Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001353027.2

Sequence Length

2818 nt

GC Content

0.4358

ACGGUUCCAAACAGCCGUGGCCCGCGGUGUCUGGCGCUCGGUGGGUGUGGUUGCCCCUAGUUUGAGGCCUGCCCGAUUACCCGCAAGACUUGGGCAGCCCCGGGCGCCGCUCCGACCACGACAGGGAAAGGAACCUUAAUCUCAUCUUUAAAAUAAGGAGAAUUACUGAGUGACCUGAAGGACCCUUUUCAGCUGGAAAGUCUGAACUGACCAACACUGGAUGAAUUUGACCAUUUCUUAGGAGACUGGAAUGUUAAGUUUCUAUAAAUGAAUGAACCAGUUCUCUCUUGUUUGGAGCAAUGCUGAAAUUCCAAGAGGCAGCUAAGUGUGUGAGUGGAUCAACAGCCAUUUCCACUUAUCCAAAGACCUUGAUUGCAAGAAGAUACGUGCUUCAACAAAAACUUGGCAGUGGAAGUUUUGGAACUGUCUAUCUGGUUUCAGACAAGAAAGCCAAACGAGGAGAGGAAUUAAAGGUACUUAAGGAAAUAUCUGUUGGAGAACUAAAUCCAAAUGAAACUGUACAGGCCAAUUUGGAAGCCCAACUCCUCUCCAAGCUGGACCACCCAGCCAUUGUCAAGUUCCAUGCAAGUUUUGUGGAGCAAGAUAAUUUCUGCAUUAUCACGGAGUACUGUGAGGGCCGAGAUCUGGACGAUAAAAUUCAGGAAUAUAAACAAGCUGGAAAAAUCUUUCCAGAAAAUCAAAUAAUAGAAUGGUUUAUCCAGCUGCUGCUGGGAGUUGACUACAUGCAUGAGAGGAGGAUACUUCAUCGAGACUUAAAGUCAAAGAAUGUAUUUCUGAAAAAUAAUCUCCUUAAAAUUGGAGAUUUUGGAGUUUCUCGACUUCUAAUGGGAUCCUGUGACCUGGCCACAACUUUAACUGGAACUCCCCAUUAUAUGAGUCCUGAGGCUCUGAAACACCAAGGCUAUGACACAAAGUCGGACAUCUGGUCACUGGCAUGCAUUUUGUAUGAGAUGUGCUGCAUGAAUCAUGCAUUCGCUGGCUCCAAUUUCUUAUCCAUUGUUUUAAAAAUUGUUGAAGGUGACACACCUUCUCUCCCUGAGAGAUAUCCAAAAGAACUAAAUGCCAUCAUGGAAAGCAUGUUGAACAAGAAUCCUUCAUUAAGACCAUCUGCUAUCGAAAUUUUAAAAAUCCCUUACCUUGAUGAGCAGCUACAGAACCUAAUGUGUAGAUAUUCAGAAAUGACUCUGGAAGACAAAAAUUUGGAUUGUCAGAAGGAGGCUGCUCAUAUAAUUAAUGCCAUGCAAAAAAGGAUCCACCUGCAGACUCUGAGGGCACUGUCAGAAGUACAGAAAAUGACGCCAAGAGAAAGGAUGCGGCUGAGGAAGCUCCAGGCGGCUGAUGAGAAAGCCAGGAAGCUGAAAAAGAUUGUGGAAGAAAAAUAUGAAGAAAAUAGCAAACGAAUGCAAGAAUUGAGAUCUCGGAACUUUCAGCAGCUGAGUGUUGAUGUACUCCAUGAAUCUGAUGAACCAACUUUAGAGAACCUGCCUGAGUCUCAGCCUAUUCCUUCCAUGGACCUCCACGAACUUGAAUCAAUUGUAGAGGAUGCCACAUCUGACCUUGGAUACCAUGAGAUCCCAGAAGACCCACUUGUGGCUGAAGAGUACUACGCUGAUGCAUUUGAUUCCUAUUGUGAAGAGAGUGAUGAGGAGGAAGAAGAAAUAGCGUUAGAAAGACCAGAGAAAGAAAUCAGGAAUGAGGGAUCCCAGCCUGCUUACAGAACAAACCAACAGGACAGUGAUAUCGAAGCGUUGGCCAGGUGUUUGGAAAAUGUCCUGGGUUGCACUUCUCUAGACACAAAGACCAUCACCACCAUGGCUGAAGACAUGUCCCCAGGACCACCAAUUUUCAACAGUGUGAUGGCCAGGACCAAGAUGAAACGCAUGAGGGAAUCAGCCAUGCAGAAGCUGGGGACAGAAGUAUUUGAAGAGGUCUAUAAUUACCUCAAGAGAGCAAGGCAUCAGAAUGCUAGCGAAGCAGAGAUCCGCGAGUGUUUGGAAAAAGUGGUGCCUCAAGCCAGCGACUGUUUUGAAGUGGACCAGCUCCUGUACUUUGAAGAGCAGUUGCUGAUCACGAUGGGAAAAGAACCUACUCUCCAGAACCAUCUCUAGGCAACUAUCAAAAAGAAGCAGAAGUUCAAGUGGACAAAUUUAUGUGAAAAUUCAUUUAACAUAUAAGCUGAACUCUAUUAUGGGGAAUGGAUACAAAAGCAGAGCUCCCAUCUUGACUUUCAAUUCCUCAUCAGAAGUACUGGCUUCUUUAGAGAGUAGUAAGCAUGGCUGCCUAUGCUUGGAGUCAUAAGUGUUAUUUGGACUAUACCCUGAGAUAAGCUUAUAGAUCAAGUUUGGCUCCCUUGAAAAGCAUUUCUCUCAUGUGCGCCCUCAGGGCUUCCAGCAGGAUUGAGUCACCCUGACGAUGACCGGGGAGAAGCCGUGUGCUCUUCAUUAUUUUCAGCUGGAGGACAGAGCUCAGUGCCUGACUGCCUAGGGUCUCAUGGACUGUAGGCAGCCUGCCAGUGAAGGUCACUGGACUCUAGCCUACAACAUGCUGAGCUACAGCCCAGAAGCCAGACAUGCCUGUCUUAGCUGACCUGUUUUUGGUCCACUUUUGCCCUUCCAUGACUAAUAAGGAAGAUAUGUGUGUAUUUCAUACACACACAAGGACCUGGAUUAAAAAUCCAAAAAGUGAUUCUCUUCUAUGAUUUAUUUCAAACUCAUCCAUAGAUAAUUCAAGAUUUGUAUUCAAAAUAAACAUAGUUUUCACAGUUACAAAAUAAAUCACCUAUUUUAUCUUUUCCUUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-811.40 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -864.66

