Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001354423.2
Sequence Length
2108 nt
GC Content
0.5152
GGAAGUGGAGUGCGCUGCGGUGCGAGCUGGGCCGGCGGGGUGGUUCGAGAGCGCGCAGAGUCCAGACUGGCGGCAGGGCCCGAGGGGCCGACCCGCAGCGUCCCUGGUCUCUCCAGCCCUCACUCGGAACCGCACGGUACAGGUGAAAGGGGGCAGACCCCUCAUCAUGCUUUCCAGGCAUCUGCCACUUCCCAGGAAUUGUCUCCCUGGAUAAACAAGGCGAAGUCCCUGGCUGUGCAGAAGCAGUAGCUGUGUGGUGGCACAGUCAGGAAAACUCGGGGGCCCUGUUGACAGUGACAAUACCCUCCCCUCCCUUGGGCUGGACCCCUCUCUACAGCUAGGAGCCAAUGGCAGAAGACAAAACCAAACCGAGUGAGUUGGACCAAGGGAAGUAUGAUGCUGAUGACAACGUGAAGAUCAUCUGCCUGGGAGACAGCGCAGUGGGCAAAUCCAAACUCAUGGAGAGAUUUCUCAUGGAUGGCUUUCAGCCACAGCAGCUGUCCACGUACGCCCUGACCCUGUACAAGCACACAGCCACGGUAGAUGGCAAGACCAUCCUUGUGGCAGACAUAAACGUGACCCAAAAAAGCUUCAAUUUUGCCAAGAAGUUCUCCCUGCCCCUGUAUUUCGUCUCGGCUGCUGAUGGUACCAAUGUUGUGAAGCUCUUCAAUGAUGCAAUUCGAUUAGCUGUGUCUUACAAACAGAACUCCCAGGACUUCAUGGAUGAGAUUUUUCAGGAGCUCGAGAACUUCAGCUUGGAGCAGGAAGAGGAGGACGUGCCAGACCAGGAACAGAGCAGCAGCAUCGAGACCCCAUCAGAGGAGGUGGCCUCUCCCCACAGCUGAGGGGCUGGGGCUAGGGGUGGGUGGAGCCCUUUUAAAAUACCCUUCCCUUCAACAACUCUCCAGCUCUGAAUGGAGAAACUCUCUAGGCCAUCCCCUCUUCUACCUCCUGCAACCCACCCAUCCUAUUAGCCUCCCACAUUCAAGGCCCGUGAUACAGGGAUGAGGUCAGCACCAGCAAACUCUGGACUGGUGGAAGAAUUCCCCACCAGAUCUCCUUGAAGCAGAAUUAGGGAUCAGCAUCAUUAACACCUUCCCCACCCCCUCCCCCCAGGCAGACAGUGAAGAGAAUCAGAAAACAUGAUUAUGUGUCACUUUAAUACAGGAAAUUUAGGUGUUUUUUGGUGUUUUUGUUUUUGUUUUCUUUCCAAAGCUCACCUCGGGGACAAUUCCUUGGGCUUCUCCUGAGGUAAUGAUUACCCCCCCACCCACAGCUGAGUCUGUGAGGCCCCAUCCUUUCCCUACGUUUUCUCCCAUCUUUUUUCCUCUUCAAUCUCCCAGUCAUCUGGUUUGUUUGUUUCUUUGUUCGUCCUGAGACGGAGUCUCGCUCUGUCGCCAGGCUGGAGUGCAGUGGCGCAGUCUCGGCUCGCUGCAACCUCUGACUCCCUGGUUCAAACGAUUCUCCUGCCUCAGCCUCCCGAGUGGCUGGCAUCACCACGCCCAGCUAAUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGACGGGGUUUCACCAUGUUGCCCAGGAUGGUCUCGAUCUCCUCACCUCGUGAUCCGCCCGCCUCGGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGCAUGAGCCACCGCGCCCGGCCCCAAUCAUCUGUUUUUAAACAAUCGUUUUUGAGCAGAUAGCUAUUCAUUCCAGAUUUCCGUGUACCCACUCUGUUUCAGGAGCUCUUCUAGGUAAAGCUGAGAUCACAGGAACAGCAGGUGACAGGCCUAGCUAUAGUUAGGAAUACACAAGCGGUAAAAUCGAGUCCUUACAGCCAUACCACAAGGUACGUCCAUUUGGACUACAAGAAGAGCUUCCUUUAAAGUUCCUAUUUCAGCAUAAAGAGGCUGUCCUUUUUUUUUAGGAAUAGUUUGGACCUUGUGCCUCCUGUGGGAGGCUGAGGACUGCAAGAGGAGAGCUAGCAGAUAUGCCUGUUCACCCCUCUCUGGUACUUGUGGCUUGCUAGUAUGUUUUUAUGAUAAUCUCGGGCAUUGUUUGCAUUGUGUUUAUUAAUAGGGUUUUGUUUUUAUUGUUUCCUUUUUUACAGUAAAGGCUGAAUGACAUAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-714.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -753.12
Frequency: 0.0000
Diversity: 557.57
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((((((....))))((...(((((((((.(((((((((((.(((.((.(((.(((..((((((((((((((..(((((((........).)))))))))))..((((((((((((..(.(((....))).).)))))(((((((((((..(((.............)))..))))))(((((((..(..((((((....)))))).)..)).))))).(((((((((((....((((...))))......))))))))))).......(((((...(((((.......)))))...))))).))))))))))))((((((((((((.(((.((((.(...(((((.(((((((..(((((((.((((.(.(((..((((((((...((((..((.((.((((((.......((((((((((.((((((((.((((..(((.(((...(((((.(((....)))))))).))).)))...)))).)).))))))(((((............(((....)))....(((((((..(((((.....))))).)))))))........)))))..........(((((((.........(((((((((...((.((((.(((((((((.((.((((...))))))..((((((((((((..(((((......))).))..)))).....)))).))))(((.((....)).)))..)))))))))....)))).))..))))))))).((..((((..((((((((.(((.(.((((((.........((((....)).))((((..(((((......)))))..))))(((.(((((....))))))))..(((((.(((((..............))))).)))))