Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001354651.2

Sequence Length

2075 nt

GC Content

0.5504

GGUGGUGCUGUGGUCUGCCCCUGGAGAACCCAGAAGAACACAGCUGUGCGCGCCCACAGGCUCUGGGGGCGGGAGAAGAUAAGUCGCAAGGAGGGGGCGGGACCUACACCUCAGGAAAGCCGGAGAAUUGGGGCACGAAGCGGGGCUUUGAUGACCCGCAAAGGGCGAGGCAUGCAGGAGGUGGAGGAAUUAAGUGAAACAGGGAAGGUUGUUAAACAGCACCGUGUGGGCGAGGCCUUAAGGGUCGUGGUCCUUGUCUGGGCGGGGUCUUUGGGCGUCGACGAGGCCUGGUUCUGGGUAGGCGGGGCUACUACGGGGCGGUGCCUGCUGUGGAAAUGCCUGCCCGCGCGCUUCUGCCCAGGCGCAUGGGGCAUCGUACUCUAGCCUCCACUCCUGCCCUGUGGGCCUCCAUCCCGUGCCCUCGCUCUGAGCUGCGCCUGGACCUGGUUCUGCCUUCUGGACAAUCUUUCCGGUGGAGGGAGCAAAGUCCUGCACACUGGAGUGGUGUACUAGCGGAUCAAGUAUGGACACUGACUCAGACUGAGGAGCAGCUCCACUGCACUGUGUACCGAGGAGACAAGAGCCAGGCUAGCAGGCCCACACCAGACGAGCUGGAGGCCGUGCGCAAGUACUUCCAGCUAGAUGUUACCCUGGCUCAACUGUAUCACCACUGGGGUUCCGUGGACUCCCACUUCCAAGAGGUGGCUCAGAAAUUCCAAGGUGUGCGACUGCUGCGACAAGACCCCAUCGAAUGCCUUUUCUCUUUUAUCUGUUCCUCCAACAACAACAUCGCCCGCAUCACUGGCAUGGUGGAGCGGCUGUGCCAGGCUUUUGGACCUCGGCUCAUCCAGCUUGAUGAUGUCACCUACCAUGGCUUCCCCAGCCUGCAGGCCCUGGCUGGGCCAGAGGUGGAGGCUCAUCUCAGGAAGCUGGGCCUGGGCUAUCGUGCCCGUUACGUGAGUGCCAGUGCCCGAGCCAUCCUGGAAGAACAGGGCGGGCUAGCCUGGCUGCAGCAGCUACGAGAGUCCUCAUAUGAGGAGGCCCACAAGGCCCUCUGCAUCCUGCCUGGAGUGGGCACCAAGGUGGCUGACUGCAUCUGCCUGAUGGCCCUAGACAAGCCCCAGGCUGUGCCCGUGGAUGUCCAUAUGUGGCACAUUGCCCAACGUGACUACAGCUGGCACCCUACCACGUCCCAGGCGAAGGGACCGAGCCCCCAGACCAACAAGGAACUGGGGCCUCCUUGGCAAUGCAUUUGAUGGCCACCAGCUUCUGCGUCCUCUUAUCUUCUGCCAGGAUCACCUCCGAGAAGGCCCCCCUAUCGGGAGAGGGGAUUCACAAGGUGAAGAACUGGAACCCCAGCUUCCCUCCAGCCUCUCCUCCAUUCCCUAUGGGUUCUGUGACCACUGCUGGACCAAGGACGUGGAUGACCCUCCCCUAGUCACUCAUCCAUCCCCUGGCUCCAGAGAUGGUCACAUGACCCAGGCCUGGCCAGUCAAAGUAGUCUCUCCCCUGGCCACAGUAAUUGGUCAUGUGAUGCAAGCCAGCUUACUAGCACUUUGAGAAUGAGUCUCCUGUUGAGCUGGUAGGAUGUAAGCCUGGAGCUAAUGGCGAUCAUCUUUGCCACCACCUGGGGAGAGCCUGCUUGGGAAUGAAAUUAACACAAAGGAAGUCCAACCUGAGAAAUGGCCAAAUAUAUUUCCUGAUAACAUUAUGUGGCCCUCUGGAUCCAGCCAUGCCUGAGGUCUACCCCUGGGCUUUUGGAUUAUGUGUACAGUUGGUUCAUCCCUUUUUCUGCUAAUUCGAGUCAUGGCUAAUUUAACACCCUUUAGAACCUUAAAGAACCAUCAGCAUCACCCGGGAACUUUUUUAGAAAUGCAAAAUCUCUACUGCUUUGGAUCCUGGGUCAAAAAAAAGAAAAAAAAAAGAAAUGCAAAACUUUAGGCCCUGCCCCAGAUUUACUAAAUCAAUCUGCAGUUUAACAAAAUCCUCAGGUGAUUUGUAUGCUCAUUGAACUUUAAGAAGCAGUGUUUUAGAACAGGUUCUUAAAAAGGAACAAAUAAACUCAUUUAACUAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-801.34 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -834.93

