Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001354919.2

Sequence Length

1170 nt

GC Content

0.4983

CUGUUUACCCAGGAGGGCUGUGCUGAUAGCACGUUCCUCGAGUUUACUUUGCUUUCCUUGAGUUUAUUGUAAAGGGGUAAAGUUUUCGGAUCCGUCACGUGACCCUGACAGGUCCUGCCUAUGGCGCGGCAGACCACCCACGCCGAGGGCCAUGGAACUGCUUAAUAGAAACAGGCUUGUAAUUGUGAGUCCGCGCUGCACUCCGCCGAAAGCCUCCGGCGGCCCAGCGCGCCGGGGUUUUUACACUUUCCGUUCCUUUUGUAAAGACGGAGGAGGAGGAGAAGAAGAAGAAGAAAACGGAGGAGAAGAAAAAGACGACAGGGGAGACAAAGAGACCCGCAGCGACAAGGCAAGGGGGAGACGAGGGAAGACUGGGAGAAGACGGAGGAGCGGAGGACGAGGAAAGGGGGGCCAGGGAAAAAAAAGGAAUUGAUGUGAAAUCCAAGCCCAGCGUCCGCGCCAUCGGCACCCGCGCUCCGAGCAGGGGUUGACGGCCGGCUAUGGGGAAGGCUACUGGCCGGAAAGCGCCGCUGUGGCUGAGAGCGAAGUUUCAGAGACUCUUAUUUAAACUGGGUUGUUACAUUCAAAAAAACUGCGGCAAGUUCUUGGUUGUGGGCCUCCUCAUAUUUGGGGCCUUCGCGGUGGGAUUAAAAGCAGCGAACCUCGAGACCAACGUGGAGGAGCUGUGGGUGGAAGUUGGAGGACGAGUAAGUCGUGAAUUAAAUUAUACUCGCCAGAAGAUUGGAGAAGAGGCUAUGUUUAAUCCUCAACUCAUGAUACAGACCCCUAAAGAAGAAGGUGCUAAUGUCCUGACCACAGAAGCGCUCCUACAACACCUGGACUCGGCACUCCAGGCCAGCCGUGUCCAUGUAUACAUGUACAACAGGCAGUGGAAAUUGGAACAUUUGUGUUACAAAUCAGGAGAGCUUAUCACAGAAACAGGUUACAUGGAUCAGAUAAUAGAAUAUCUUUACCCUUGUUUGAUUAUUACACCUUUGGACUGCUUCUGGGAAGGGGCGAAAUUACAGUCUGGGACAGCAUACCUCCUGUAAGUGUGUGAUCAUGCUUUCUGAUGUCUGUGACUUCUCUAGGACUCAGUGUUUCUAAUGUUGCUUAUCAUUGUUUGUUCCAUUUCAGUUUUGAACAAGAAAUAAAAACAUUGAAAUUCCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-362.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -384.07

Frequency: 0.0000

Diversity: 450.50

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(((..(((((((((((.((((((...)))))).)))))((((((((((((((..((((............))))))))))))((((((.(((.((..((..((((..(((.(((.((((.(((((.((........)).))))).))))...))).)))...............(((((..((((.......((((((.((((.(((((((((.((((((((...)).)))))))))))).....(((((.((((((((((....))))))).))))))))...............))).))))...............(((............))))))))))))).)))))))))..)))).)))...)))))).....(((((..((((..(.(((((....(((.((..(((........(((.((......)).)))...))).)).)))...)).))).)..)))).)))))(((.((.(((..(((((((...(((......))))))))))...))).)))))....((((((......)))))))))))).........))))))....))).........((((((((((.(....).))))(((((.((........))))))).))))))((((((..(((((((((((((.(((.((....((((((((((((((..(((.(((((.((.((((((.................)))))))).........(((..((((...........))))..)))............(((........)))..))))).)))...))))))((((.(((((......((((((........))))))((((((((((.((((....)))).)).)).)))..)))...(((..(((....)))..)))...))))).)))).(((((((..((((...((((((((((((((((((.....))))...))))))))))((((((((((.(((.(((((((.(((..(..........)..))).))).))))....)))...))).)))))))))))...))))...))))))))))))))))).))))).)))).....))))))).(((.(((((.....(((((.(((...)))..)))))..))))).))))))))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

,{({{{.{{((((((((.((((((...}))))},||}}},,,...{(((((((.,((((............}))))))))))}.|||({,(({{(({.,...,|,}}}|,|}|||.((((.(((((.((........)).))))).))))...))},))}||.........|,{{({{{,..,,.,}}||||,((((((.((((.(((((((((.((((((((...)).)))))))))))),...,(((((.((((((((((....)))))))})},))))).,.............))).))))...............(((............))))))))).}.,}}},|}}}}}},.|}}||,....))}}}...}}}|||,{,.(((((((.(({({,.,((((((({.,{{........{{,.{{,,{,{,||{|||,,{|||{{{{,|{({{((.{((((.{((||{{|,,.,}}.)))))}}},}}(((({(((((,,..,,|||,}||||||,,.}}|||||}|,}}||(((({,....}}}}}}.|,|||,,........}))))).}}}}},,,,.....||,}}}}}.,,)))}}}})),)})})))))),,,,,}}}|,,|||||||,,{(({{({..,{({{{{{,,{{{,|{,.||..,.||||||,|{{(((|,,{{{.((({{.((.((((({..,.,|.......,,,.)))))))).....,{||(({..(({{.,,....},,,))))..))).,},}.,,.,||||{......,.}))}}))},|{||||..|},}|}{(((,{((({......((((((........))))))(({((({(((.((((....)))).))},}.)))..}))...{{{..{{{.,,,|}},.)}}.,,}}}}),}}}}.{|||||{.,{(((,..{{{{((((((((({..{,.....,,},,..)))))))))),,,,,||||,.|||.|{|||||.||.,))))),...,|||||))}|||,,}}}}..}})}))},}||||||}}}}))))}},)))|.,|})),}}|))))))},))}))))).||||,.,,{|||,,||.{|{,{{((({{{{.{.,,,....,,)))}}}},,,},,,))))})))))}}}}.