Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001354991.2
Sequence Length
1275 nt
GC Content
0.5365
ACGCGCGGGGGCGCCCCUGCCCACCGCUCCCGGCAGGGCUUUUGGUGGCCAUGGGGGAUAAGGGGCGUUGACUCACCCGGGCGGGGCUCCGGGAGUUGCACAGACCAAGGCCCUGUGCCUCCCUCUACAGCCCUCAGGGAGCUCAUUGAGGAGCUGGUCAACAUCACCCAGAACCAGAAGGCUCCGCUCUGCAAUGGCAGCAUGGUAUGGAGCAUCAACCUGACAGCUGGCAUGUACUGUGCAGCCCUGGAAUCCCUGAUCAACGUGUCAGGCUGCAGUGCCAUCGAGAAGACCCAGAGGAUGCUGAGCGGAUUCUGCCCGCACAAGGUCUCAGCUGGGCAGUUUUCCAGCUUGCAUGUCCGAGACACCAAAAUCGAGGUGGCCCAGUUUGUAAAGGACCUGCUCUUACAUUUAAAGAAACUUUUUCGCGAGGGACAGUUCAACUGAAACUUCGAAAGCAUCAUUAUUUGCAGAGACAGGACCUGACUAUUGAAGUUGCAGAUUCAUUUUUCUUUCUGAUGUCAAAAAUGUCUUGGGUAGGCGGGAAGGAGGGUUAGGGAGGGGUAAAAUUCCUUAGCUUAGACCUCAGCCUGUGCUGCCCGUCUUCAGCCUAGCCGACCUCAGCCUUCCCCUUGCCCAGGGCUCAGCCUGGUGGGCCUCCUCUGUCCAGGGCCCUGAGCUCGGUGGACCCAGGGAUGACAUGUCCCUACACCCCUCCCCUGCCCUAGAGCACACUGUAGCAUUACAGUGGGUGCCCCCCUUGCCAGACAUGUGGUGGGACAGGGACCCACUUCACACACAGGCAACUGAGGCAGACAGCAGCUCAGGCACACUUCUUCUUGGUCUUAUUUAUUAUUGUGUGUUAUUUAAAUGAGUGUGUUUGUCACCGUUGGGGAUUGGGGAAGACUGUGGCUGCUAGCACUUGGAGCCAAGGGUUCAGAGACUCAGGGCCCCAGCACUAAAGCAGUGGACACCAGGAGUCCCUGGUAAUAAGUACUGUGUACAGAAUUCUGCUACCUCACUGGGGUCCUGGGGCCUCGGAGCCUCAUCCGAGGCAGGGUCAGGAGAGGGGCAGAACAGCCGCUCCUGUCUGCCAGCCAGCAGCCAGCUCUCAGCCAACGAGUAAUUUAUUGUUUUUCCUUGUAUUUAAAUAUUAAAUAUGUUAGCAAAGAGUUAAUAUAUAGAAGGGUACCUUGAACACUGGGGGAGGGGACAUUGAACAAGUUGUUUCAUUGACUAUCAAACUGAAGCCAGAAAUAAAGUUGGUGACAGAUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-489.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -510.20
Frequency: 0.0000
Diversity: 340.41
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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