........((((((........)))))).....))).)))).)))))))))))..)))).)).....(((((((((((((((((..........))))...))))...)))))).))).....((((......)))).(((((((.........)))))))......))))))).......((((..................))))...........)))))))))).(((((....(((((.......))))).....)))))........(((((...(((((..((((((......................))))))..))))).((((...((((((((((.....))))))).))).....))))....(((((((......))))).))........))))).)))))).)))).))))...))))).))).....))).).)))).))))))))))))))......((((..(((((((((((...))))))))((((((...((((.(((.((.(((((........)))))..)).)))))))))))))))).)))).....)))))...).))))..)))(((((((........).))))))................))))))).))))).......))))).))))..))).)))((((.(........).)))).)).)))))).((((((((......))))).....)))..)))))))).)).)))))))...))((((((((..((((....))))..))))))))........))))))..)))))...((((..((((......))))........))))...(((((((((.(((((((((((((.(((((((((((....))))))..........((((...))))((((((..(((((...((((((((((((((((.(((.....)))...((((((......))))))(((((((.....(((((((....))))))).....)))))))..)))))...))))))..)))))..))))))))))).(((((((.((((..(((....)))..))))...))))).))...))))).)))))).....))))))).)))...))))))(((.....))).(((((((..........((((.(((((((((((..........))))))))))).))))))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((((((((....}}))|({{,(((((((((.(((((((((((.(((.((.(((.(((..((((((((({(((((,(((({{|,.,,,,..}.)}},||||,},,,||||{{{(((((,{{.(((....))).}.})}|}.{(((({,,,,}}|||.,,,.{{{{,...}))},}}|}}}{{{{{(({{(..,,,,,,.}}})),,,,.,..}},|||||.(((((((((((....((({...}}}),,....)))))))))))....,,.(((((...(((((.....,,))}}}.,,}))}},))))))))}|||{(((((((((((.{{{.((((.....(((((.{({{,{,..{{{{{{{,({{{.(,(((,,{{((((((.,.((({..((,((.,{{{{{,.,,,,,|(((((((({.((((((((.((((..,((.(((...(((({{(((....)))))))).))).})}..,)))).)).)))))){{{((,{,.,{{...,{{{{.|,,{{.....(((((({..(((((.....))))).}))))))...{,,....}}|,,.,......((,{{,,....||...(((((((((...((.((((.(((((((((.{(.{,(({..((,.....((((((((((((..(((((......))).))..)))).....))))}}}))..,.,,,))}.}.,,}..)))))))))....)))).))..))))))))).||}}|{{|}|||,,{{||.{{{||||{{,{,,,{{{..{{((({.,,{||.,,{(({{.,,.,,{({(({((.((((((.{,,{.((((({.,{||.|{||||{((((({((((({.,...........,,,,,..,}},........((((((........)))))).....,,,|||,,.,,,))),,,,,..,,,,.}}...}}|||||||||,,|||||{,,,.......,))|,,.}}},...)))},|{|||.{{{.((((......)))).(((((((.........)))))))......|||||||,,,,.||||||..,{{{,,,..{{{{{{{|||.......{{.,.,,,})),)),.(((((....(((((.......))))).....)))))........|||.....|||||},,,,|||}}},.,,,.,,,,},,,.....,}}}})}},))))}((((..,((((((((((.....))))))).}}},.,,.})))},,,|||,|||}}}...,,),)}))}}}}.))))))...,}}))}.))}}.}}}}...}}}}}.}},.....}}|,|,}}}},)))}}))}))))},,,,,,,|{{,,{{{.((((((((...)))))))),{||||,.{(((({(((,((,{{,{{....},.,))))),.,)})))}})}))))))}},.}}},.,}},)))))...},)))).,}}|(((((((........)})}))))}...............))))))).))))),.,.}}.))))))))))..))).)))((((.{........).)))).)).)))))).((((((((......))))}....,)))..)))))))).))))))))))...,,((((((((..((((....))))..)))))))),}},...,)))))}..))))){{{{,,,||{((({{{...||||{,{.....||{,,.,(((((((((.(((((((((((((.(((((((((((....))))))..........((({...})))((((((..(((((...((((((((((((((((.{((.....))},..((((((......))))))(((((((.....(((((((....))))))).....)))))))..)))))...))))))..)))))..))))))))))).{,(((((.((((..(((....)))..))))...))))).}}...))))).))))))}....,)))))).)))...))))))(({.....)))..,},}}}}...}}}))))}{{.(((((((((((..........))))))))))).}},..}}},...
Back