Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001354669.2
Sequence Length
1646 nt
GC Content
0.4660
CGGCCCGACCCGGCUCCGCCGCGGGCAGGCGGGGCCCAGCGCACUCGGAGCCCGAGCCCGAGCCGCAGCCGCCGCCUGGGGCGCUUGGGUCGGCCUCGAGGACACCGGAGAGGGGCGCCACGCCGCCGUGGCCGCAGAUUUGAAAGAAGCCAACACUAAACCACAAAUAUACAACAAGGCCAUUUUCUCAAACGAGAGUCAGCCUUUAACGAAAUGACCAUGGUUGACACAGAGAUGCCAUUCUGGCCCACCAACUUUGGGAUCAGCUCCGUGGAUCUCUCCGUAAUGGAAGACCACUCCCACUCCUUUGAUAUCAAGCCCUUCACUACUGUUGACUUCUCCAGCAUUUCUACUCCACAUUACGAAGACAUUCCAUUCACAAGAACAGAUCCAGUGGUUGCAGAUUACAAGUAUGACCUGAAACUUCAAGAGUACCAAAGUGCAAUCAAAGUGGAGCCUGCAUCUCCACCUUAUUAUUCUGAGAAGACUCAGCUCUACAAUAAGCCUCAUGAAGAGCCUUCCAACUCCCUCAUGGCAAUUGAAUGUCGUGUCUGUGGAGAUAAAGCUUCUGGAUUUCACUAUGGAGUUCAUGCUUGUGAAGGAUGCAAGGGUUUCUUCCGGAGAACAAUCAGAUUGAAGCUUAUCUAUGACAGAUGUGAUCUUAACUGUCGGAUCCACAAAAAAAGUAGAAAUAAAUGUCAGUACUGUCGGUUUCAGAAAUGCCUUGCAGUGGGGAUGUCUCAUAAUGCCAUUCGUUAUCUAUGACAUGAAUUCCUUAAUGAUGGGAGAAGAUAAAAUCAAGUUCAAACACAUCACCCCCCUGCAGGAGCAGAGCAAAGAGGUGGCCAUCCGCAUCUUUCAGGGCUGCCAGUUUCGCUCCGUGGAGGCUGUGCAGGAGAUCACAGAGUAUGCCAAAAGCAUUCCUGGUUUUGUAAAUCUUGACUUGAACGACCAAGUAACUCUCCUCAAAUAUGGAGUCCACGAGAUCAUUUACACAAUGCUGGCCUCCUUGAUGAAUAAAGAUGGGGUUCUCAUAUCCGAGGGCCAAGGCUUCAUGACAAGGGAGUUUCUAAAGAGCCUGCGAAAGCCUUUUGGUGACUUUAUGGAGCCCAAGUUUGAGUUUGCUGUGAAGUUCAAUGCACUGGAAUUAGAUGACAGCGACUUGGCAAUAUUUAUUGCUGUCAUUAUUCUCAGUGGAGACCGCCCAGGUUUGCUGAAUGUGAAGCCCAUUGAAGACAUUCAAGACAACCUGCUACAAGCCCUGGAGCUCCAGCUGAAGCUGAACCACCCUGAGUCCUCACAGCUGUUUGCCAAGCUGCUCCAGAAAAUGACAGACCUCAGACAGAUUGUCACGGAACACGUGCAGCUACUGCAGGUGAUCAAGAAGACGGAGACAGACAUGAGUCUUCACCCGCUCCUGCAGGAGAUCUACAAGGACUUGUACUAGCAGAGAGUCCUGAGCCACUGCCAACAUUUCCCUUCUUCCAGUUGCACUAUUCUGAGGGAAAAUCUGACACCUAAGAAAUUUACUGUGAAAAAGCAUUUUAAAAAGAAAAGGUUUUAGAAUAUGAUCUAUUUUAUGCAUAUUGUUUAUAAAGACACAUUUACAAUUUACUUUUAAUAUUAAAAAUUACCAUAUUAUGAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-486.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -518.24
Frequency: 0.0000
Diversity: 508.71
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((.(((((((...((((.(((((.(((((......(((..(((((.((....))))))).)))..)))))))))).)))).)))))))))))(((((((..((((.(((((((((((((....)))))).(((..((((......(((..........................))).....((((....))))(((((((.................))))))).))))..)))....((((((((.......)))).))))....((((.(((.(((.....))))))))))..........(((....))))))))))(((.((((.((..(((((.((((.....((((((.....(((((...(((..((((..((.....))..))))(((((..((((((((((((.((...((((...)))).(((.((((.((((.....(((((.(..((((((((..........((((....))))(((((.((..........)).))))).............(((((((......)))))))...))))))))..))))))..)))).)))).))))).))))))))))))....))))))))..)))))....((((...((((((((...((((((((......((((((((........)))).))))......)))))..)))