Frequency: 0.0000

Diversity: 508.25

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((((((((((((..(((.((.(((....(((((((((.((((((((((((.(((.((((((.((((..((.((((((((((.(((..((.((((((((..(((.(.(((..(((((((.(((((.((((((..(((((((((.(......).))))).....(((.((((((..(..(.(((((((((...((((((.(((((((((((((....))))..((.(((((((((((...........)).))))))))).))((((((((.((((.((...)).)))).....((((((((((...((((..((((......))))..))))...)))))))))).((((((......))))))..(.((((((((((.((.(((((((((((((...(((((((((.......((((.(((.....)))..))))((((.((((((((((.((((((((((.......(((((.(((((((....((((.((..(((.((((((((.(((((.......)).)))))))).))))))..))))))...))))).)).)))))))).)).))))).).))))))))))))).))))))))).)))..))).))))))).((((....))))....((((((........))))))...(((..(((((.((((((....((((....)))))))).)).)))))..))).........)).)))))).)))).)...)))))))).......))))))))).))))))..))))))))).)..)..))).))))))....((((((((((......))))))))))...))))..)))))).)).))).))))(((((.(((..(((((.((((....((((((..........))))))))))..))))).))))))))((((((.((((((((((((((..((((.....))))..))).)))).)))).)))..)))))).........((((((((((((((.((((((((((((.....(((((....))))).((((((.((((............))))...))))))......))))))).)))))((((((....)))...)))......)))))))).))))))((.((.(((..((((((((..........))).)))))..))))).)).......))).))).).)))..))..))))))...))....((((.((((((((((....((...))....)).)))).)))).)))))))....)))))))))).)).((((..(((((((..(((....))).))))..(((((((......(((.((((..((((....)))))))))))......)))))))(((((((..((((((.((((((((((.((((((((.((..((((((((...............))))))))..))))).))))))).)))))))).))))))(((...))).....((((((.((((((((((((((.......)))))).(((..(((((((((((((.(((.((((.......))))...))).))))))))).(((((...(((..........)))...)))))))))...)))..)))))))).)))))))))))))............)))..)))).....(((....(((((.(((((((....))))....))).))))))))(((((((((......))).)))))))))).)))))).)))....))))))))))))))))........)))))....))).))....)))............((((((....)))))).)))).)))))))))).((((((((.(((.(((((((..............(((((.....(((((...................................)))))....)))))..(((.((((((.((((.((............)))))))))))))))((((..((((...))))..))))))))))).))).))))))))...............................

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((((((((((((..{{{.(({(,,...}|||,,((((.((((((((((((.(((.(((({(,(((({.((.((((((((((.{({..((,((((((((..(((.{.{(({.((...,||,|}}...,,((((((({.(((((.{......}.)))))...(((((,((((((..(..{,(((((((((...((((((.((((((((({{(,...,|}}|{{{(.{(((({{((((,....}},..,)|{||}}}}}})}))((((((({{((((.((...)).)))},{,..{(((((((((...((((..((((......))))..))))...)))))))))}.(((({{......)))))).|(,(({{{((({{.{{.(((((((((((((...(((((((((.......((((.(((,...,)))..))))((((.((((((((({.((((((((((.......(((((.(((((((....((((.((..(({{((((((((.(((((.......)).)))))))).))))))..))))))...))))).)).)))))))).)).))))).},})))))))))))).))))))))).)))..))).))))))).((((....))))....((((((........))))))...(((..(((((.((((((....((((....))))}})).,).)))))..))).....,,,.)),)))))).)))).)}..}))))))).......))))))))).)))))).,))))))))}.,..}..}}}.})))}}.,|.{(((((((((..,,,.|}||}|||||{,,..{{{.|||.||{,||,||,||||{||{{|{||.,({(((.((({,..{((((((........,.))))))))))..))))).}}}}))))||||},}}})))}||||||||.}|||)))){{{|||{,,||{||||.{{,,.{(((.(((((......))))).,)))),))))))){(((((((((((.....(((((....))))),((({{{.{|||,..,..,.....))))...))))))......))))))).)))))...((({{..{||.........))),)))))|((((({((((....|}|,.||.|||}}}..}}.,.}})))})..,,,||||}||........|}|}|})}.}.)))..))..})))))...||.....||{.(((((((({{..,,((...})....)}.)))).)))).))))))),,..)))))))))).)),((,...|||((((..{((....||}.}}}||,(((((((..,...(((.((((..((((....)))))))))))...,..)))))))(((((((..{(((({.((((((((((.((((((({,((..((((((((..........,....))))))))..))))).))))))).)))))))).}))))}(((...))).....((((((.((((((((((((((.......)))))).(((.,(((,(((((((((.(((.({{{.,,,,..}}}),,,))).))))))))).(((((...(((..........)))...)))))))))}}.}}}..)))))))).)))))))))))))............,((..,|||..,,.(((....(((((.((({{{{....,,,,....))).))))))))|||||||{|,,,.}}))).)))),.))))})))))).)))....})))))))))))))))........,}}}|,,..,,,.}}....)))............((((({....}))))).)))).)))))))))).{((((((({((({((({{{{........,,,{{{(((((..,..(((((.,,............................}}}.))))).}..))))}..{{{.((((({{((((.{(,,{....,}}..}}))))))))))))}{{{{..{{{{...}))}.,)))))))))))}))).)))))))}...............................