Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001353320.2
Sequence Length
3477 nt
GC Content
0.4305
AGUCAGCUGACCCUGCAGUGUGCAGGCGAGCGCAGGGAGUACGCCAUGUCCUGAGAAGGGGCGAUUCUCAGGCUCUGGCAGUUACAGCUUCUCCUCACCCUGCCGAGCAACCAGGCCACGGGGCUCCGUGCAUCGCCACCUAGAGUGUUACCCUCUUCCUUGUUCACAGAGGUUCUCCGCAGUGUGUGAGAAAGAGGCCCUCUCUCAGGCAAGAAGAAUAAAUGUCUCUGGUGGAACUUUUGCUCUGGUGGAACUGCUUUUCUAGAACUGGUGUUGCAGCAUCCCUGGAAGUGUCAGAGAGCCCUGGGAGUAUCCAGGUGGCCCGGGGUCAGCCAGCAGUCCUGCCCUGCACUUUCACUACCAGCGCUGCCCUCAUUAACCUCAAUGUCAUUUGGAUGGUCACUCCUCUCUCCAAUGCCAACCAACCUGAACAGGUCAUCCUGUAUCAGGGUGGACAGAUGUUUGAUGGUGCCCCCCGGUUCCACGGUAGGGUAGGAUUUACAGGCACCAUGCCAGCUACCAAUGUCUCUAUCUUCAUUAAUAACACUCAGUUAUCAGACACUGGCACCUACCAGUGCCUGGUCAACAACCUUCCAGACAUAGGGGGCAGGAACAUUGGGGUCACCGGUCUCACAGUGUUAGUUCCCCCUUCUGCCCCACACUGCCAAAUCCAAGGAUCCCAGGAUAUUGGCAGCGAUGUCAUCCUGCUCUGUAGCUCAGAGGAAGGCAUUCCUCGACCAACUUACCUUUGGGAGAAGUUAGACAAUACCCUCAAACUACCUCCAACAGCUACUCAGGACCAGGUCCAGGGAACAGUCACCAUCCGGAACAUCAGUGCCCUGUCUUCAGGUUUGUACCAGUGCGUGGCUUCUAAUGCUAUUGGAACCAGCACCUGUCUUCUGGAUCUCCAGGUUAUUUCACCCCAGCCCAGGAACAUUGGACUAAUAGCUGGAGCCAUUGGCACUGGUGCAGUUAUUAUCAUUUUUUGCAUUGCACUAAUUUUAGGGGCAUUCUUUUACUGGAGAAGCAAAAAUAAAGAGGAGGAAGAAGAAGAAAUUCCUAAUGAAAUAAGAGAGGAUGAUCUUCCACCCAAGUGUUCUUCUGCCAAAGCAUUUCACACUGAGAUUUCCUCCUCGGACAACAACACACUAACCUCUUCCAAUGCCUACAACAGUCGAUACUGGAGCAACAAUCCAAAAGUUCAUAGAAACACAGAGUCAGUCAGCCACUUCAGUGACUUGGGCCAAUCUUUCUCUUUCCACUCAGGCAAUGCCAACAUACCAUCCAUUUAUGCUAAUGGGACCCAUCUGGUCCCGGGUCAACAUAAGACUCUGGUAGUGACAGCCAACAGAGGGUCAUCACCACAGGUGAUGUCCAGGAGCAAUGGCUCAGUCAGUAGGAAGCCUCGGCCUCCACACACUCAUUCCUACACCAUCAGCCACGCAACACUGGAACGAAUUGGUGCAGUACCUGUCAUGGUACCAGCCCAGAGUCGGGCCGGGUCCUUGGUAUAGGACAUGAGGAAAUGUUGUGUUCAGAAAUGAAUAAAUGGAAUGCCCUCAUACAAGGGGGAGGGUGGGGUGGGGAGUGCUGGGAAAGAAACACUUCCUUAUAAUUAUAUUAGUAAAAUGCACAAAGAAGAAGGCAGUGCUGUUACUUGGCCACUAAGAUGUGUAAAAUGGACUGAAAUGCUCCAUCAUGAAGACUUGCUUCCCCACCAAAGAUGUCCUGGGAUUCUGCUGGAUCUCAAAGAUGUGCCAAGCCAAGGAAAAAGAUACAAGAGCAGAAUAGUACUUAAAAUCCAAACUGCCGCCCAGAUGGGCUUGUUCUUCAUGCCUAACUUAAUAAUUUUUAAGAGAUUAAAGUGCCAGAUGGAGUUUAAAUAUUGAAAUUAUUUUAAAAGGUAGGUGUCUUUAAGAAAAUAACAAGCAACCCUGUGAUAUGUUCCGUCUCUCCCAAUUCCCUCGUUAUAUAGAGGGCUUAAUGGUAUAAAUGGUUAAUAUUGGUCCCAACAGGGCUGACUCUUCUAUCAUAUAAUCAAAACUUUUUACAUGAGCAAAAUUCAGUAAGAAAUGGGGGAAGACAAAGGAAACGUCUUUGAGAAGCCCCUUCAUAUUUAUUUAUUUAUCUCUUCCUGAACCAUGAAUUUCAUAUGUGGAAUAUUGCUAUAUUGACAGAUUCUUGCCUGUCUGUGUUAUUCUAGGAUCUGUUACAGGUCCAUGGCAAUUACUGUUUAUUUUUUCCUGGAAAAAUAUUUUUUUAUAAAAGGCUUUUUUUUUUUUUUAAAUACAUGAGAGGCAUUGGGCUAAGAAAGAAAAGACUGUUGUAUAAUACCUUGUUCAAUGGUUGUAUUUAGUGAGCUCAUAGAGGUCCAUCAUAUCAUGACCGAGCUAGGUUGUGUGGGCAGGAAGGUAGGGCUAAGGGGUUGUAGCCUUGCUGGGCAGCCUCUCAGAGCAAGGUUGUUCAGAUCUCCCUUGCUAUUACAGUAGGUUACUAUUAAUGAGGGCAGCACCUGAUGCCUUUUGUACUGAGGUAUGUAACUUUCUCCUUAUUUGACAAGUAGAAGUUAACUUACUUGUCAGGGAGGGCAGACGUUUUUUUGUUCUGUUUCGUUUUUCAAAAUAAUGCUUUUUGCAAAAGAGGUAAGACUGAGACUAAAGGUGUUAUCUUCUGGUGUGCUCCUGGAAGUGUCUACCCUACAUUUGUGUCAGCUCAGGGUUGCAGUGUUGCCCAGAUGCAUUUUACAUCACUGUAAAGAGAUUACUUUUGUGGUUACUACCUGGCUUGGCUGGCCUUGCGGUUCACCAGAUUAAUUUACAAACUCCCCCACUUUAUUUUGUGCUAUGUAGAUCUGGCCAUACUUGCAUUAGUGACUGUCUUGCCUUAACCACACUUAAGCAACCCACAAAUUUCUUCUCAGAUUUGUUUCCUAGAUUACUUAUGAUACUCAUCCCAUGUCUCAAUAAGAGUGUCUUUUCUUUCUGGAUGUGUUCUCUUACUCCCUCUUACCACCAUACUUUUUGCUCUCUUCUCCUGCAAGCGUAGUCUUCACAGGGAGUGGCUUCCUGACAUUUUUUUCAGUUAUGUGAAUGAAUGGAAACCAACAGCUGCUGCAAACACUGUUUUUCCAAGAAGGCUACACUCAGAACCUAACCAUUGCCAACCAUUUCAGUAUUGAUAAAAAGCUGAAUUUACUUUAGCAUUACUUAUUUUUUUUUCCAUUUGAUGGUUCUUACUUUGUAAAAAUUUAAAUAAAUGAAUGUCUAUACUUUUUAUAAAGAAAAGUGAAAAUACCAUGACACUGAAAAGAUGAUGCUAUCAGAUGCUGUUUAGAAAGCAUUUAUCUUGCAUUUCUUUAUUCUUUCUAAUUAUCUAAAAUUCAAUAAAAUUUUAUUCAUAUAAAAUAAGUUGUCAUUAAUUAUCAAUACUAACGAGUAUGUCAUUUUAAAACUUAGUAUUCUCUUUAAUGUUACAAGA

Secondary Structure

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Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1011.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1076.00
Frequency: 0.0000
Diversity: 952.40
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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