Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001354377.2
Sequence Length
3747 nt
GC Content
0.4380
AGACGCGCGCUGCAGGAGCGCGGAACAUGGCGCGGCACGGGCCACCGUGGAGUCGGUUGGACGCGCAGCAGGAGCGCGACGUGCGGGAGCUCGUCCGGGGUGUCGCCGGCCUCCAGGACGAGGCAGACCCCAACUUCCAGCUCGCCCUAAACUUCGCCUGGUCCAACUUCAGAUUUCAUCGUUUCUUGGAUGUCAACAGCCACAAAAUAGAAAAAACAAUCGAAGGAAUUUAUGAAAAAUUUGUCAUUCAUUCUGAUCUAAGCAAAGCUGCUAGUUGGAAGAGAUUAACGGAGGAAUUUCUAAAUGCACCACUUCCCAGUAUAAAGGAAAUAAAGACAGAUGCACAUUAUUCCAUACUGUCACUUCUUCUGUGUCUGUCAGACUCUCCUUCAAACAGCAGUUAUGUGGAGACACCAAGAAAUAAAGAAGUGGAAAAGAAAGAUGAUUUCGACUGGGGAAAAUACUUGAUGGAAGAUGAAGAAAUGGACAUUGGUCCGUACAUGGACACACCAAAUUGGUCUGAAGAAAGUGAAGAGGAAAAUGAUCAACAGCCCUUAAGCAGAGAGGACUCUGGAAUUCAGGUAGACAGGACACCGUUAGAAGAACAAGAUCAAAACAGAAAACUGGAUCCUUGUAUCAGUUGGAAAGCAGAUGAGCCAGAUGACCGAAGCUGGCUGGAACAUCAUGUGGUCCAUCAGUACUGGACAGCCAGGCCCUCCCAGUUUCCUCAUAGUUUACAUUUGCACUCUAAUUUAGCUGCUGUCUGGGACCAACACUUGUACAGCAGUGAUCCAUUGUAUGUUCCAGAUGACAGGGUUUUGGUUACUGAGACUCAGGUUAUUCGGGAAACCCUAUGGUUACUUUCAGGAGUGAAAAAGCUCUUUAUAUUUCAGUUGAUAGAUGGGAAGGUAACUGUGAGAAACAAUAUUAUAGUAACUCAUUUAACACAUAGCUGUUUACGAUCUGUGCUGGAACAAAUAGCAGCAUAUGGCCAGGUUGUGUUUCGACUCCAGGAGUUCAUUGAUGAAGUCAUGGGACACAGUUCUGAGAGCAUGCUGCCUGGAAGUGGGUCUGUUCCUAAGAAGUCAACUGAAGCUCCCUUUAGAACCUACCAGGCUUUCAUGUGGGCCCUGUACAAAUAUUUCAUUAGUUUCAAAGAGGAACUUGCAGAAAUUGAGAAGUGCAUCAUCAAUAAUGAUACUACAAUAACUCUUGCAAUAGUGGUGGACAAGUUGGCACCUCGAUUGUCUCAGCUCAAGGUUCUGCACAAAGUGUUUAGUACUGGAGUAGCAGAAGUUCCACCUGAUACUCGAAAUGUCGUCCGGGCCUCUCACCUGCUUAACACCCUGUACAAGGCCAUUCUUGAAUAUGACAAUGUUGGAGAAGCCUCUGAGCAAACCGUCUCCCUCCUUUUCUCUCUCUGGGUGGAAACGGUGCGGCCUUACCUGCAGACGGUGGACGAGUGGAUCGUGCACGGGCACCUGUGGGAUGGCGCCAGGGAGUUCAUCAUCCAGAGAAACAAAAAUGUUCCAGUUAAUCACAGAGACUUCUGGUAUGCAACUUACACGUUAUAUAGCGUAUCAGAAAAGACAGAAAAUGAAGAAAAAAUGAGUGAUAACGCUAGUGCGAGUUCCGGCAGUGACCAGGGGCCCUCCAGCAGGCAGCACACCAUGGUGUCCUUCCUCAAACCUGUCCUGAAGCAGAUCAUAAUGGCUGGCAAGUCGAUGCAGCUGCUGAAGAACCUGCAGUGUGCGGAGAGCACCACCUGCCAGGCAGGAGCCAGAGAUGCAGAAAGAAAAAGUUUAUACACUCUCUUUCUGGAAUCUGUACAGUCCCGUCUUCGACAUGGAGAAGAUUCCACUCCACAGGUUCUUACUGAGCAACAGGCAACCAAGGAGAACCUGAUGAAGAUGCAGUCCAUUGCUGAAAGCCAUCUUGAACUGGAUGAUGUUCAUGAUCCACUGCUUGCCAUUAACUUUGCAAGGAUGUAUUUGGAGCAGAGUGACUUUCACGAGAAGUUUGCUGGUGGUGAUGUAUGUGUGGAUAGAUCAUCGGAAUCUGUGACAUGCCAGACUUUUGAAUUAACGCUGAGAUCCUGCCUCUAUCCUCAUAUUGACAAGCAGUAUCUAGAUUGCUGUGGAAAUCUCAUGCAAACUCUAAAAAAAGAUUACAGGUUGGUAGAAUACUUGCAAGCUAUGAGGAAUUUUUUCUUAAUGGAAGGAGGAGAUACCAUGUAUGACUUCUACACGUCAAUUUUUGAUAAAAUAAGAGAAAAGGAAACAUGGCAGAAUGUGUCUUUUCUUAAUGUCCAACUCCAAGAAGCAGUAGGACAGCGUUAUCCUGAAGAUAGUUCACGUCUAUCUAUAUCUUUUGAAAAUGUUGACACAGCUAAGAAGAAGCUGCCUGUUCAUAUCUUAGAUGGUCUGACCCUCAGCUACAAGGUCCCAUGGCCCGUGGACAUUGUUAUAAGUUUGGAAUGUCAAAAAAUUUAUAAUCAAGUGUUUCUUCUCUUAUUGCAAAUAAAGUGGGCAAAAUAUAGUCUGGAUGUUUUACUUUUUGGUGAACUGGUUAGUACUGCAGAAAAACCACGACUUAAAGAAGGCCUUAUACAUGAACAAGACACAGUUGCUCAGUUCGGACCACAAAAAGAACCAGUAAGACAGCAGAUUCAUCGCAUGUUCCUCUUAAGAGUGAAGCUCAUGCAUUUCGUGAACAGCUUGCACAACUACAUCAUGACCAGGAUUCUACACAGUACAGGGCUGGAGUUUCAACAUCAAGUCGAGGAAGCCAAGGAUUUAGAUCAAUUGAUUAAAAUUCACUAUAGGUAUCUGUCAACCAUCCAUGACCGGUGUCUGCUGAGAGAAAAGGUCAGCUUUGUGAAAGAAGCUAUCAUGAAGGUGUUGAACUUGGCUCUCAUGUUUGCAGACGGUUGGCAGGCAGGCCUGGGCACUUGGCGAAUGGAAUCUAUAGAGAAAAUGGAAUCUGAUUUUAAAAACUGCCAUAUGUUUCUUGUAACCAUUUUAAACAAAGCCGUCUGUAGAGGAUCCUUUCCCCAUUUGGAAUCUCUAGCGUUGUCACUCAUGGCUGGCAUGGAACAAAGUUAAAUGUCUUCAGCGUAAUAAAUAUCUCCGACUUUGUCAUCAUACAUGUACAUUUCCACCAUGUGCAGCUGAAAAGUGAAAAUAUUUUUAUUUUGGUUUAUUUGUAAAACUUGUCCACAGUCAGCCUGGCACAGUCGCUCAUGCCUCUAAUCCCAGCACGAUGGGAGGCCAAGACAGGCAGAUCACUUGAGCCCAGGAGUUUGAGGCCAGCCUGGGCAACAUGGUGAAACCCGGUGUCUACCAAAAAUACAAAAUGUAUCCAGACAUGGUGGUGUGUACCUGUAGUCCCAGCUACUCAGGAGGCAAAGAUGGGAGGAUUACUUGAGCCCAGGAGGUCAAGGCUACAGUGAGCCAUGAUUGCACUACUGCAGUGCAACCUGGGUGACAGAGUGAGACCCUGACUCAGAAAGAACCACUUGCCCACAGUCCAGACAGAUGGAUUGUAGGUGGGUUUUCUGGAGAUUAGUAGAUACUGUAUAGAGUUGUAUACAUAAAAUUGUGUCAGUAGUACAAAGUGUAUAUAGGCUGUUUACUCUUACAUUUCCUACUGUAAGAUACAGAUUUAUGGUACUGAUACCUUUAAAUUAUAUCAUAUUUUGAAAAUGUAAUUACUGAUAUUCAAAAUAAAUUAAAGGACUUAAAAUCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1116.07 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1183.72
Frequency: 0.0000
Diversity: 944.64
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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