Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001354404.2
Sequence Length
6923 nt
GC Content
0.4271
GCUAUCAGGAGGAGCAAAAGGGAAGGAUCUGCUGCUGGGGGCUCGCUGGGUGACCCUUUGCCAGACGAAAAGAGCUGGUCGAGAGAGAAGCGCUUGGCAGGAGCUCUCUGCGGGACCUAAGCUCCGUGGCUGCUCGGGAUCCCUACGUCCGCUGCUGCUGAAGGAGCAGAGGGGAGGACGCCAGCGGUUGCUUACUGGAGCCUGGAGGAAAAUGGAAACAUCAUUCCCUAGAAACAGUUGAAGUUGACAGACCUAGAGGUUGACAAAAGGACACGACACUAGGGAAUUUGCAUUGUCAUGUUUCGAAAUACCAUUCCAAAGACCUGCAAAUAAGAUCAGCUUUGAGUGAACUUUGACAGAAGAUGUUUCGACAGUUUUAUCUCUGGACAUGUUUAGCUUCAGGGAUCAUCCUGGGCUCUCUCUUUGAAAUCUGCUUGGGCCAGUAUGAUGAUGGUACAAUUCUGGUGGACAACAUGCUGAUCAAAGGGACUGCUGGAGGACCAGACCCCACCAUAGAACUUUCUUUAAAGGAUAAUGUGGAUUACUGGGUGUUGAUGGAUCCUGUUAAGCAAAUGCUUUUCCUGAACAGCACCGGAAGAGUUCUGGAUAGAGAUCCACCGAUGAACAUACACUCCAUUGUGGUGCAGGUCCAGUGCAUCAACAAAAAAGUGGGCACUAUUAUCUACCAUGAAGUGCGAAUAGUGGUGAGAGACAGGAAUGACAACUCACCCACUUUCAAGCAUGAAAGCUACUAUGCCACAGUGAAUGAGCUCACUCCAGUUGGUACCACAAUAUUCACAGGAUUUUCAGGAGACAAUGGAGCUACAGAUAUAGAUGAUGGACCAAAUGGACAGAUAGAGUAUGUUAUUCAGUAUAAUCCAGAUGAUCCGACAUCCAAUGACACCUUUGAAAUUCCCCUAAUGUUGACUGGAAAUAUAGUGUUAAGGAAGAGGCUCAACUAUGAAGAUAAGACUCGCUACUUUGUCAUAAUCCAAGCUAAUGACCGUGCCCAAAAUCUGAAUGAGAGGCGAACCACCACCACCACUCUCACAGUGGAUGUUCUGGAUGGAGAUGACUUGGGUCCAAUGUUUCUUCCUUGUGUCCUUGUGCCAAACACUCGUGAUUGCCGUCCACUCACUUAUCAAGCUGCCAUACCUGAGUUGAGAACUCCGGAAGAACUGAACCCCAUUAUUGUUACGCCACCAAUCCAAGCCAUUGAUCAGGACCGGAAUAUUCAACCGCCAUCAGAUAGGCCAGGAAUCCUCUAUUCCAUCCUUGUUGGGACUCCUGAGGAUUACCCACGAUUUUUCCAUAUGCAUCCUAGGACAGCAGAACUUAGUCUCCUGGAGCCAGUAAACAGAGACUUUCACCAGAAAUUUGAUUUGGUUAUUAAGGCUGAACAAGACAAUGGUCAUCCUCUUCCUGCCUUUGCCGGUCUACACAUUGAAAUACUGGAUGAAAACAAUCAAAGUCCAUAUUUUACAAUGCCCAGUUAUCAAGGCUAUAUCCUGGAAUCUGCCCCAGUGGGAGCAACCAUUUCGGACAGUCUCAAUUUGACUUCACCUUUAAGAAUAGUAGCUCUGGACAAGGACAUAGAAGAUACAAAAGACCCAGAGCUUCACCUUUUUCUGAAUGACUACACCUCAGUCUUCACCGUCACACAGACUGGUAUUACUCGCUACCUCACCUUACUUCAACCAGUGGACAGGGAAGAACAGCAAACUUACACCUUUUCGAUAACAGCAUUUGAUGGUGUACAAGAAAGUGAGCCAGUCAUCGUCAAUAUUCAAGUGAUGGAUGCAAAUGAUAACACGCCAACCUUCCCUGAAAUAUCCUAUGAUGUGUAUGUUUAUACAGACAUGAGACCUGGGGACAGUGUCAUACAGCUCACUGCAGUCGACGCAGACGAAGGGUCAAAUGGGGAGAUCACAUAUGAAAUCCUUGUUGGGGCUCAGGGAGACUUCAUCAUCAAUAAAACAACAGGGCUUAUCACCAUCGCUCCAGGGGUGGAAAUGAUAGUCGGGCGGACUUACGCACUCACGGUCCAAGCAGCGGAUAAUGCUCCUCCUGCAGAGCGAAGGAACUCCAUCUGCACUGUGUAUAUUGAAGUGCUUCCACCAAAUAAUCAAAGCCCUCCUCGCUUCCCACAGCUGAUGUAUAGCCUUGAAAUUAGUGAAGCCAUGAGGGUUGGUGCUGUUUUAUUAAAUCUACAGGCAACUGAUCGAGAGGGAGACUCAAUAACAUAUGCCAUUGAGAAUGGAGAUCCUCAGAGAGUUUUUAAUCUUUCAGAAACCACGGGGAUUCUAACCUUAGGGAAAGCACUGGACAGGGAAAGCACUGAUCGCUACAUUCUGAUCAUCACAGCUUCAGAUGGCAGGCCAGAUGGGACCUCAACUGCCACAGUAAACAUAGUGGUGACAGAUGUCAAUGACAAUGCUCCAGUGUUUGAUCCUUAUCUGCCAAGAAAUUUAUCUGUGGUGGAAGAAGAAGCCAAUGCCUUUGUGGGUCAAGUAAAAGCAACAGACCCUGAUGCUGGAAUAAAUGGUCAAGUGCACUACAGUUUGGGUAACUUUAAUAAUCUUUUUCGUAUCACAUCCAAUGGGAGCAUUUACACAGCAGUGAAGCUUAACAGAGAAGUCAGGGACUACUAUGAACUUGUUGUUGUGGCAACAGAUGGAGCAGUACACCCUCGUCAUUCAACUCUAACCUUGGCCAUCAAGGUUUUGGACAUUGAUGAUAACAGUCCUGUGUUCACCAAUUCAACAUACACUGUCCUUGUUGAAGAGAAUUUGCCAGCUGGGACUACCAUCCUUCAAAUAGAGGCCAAAGAUGUCGACCUUGGAGCAAAUGUGUCUUACCGGAUAAGAAGCCCAGAAGUGAAGCACUUUUUUGCACUACAUCCAUUUACAGGAGAACUAUCGCUUUUAAGGAGUUUAGAUUAUGAGGCAUUUCCAGACCAAGAAGCAAGUAUCACUUUUCUGGUAGAGGCCUUUGAUAUUUAUGGAACAAUGCCACCUGGUAUUGCUACUGUCACAGUGAUUGUAAAGGAUAUGAAUGAUUAUCCUCCUGUCUUUAGUAAACGAAUAUACAAAGGGAUGGUGGCUCCGGAUGCAGUCAAGGGUACACCUAUCACAACAGUUUAUGCUGAAGAUGCAGACCCUCCUGGAUUACCUGCAAGUCGUGUGAGGUAUAGAGUAGAUGAUGUACAGUUUCCUUACCCUGCCAGUAUUUUUGAAGUGGAAGAAGAUUCUGGAAGAGUAAUAACACGAGUCAAUCUUAAUGAAGAACCUACAACAAUUUUUAAGUUGGUGGUGGUUGCUUUUGAUGAUGGGGAGCCUGUGAUGUCCAGCAGUGCCACAGUGAAGAUUCUUGUCUUACAUCCUGGUGAGAUCCCACGCUUCACACAGGAGGAAUAUAGACCUCCUCCAGUAAGUGAACUUGCCACCAAAGGGACCAUGGUUGGUGUAAUUUCUGCUGCUGCCAUUAAUCAAAGUAUUGUGUACUCCAUUGUUUCAGGAAAUGAAGAAGAUACAUUUGGAAUUAAUAACAUCACAGGUGUUAUCUAUGUGAAUGGACCUCUGGAUUAUGAGACCAGGACAAGCUAUGUACUUCGAGUCCAAGCUGAUUCCCUGGAAGUGGUCCUUGCCAAUCUCCGAGUUCCUUCAAAAAGCAAUACAGCUAAAGUAUACAUUGAGAUUCAGGAUGAAAAUAAUCAUCCCCCAGUGUUUCAGAAAAAAUUCUACAUCGGAGGUGUAUCUGAAGAUGCAAGAAUGUUUACUUCUGUACUCAGAGUGAAGGCUACUGAUAAAGAUACUGGCAAUUAUAGUGUCAUGGCCUACAGACUCAUAAUACCACCAAUUAAAGAGGGAAAAGAAGGAUUUGUAGUGGAAACAUAUACAGGGCUUAUCAAAACUGCUAUGCUCUUCCAUAAUAUGAGGAGAUCCUACUUCAAGUUUCAAGUUAUUGCAACUGACGACUAUGGGAAGGGACUGAGCGGCAAAGCCGAUGUACUCGUCUCCGUGGUCAAUCAGCUGGAUAUGCAAGUCAUUGUUUCCAAUGUGCCUCCUACUCUAGUGGAAAAAAAGAUAGAAGAUCUUACAGAGAUCUUGGAUCGCUAUGUUCAGGAACAAAUUCCUGGUGCCAAGGUCGUAGUGGAGUCCAUUGGAGCUCGCCGGCAUGGAGAUGCCUUUUCCCUAGAAGAUUACACCAAAUGUGACUUGACUGUCUAUGCAAUUGACCCCCAAACCAACAGAGCCAUCGAUAGAAAUGAGCUUUUUAAAUUUUUGGAUGGCAAACUACUUGAUAUCAAUAAAGACUUUCAGCCGUAUUAUGGGGAAGGAGGACGCAUUCUGGAGAUCCGGACUCCAGAGGCAGUGACCAGCAUUAAAAAGAGAGGAGAAAGUCUAGGAUACACAGAAGGGGCCUUGUUGGCUCUGGCCUUCAUCAUCAUCCUCUGCUGCAUUCCUGCCAUCUUGGUGGUUUUGGUCAGCUACAGACAGUUUAAAGUACGUCAAGCUGAGUGUACAAAGACUGCACGAAUUCAGGCCGCAUUACCCGCGGCUAAACCAGCAGUGCCGGCUCCUGCACCAGUGGCAGCGCCCCCGCCGCCGCCGCCGCCUCCGCCAGGUGCGCAUCUCUAUGAAGAACUUGGAGACAGCUCAAUUCUUUUCCUUCUCUACCAUUUUCAACAAAGCAGGGGAAAUAACUCAGUCUCAGAAGACAGGAAACAUCAACAAGUUGUGAUGCCCUUUUCUUCCAAUACUAUUGAGGCUCACAAGUCAGCUCAUGUAGACGGAUCACUUAAGAGCAACAAACUGAAGUCUGCAAGAAAAUUCACAUUUCUAUCUGAUGAGGAUGACUUAAGUGCCCAUAAUCCCCUUUAUAAGGAAAACAUAAGUCAAGUAUCAACAAAUUCAGACAUUUCACAGAGAACAGAUUUUGUAGACCCAUUUUCACCCAAAAUACAAGCCAAGAGUAAGUCUCUGAGGGGCCCAAGAGAA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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1852.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1997.46
Frequency: 0.0000
Diversity: 1645.26
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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