Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001354648.2
Sequence Length
1541 nt
GC Content
0.5866
GGUGGUGCUGUGGUCUGCCCCUGGAGAACCCAGAAGAACACAGCUGUGCGCGCCCACAGGCUCUGGGGGCGGGAGAAGAUAAGUCGCAAGGAGGGGGCGGGACCUACACCUCAGGAAAGCCGGAGAAUUGGGGCACGAAGCGGGGCUUUGAUGACCCGCAAAGGGCGAGGCAUGCAGGAGGUGGAGGAAUUAAGUGAAACAGGGAAGGUUGUUAAACAGCACCGUGUGGGCGAGGCCUUAAGGGUCGUGGUCCUUGUCUGGGCGGGGUCUUUGGGCGUCGACGAGGCCUGGUUCUGGGUAGGCGGGGCUACUACGGGGCGGUGCCUGCUGUGGAAAUGCCUGCCCGCGCGCUUCUGCCCAGGCGCAUGGGGCAUCGUACUCUAGCCUCCACUCCUGCCCUGUGGGCCUCCAUCCCGUGCCCUCGCUCUGAGCUGCGCCUGGACCUGGUUCUGCCUUCUGGACAAUCUUUCCGGUGGAGGGAGCAAAGUCCUGCACACUGGAGUGGUGUACUAGCGGAUCAAGUAUGGACACUGACUCAGACUGAGGAGCAGCUCCACUGCACUGUGUACCGAGGAGACAAGAGCCAGGCUAGCAGGCCCACACCAGACGAGCUGGAGGCCGUGCGCAAGUACUUCCAGCUAGAUGUUACCCUGGCUCAACUGUAUCACCACUGGGGUUCCGUGGACUCCCACUUCCAAGAGGUGGCUCAGAAAUUCCAAGGUGUGCGACUGCUGCGACAAGACCCCAUCGAAUGCCUUUUCUCUUUUAUCUGUUCCUCCAACAACAACAUCGCCCGCAUCACUGGCAUGGUGGAGCGGCUGUGCCAGGCUUUUGGACCUCGGCUCAUCCAGCUUGAUGAUGUCACCUACCAUGGCUUCCCCAGCCUGCAGGCCCUGGCUGGAAACUUUUUCCGGAGCCUGUGGGGACCUUAUGCUGGCUGGGCCCAAGCGGUGAGUGUACCUAGGUGUCCUCCCUAGGUUUCCUCUCCUCCAGCCCAGACCCAGUGGACUCUUCCACCACCGCCCCAGGUGGCCCUAAAGGACUCUCCAGCCACCCCUGUCCCAACCCCAGUGGAUUCUCAUUGCCUUCGGCCCUGUUCCCCAAGGACUCUUCCACCUCCCAACACUGUCACUAGUCUCACCAGCCCUGACCCCAGUGUACCCUCCUCCCCACACAGACUCCACCCUCCUACAGGUGCUGUUCAGUGCCGACCUGCGCCAAUCCCGCCAUGCUCAGGAGCCACCAGCAAAGCGCAGAAAGGGUUCCAAAGGGCCGGAAGGCUAGAUGGGGCACCCUGGACAAAGAAAUUCCCCAAGCACCUUCCCCUCCAUUCCCCACUUCUCUCUCCCCAUCCCCACCCAGUCUCAUGUUGGGGAGGGGCCUCCCUGUGACUACCUCAAAGGCCAGGCACCCCCAAAUCAAGCAGUCAGUUUGCACAACAAGAUGGGGUGGGGGAUAUUGAGGGAGACAGCGCUAAGGAUGGUUUUAUCUUCCCUUUAUUACAAGAAGGAACAAUAAAAUAGAAACAUUUGUAUGGAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-608.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -630.86
Frequency: 0.0000
Diversity: 341.38
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.((((((.(((((((((((((.........(..(((....)))..).........)))))))))))))................((.(((((.(((...((((((((.((....)).)))...((((((.....(((((.(......).)))))..((((((((((.((((((((((((((((..........(((.((...(((((...))))).)).)))...((.(((((...))))).))(((((((...((((((((((...(((((((.((..((..(((..(.((((.((((((((((((..(((((((((......(((((((((((...(((.((((((......)))))).))))))))(((((....(((((((((((((...(((((((((.......((((.(((.....)))..))))((((.((((((((((.((((((((((.......(((((.(((((((....((((.((..(((.((((((((.(((((.......)).)))))))).))))))..))))))...))))).)).)))))))).)).))))).).))))))))))))).))))))))).)))..))).))))))).)))))...((((....