUAACUUAAUGUUAAGUGUCUUGAGGCAUAAAAGACAAAAUGUGGCUUAUUUUAGGAUCUGUUUUUUCAUCGAGGUCUCGGGUAUCCUUUCAAAGAUAGUGAGAAGCAGACACUGCUCCUUGUGCAGCUCUGGUACCUCCUGCCCACUGCUGUCACUUCAAGCCACUGGCAAUGCUUCUGUCCUCGUGUCUUGGAGGAAAAUCACCUGGGGGGAGGGGACUUCUUGUGGUAAGAGCAAGUGCAGGUAUGAAAUGCGAAGAUUGCCCCAGCUAAAAGUGGACAAGUCCGCUUUGUGAGAUGAAUACUUCCUGAGAAACUUGACAAGUAUCUCUCCAUUUUACCAUUAUGAAAACUAUCAUUAAAAAAAACAGUUUAGAUGCCUUCUCCUUUUGAGGGAAAAAGGGUGCUUUUUAUUGUAUAAAGCAGCGUCUUAUGUAUUUUGAUAUACCAUUGUUUGAACUUCCGUCUUUAGCUGAUAGAUUCUCAAAUAUCCUUGAUUUUGGAUGUUCAGUAUGUUUGUGAGAGAGGUUUCUGGGAAGACUCUCUUUUUGCCCUCGGGAAAAAGCAAAAUAUCAAUGUUUGGGUGACUGUGUAAAGCUCAGUGUGUAAGAACAUCUUUUUGUCUAGGUUUUCUUUCUGCUCUUUAUUGAAGACAAACACUCACCAAAAAGAAAAAUAAAAGUUUUCAGAGAAACUAAUUUUCUUUGGCAAGAGUAUUACUUAAUAUUUUGGCCUCCUAAAGUUUCCCUAGUUAGUACUCGGACUCCUGUGCUAAUUGUCAGCUUACAUAUCAUUGUAUAGAGACUGUUUAUUCUGUACCAAACUGAUUUCAAAAGUACUACAUUGAAAAUAAACCGGUGACUGUUUUUCUUCAUAAAGUUCUGCGUUUGGCAUCUUCACUCUUUCCAAAAUGUAUCUGUACAUCAGAAAUGUCACUAUUCCAAGUGUCUUUUUAGUGUGGCUUUAGUAUGGCUUCCUUUUAAUAUUGUACAUACAUUGUAUCUUUGUUUUAUGGUAAUAAGUAAUAAAAAUGUAGACUUCAUAUUUUGUACAAAAUGUCCUAUGUACAGAAUAAAAAAGUUCAUAGAAACAGCAAAUAUAGGUAAGUGGCACAAUUAUUUUUCUUUAGAAAAUAUCUGUAACUUUAUGCAUUAGUGAAAUGUUAAGUACCGACAUAUUUUUUAACAUUUUGUAAUUCAAAACUUUUUGUUUUGACAUUGUUUAUGAAGAGAAACUUCAUACACUUGCCAUUUAAUAUGCUCUUUUAUCUAAUUUUCAAAAACUCUAAAAAACGGUGUAUCAUAUGGACUAAAUAAAGAACAUGUGAAUUUUAUUGCUCAUCAUGAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1167.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1250.51
Frequency: 0.0000
Diversity: 755.47
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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