Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001353423.2
Sequence Length
748 nt
GC Content
0.6778
ACCCCGCGCGCGCCUCUCUGUCGUGGCGCGGCUUCCCGCGGUCUUCUCUGCAAAUGGGCUCCGUGGCCUAGCGCCCCCGUCCCCGCCACCCGUGAUCGUGCGCCGAGGCCCGCGAGGGGUCGCCGCCCAGAUCCCACCAGCCAGCAAGCUAAAGCAUGGCGGCCAUCCCCUCCAGCGGCUCGCUCGUGGCCACCCACGACUACUACCGGCGCCGCCUGGGUUCCACUUCCAGCAACAGCUCCUGCAGCAGUACCGAGUGCCCCGGGGAAGCCAUUCCCCACCCCCCAGCUUCUUUUUCGGGAAGUCCACCCUCCCGUUCAUGGCCACGGUGUUGGAGUCCGCAGAGCACUCGGAACCUCCCCAGGCCUCCAGCAGCAUGACCGCCUGUGGCCUGGCUCGGGACGCCCCGAGGAAGCAGCCCGGCGGUCAGUCCAGCACAGCCAGCGCUGGGCCCCCGUCCUGACCUGAGCGGUUACCACCAGCCCCAGGCCUGCGGAGGCGCUAGUCCACCAGAGCCCCUCCCCGCCCCUCUCCCCACUCCGCAUCCCUCGCCCCCCUCCCCACCUCCCACCCCCCACCCUGUAAACUAGGCGGCUGCAGCAAGCAGACCUUCGCAUCAACACAGCAGACACCAAAAACCAGUGAGAGCCCCGCUCUCUACCGCCCGGCCCCAGCACUCGCUAGCUUUCCUGACACCUGGAACUGUGCACCUGGCACCAAGCGGAAAAUAAACUCCAAGCAGCCAGUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-269.12 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -281.23
Frequency: 0.0000
Diversity: 190.65
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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