((((((........)))))).....))))..((((((((.....((((....)))).((((((((.((((.(((.......(((((((.(((.((..((.....).)..))))).)))))))...........(((((((.(((...........(((.(.....).))).))).)))))))))).))))..))))))))....((((((.(((((...((((.(((.(((((...((((((.((((((..........))))))...........)))))).)))))))).))))))))).)))))).....((.(((...(((((((.(....))))))))...))).))...........))))))))....))))))))))))))).)))))))))...(((...))).)))))))..)..)))..))..)).))).......))))..))))))))))..)))))))))))))))))))......)).))...)))))....)))))).))))))))))))).))))))).))))).).))))).(((((((((((.(((((((((((...(((.(((..(((.(((...((..((((((....((.....))......))))))..))))).))).))))))....)))))..)))))).........((..(((.(..(((((((.(((((((((((((((...(((.((((((..((......)).)))))))))((((.(((.(((.....))).)))..)))).............((((.....))))......))).))))))))))))...))))).))..).)))..))...(((((((....(((((.......)))))....))))))).....)))))))).)))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((.((((((.{((((((((((((...,,.,..(..(((..,,|||..}..,,...|.))))))))))))|,.........||....((.(((((.(((...((((((((.((....)).)))...((((({.....(((((.{......}.)))))..((((((((((.((((((((((((((((.....,,...(((.((...(((((...))))).)).}}},,|{{.(((({...})))).,}(((((((...((((((((((...(((((((.((..((..(((..(.((((.((((((((((((..(((((((((......((((((,{({,,,{(((.((((((......)))))).}}))))),(((((....(((((((((((((...(((((((((.......((((.(((,...,)))..))))((((.((((((((((.((((((((((.......(((((.(((((((....((((.((..(({{((((((((.(((((.......)).)))))))).))))))..))))))...))))).)).)))))))).)).))))).).})))))))))))).))))))))).)))..))).))))))).))))}...{(((....((((((........)))))).....)))}..((((((((.....((((....)))).((((((((.((((.(((.......{((((((.(((.{{,,,,....,).,..}}))).))))))}...........,((((,,.,,|..,........{{(,(,.,,,|{}}}.}))}))}))))))).))))..))))))))....((((((.({{{{..,||{|.|||.{({{{.,.{(({{{{((((((.{,,,,,.,,||||||,,.....,,,,)))))).))))))}).)}}}))})),))))|}...|.((.(((.,.(((((((.(....))))))))...))).)).,..}},,,}.))))))))....))))))))))))))).)))))))))...(((...))).)))}})),.)..)))..))..)).)))...,...)))}..)))))))))),.)))))))))))))))))))......)).)}...)))))....)))))}.))))))))))))).))))))).))))).).))))).{(({(((((((,((((({(((((.,.({{.(((..(((.(((...({..((((((..,.((.....)).,....))))))..}}))).))).))))}}.,.,)))),.|))))),..,.....,|,..|||,}},|||{|{({(((({,{.{{((({((((,,,{(((((((((.{(({..{((((|((.(({((((.(((.(((.....))).)))..)))).))))).......(({{.....)))).))))})))}.)))))))))}}...)))))))).}).),,..)))}}|{(((((.,{,(((((.......))))),}..)))))},.....,,,,}))).)))...
Back