...))))).)))...))))......((((((((((.(((((((((..((((((.....))))))....)))))...........((((((..(((............)))...).))))).))))))))))).)))(((((((..(((((((...............)))))))..))).)))).))))))...)))).))))))))))))))((((.....))))...(((((((((........(((((......)))))....((((........))))...)))))))))...........))))..)))))))...((((..(((((((((((......)))))))..((((((((((......((((.((((((.((........)).)))))).)))))))))))))).........(((.((.(((..(((((...(((((((((..(((((((((((..............))))))))))))))).))))).(((((.....)))))..(((((((..............))))))).(((...((((((((((((.((((.(((((((....)))).......(((((((.((((((((........)))))..........)))..)).)))))..((.(((.((((.....))))))))).(((((((.(.....((((((..............)))))).....).)))))))))).))))...)).)))))...)))))...))).)))))))).)).))).((((((((.....(((...))).....)))))))).(((((.((((......((((..(((......)))..))))......)))).)))))(((((............)))))(((((....)))))..............(((((....)))))....)))).))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(({(((((((((...((((.(((((.(((((.,,...(((..(((((.((....))))))).))).})))))))))).)))).))))))))))),,{,((,..{{(({(.(((((((((((....)))))}|||.,.{{({..,,..({{..........................)))..,..((((....))))(((((((.................))))))).,{{(({{,{{,,.|||{{{{{,,..,,,)))}.)),},,,.((((,(((,(((,...,))}}}}))}),|||,||||{(((..,,}|||.(((((((...(((((.......))))}......(((((((..{({..(((((((.,{({,...||.....,,...{(((((((..{{....((((..{.(((....})).).)))).,...)))))))}..((((((..,...,|||}}},{{,,,...{((((....))))),,,,.,,,,,,|,,.{((((.(((........)))..)))))}|,...)))))))}))}.))))))).,.{(((...(((((((({...))))))))).))))))))))).|||{{{({{{{{{,,..({{{,{...((((((((...{{{(((((......((((((((........))))}})))......)))))..}}}...))))).)))...))))}}))}}},)}}}||||,(({{(((((..((((((.....})}}}}....))})}...,{{{,...,,,,|}}}{,,,,,....,,...}},.....}}}}.,}}}{{{{{{||{{{.{,,,,{({{,((((,,..}})).)))}{(((((.{(,((((((((((((|.{{,{{(({{(((((.,.{{|{{,.,..,{,....{|||,.{{{{(,,.((((((((((((((((......)))))....((((........))))....)))))}..,)))))....||,||,({{((({{.{{{{,,.,,,,,(((((((......)))))))..(((((((({.....,{((((.((((((.({,,......)),)))))).))))))))))))))..,(((({(({.,(({,({{.,{|||..}||||,||||,.{((((((((((..,{..........)))))))))))))))}))),)})}.}}}}}}})),,}|||{{{{{{........,,|,,.}}})))),}....))))).})}})))))))}))...,...)))))))...}})))))}}{|||,{((((({{{{{...,}|||,||,,.....,||}}}...,)}}}}}).)))),,.,||.(((.(((((...))))).))).}}..{,,{|{{{{{{{........))))))..,.))))))))))),|,,{....(((((((,{....,,,..}))))))|.||..,,)).....{(((((((.....(({...})).....)))))))}.(((((.((((......{(({.,(({.....,))}..}}}}......)))).))))),{{{||,,,...,,,,,,,,|,{(({{....}}}}}.,,..,...,....,||{,,,,.,,,,......,.,.,,..,...
Back