Frequency: 0.0000

Diversity: 711.86

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

..(((.(((.(((.(((((...)))))))).))).))).(((.((.(((((.((((.......(.(((.(((((((((........)).)))))))))).)))))))))).)).))).....((((((((((................(((((((.((.((.(((.(..((((((((((((....))))))).(((..(((....)))..)))....(((((((.(((((.....((.(((((((.(((..(((..((((((..................(((((((((((((((.....((((((((..(((..((((((.((((((.(.((((((........)))))))))))))(((((.(((.((.(((((..((((.......))))..(((....)))))))).)).)))))))).))))))...))))))))).))......)))))).))))))))).....(((((.((....)).))))).(((((........)))))..))))))..)))..)))..((((((((((..((((((((...(((((.....)))))....(((((.(((((.(((.(((((((...))))))).(((((.((....((((((....))))))..)).)))))(((((........)))))...........(((((((.(((((.(((.................))).))))).)))))))..)))))))).))))).........)))))))).....((((((..((((...))))..((((.....))))........((((((........))))))(((((((((((..(((((.(((((((.(((.((....((....))......)).)))....)))))))...)))))..)))))))))))...((..((((((.((((.....((((((((((((((...((((((((((((((((((..(((.((((((...))))))..)))((((......(((((......((((((..........(((((((...))))))).........)))))).....)))))......)))).((((.....)))).......((..((((((...........((((((((((....................))))).)))))(((((.(......).)))))...((((((......)))))).(((((.........))))).))))))..)).)))))))))..)))).)))))......((((((..(.(((..((((...(((...((((.............)))))))...)))..)..)))(((((((...((((.((((((((........))))(((...(((((..((((((((((....................(((......)))(((..((((....))))..)))((((((......)))))).....))))).)))))...........)))))....))))))))))))))))))..((((((((((..((((((((((....(((((((.((((..((..((((((..((..(((((((........))))...)))...))..))))))..............))..)))).)))))))...)))))..))).)).))).))))))).....................((.((........)).))...)..)))))).....(((((.....((...((....))...)).......))))).))))))))))))))((((((((((((((..(((..(((.(((.........((((.......))))))).)))..))).)))))))).....))))))....)))).)))))).)).....)))))).((((((((((((.(((((((((.....(((....)))...........(((((........)))))......((.(((((((((((((((.(((...........))).)))))))........))))))))...))(((((((((((((((((((((.....)))...)))))..)))))))))))))...................((((((((.(((....))).(((....)))....(((((((((((.(((((.((........(((.((((....)))).))).......))))))))))...(((((((((.((.....(((..(......)..))).....)).)))))))))(((.....))))))))))).))))))))...)))))))))...(((((((((((((........((((((.(((((..((......))..))))).)))))).)))))))......))))))))))))))))))........)))))))))).......(((((((((((........)))).....((.(((.((((..(((........(((((((..(((.((.....))))).(((((((.(((((...))))).)))))))....(((((((...))))))).))))))).......)))..))))))).)).(((.(((.(((((....)))))..)))...))).....(((((.........(((((...........)))))...(((((((((...)))))))))...)))))((((((...))))))....)))))))))))))).))......))))).)))))))..((....))....((((....))))..................)))))..).))).)).))))))))))))))))))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

..(((.(((.(({,(((((...)))))))).))).))}.(((.((.(((({{((((.......{.((,{(((((((,,........},.)))))))))),}))))))))).)).))).....{(((((((((....,,.........,||,..{||(({(({{((,{.,((({{(((((({....,}|||||{(((..{((|,,.,,||,}|..,,,((({{((.(((((..,,,((.{((((({,{{{..{{{..|||{{{.............,{{|{(((((((((((((((.....((((((((..(({..((((((.((((((.{.((((((........))))))}))))))(((((((((.((.(((((.,({{{.....,.}}}}..|,....,))}))))).)).)))))))).))))))...))))))))).))......)))))))))))))))).,...,|||,.,,..,,,..,,}}}.(((((........))))}..))}}}}..}||,,|||..{(((((((((.,(((({{{{...(((((.....))))).,{{(((,,{(((((,(,,.,,,,|||}}})),,)))||{{{{.{{....{{{{||,,,.}}}|||,{||.}}}||({{{,........|||||{{,{,,,....,,((((({(,,,,,|||}}}.,,,{{,.......,,,,))))).||||||,..,)))))},.|||||{....,,.,||}}||||....}}||.}},.|{|,...)))),,,|,,,}}}}))))},,....,((((((........))))))|((((((((((..(((((.((((((({(((.((,...,{....}}......)).)))..},)))))))...)))))..))))))))))}...,,..((({,({((,{...}}||{,(((((((((.(((((,,{(((.((((,(((({.{{{.((((((...))))))..|}|(((({....{(((.(((,,(((((({,.....{((((({(((((...)))))||((((...)))))}..{{{{...,,.......,,,..,.}))}{((((.((((.....(.{(((((((({.......{((,(((,((..{{{{{.......,.,,..,|||{((((((((((((.{......).))}},...{((({{......|)})}}.(((((.........))))).,,.}},}}))))))))..,.....|{{..,)),....,((.....}|}{{{..((((,,.({{...((({....,........))))}}),,,}),,,),,)}}(((((((...((({{((((((((........)))){((...((({,..{({(((((({....................(((......)))......{,{..,,}}||.,|..((((((......)))))).,,.,))))},}})))...........}))))....})})))))))))))))))..{(((((((((.{,{((((((((....(((((((.((((..((..((((((,,((..((,((((........)))).}},}}...}}..))))))..............))..)))).)))))))...)))))..))).}).))).)))))))...}}}))..)).})}..,,,((.((........)).))})))))))))}})))).))))}....,,},,..|,,,))))))))))))..)))}.,.,))))))|||}|||({,,,,((((((((..(((..(((.{{{.......,.{{{(.......,)))})),)))..))).))))))))..,,.}}))))},}})}))}}}})))}))})),,))))...((((((((((((.(((((((((.....(((((({|||,....|||,..(((((........)))))......({.(((((((((((((((.(((...........))).)))))))........))))))))...}}(((((((((((((((((((,{.....,,}}.}))))),.})))))))))))).......,(({.......))|||})))}}}..,..|||||{|,,.,||.,,..((((((((((,{((((,,((........{((,((({....}}}).)}},,,,,..))))))))))...(((((((((.((.....(((,{({.......}))),.}}))).)))))))))(((.....))))))))))).))}))),)}..)))))))))...(((((((((((((.,......((((((.(((((..((......))..))))).}))))}.)))))))......)))))))))))))))))).)))}},,)))))))))},,,|||||,{({.(((((........))))).|,.{|..{||||{{|,||,.....,,,{{{||||,,||{.||||||||}}}|.(((((((.(((((...))))).))))))).,.,||||||,.},)))}))}.||}}|||.......,||{||,}}}}|,},.|||.{||,{{{{|....)))))..)))}|||,,.....|||{(,,,,.....(((((.,.........)))))...(((((((((...)))))))))...}}}}}((((({...))))))...})))}}}}))))}}},|}.,{,,,}}}}}.}}}}}}}..{{....}}..,,{{(({.....,,.,,,||...)}}},....}})}},}},||},,,...}}}))},)))))))))).