Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001355009.2

Sequence Length

1513 nt

GC Content

0.3979

CUUUCCCUGGUGUGAUUCCGUCCUGCGCGGUUGUUCUCUGGAGCAGCGUUCUUUUAUCUCCGUCCGCCUUCUCUCCUACCUAAGUGCGUGCCGCCACCCGAUGGAAGAUUCGAUGGACAUGGACAUGAGCCCCCUGAGGCCCCAGAACUAUCUUUUCGGUUGUGAACUAAAGGCCGACAAAGAUUAUCACUUUAAGGUGGAUAAUGAUGAAAAUGAGCACCAGUUAUCUUUAAGAACGGUCAGUUUAGGGGCUGGUGCAAAGGAUGAGUUGCACAUUGUUGAAGCAGAGGCAAUGAAUUACGAAGGCAGUCCAAUUAAAGUAACACUGGCAACUUUGAAAAUGUCUGUACAGCCAACGGUUUCCCUUGGGGGCUUUGAAAUAACACCACCAGUGGUCUUAAGGUUGAAGUGUGGUUCAGGGCCAGUGCAUAUUAGUGGACAGCACUUAGUAGCUGUGGAGGAAGAUGCAGAGUCAGAAGAUGAAGAGGAGGAGGAUGUGAAACUCUUAAGUAUAUCUGGAAAGCGGUCUGCCCCUGGAGGUGGUAGCAAGGUUCCACAGAAAAAAGUAAAACUUGCUGCUGAUGAAGAUGAUGACGAUGAUGAUGAAGAGGAUGAUGAUGAAGAUGAUGAUGAUGAUGAUUUUGAUGAUGAGGAAGCUGAAGAAAAAGCGCCAGUGAAGAAAGGACAAGAAUCCUUCAAGAAACAGGAAAAAACUCCUAAAACACCAAAAGGACCUAGUUCUGUAGAAGACAUUAAAGCAAAAAUGCAAGCAAGUAUAGAAAAAGCGCAUUGAACAGUCCUGGGCACUACAUGUAAAUUAAGCCCAAAGAUGGGGAGAAAGGAAAAGGAGAGACAAAUAUAGUCCAUACUGAGUGUCAUCAACAAUCCAGACUGAAGUCUUCUAUUUUAAUCUCAAUCCCCUUUUCUGAUUUGCCACCCAUGCCUCUUCAGGCUGGAAACAAUCUCUUGGUUCCCUAAAGCACUUUCUUCUGACUGCUGUGAUUCAGUGAACCUUGCCCUUUGCUUUCUAUUACUUGUGCAUUUGCCUCACCUGACAAUGUUUUAAAUCGCCUUUGUAUCUCCUUAGCUGCUCAAUAAAUAUUUGAAUGCAUCAAUUAAGAAUGUAUGUGACAAUAAUUUUGAAAUGGAAAUUGUGAGGUUUAUUUUACUAGGUUAUUGGAGGCAGUUAAGUUUCUUAAUGCUAUACCUGAUUCUGCCAAAGUCCCUUGGACAUUUGAAAACCUUUUCAAUCUUUUAAAAAUGCAUAAAAGAUACUUAGAGGGAAAGGUAUUAAUUAAAUUUAGUAAAAACAAAUAUAUUCAAUGCUUUAAAUUCCAAAGUAGUGAUAAAUACAAACAUUUCAAGAUAUUUGCAAUAGUAAUGUUUUGAAAUUUUGGUUACAAAGUCACAGGUCUUGCCAAUACUGUUGUAGUUUCUUGCCUAUAUCCGUAAUUUGAAGGAAAUGGUGAGAGUGAUUAGAGAAGUGUAAUUACUGUAAUUUUUUCCCCUAUUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-377.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -409.50

Frequency: 0.0000

Diversity: 291.22

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((.....(((((((((.(((((.....(((((((....)))))))....(((((((...(((((((((.............((.((((...(((..(((........))).))).)))).))....(((......)))....((...((((((((((((..........)))))).))))))..)).....)))))))))...)))))))....((((((((..(((....((((.....))))))).))))))))..))))))))))))))......))))...((((((.(((((((((((((.(((((.((((.((..(((((((.............((((...(((((.((.(((.((((((((.(.(((............))).).))))))))..))).)))))))))))))))))).)).))))))))).)).))).((((((...(((((.(((((((((.(((((.((..((..((((.(((((((.......((((((....((((((((((..((((((....)).))))(((((((((..(((((.(((((.......(((...(((.((((.(((...........(((((((((((((.((.(((((.((.......)).))))).)).))..((..(((........))).))........(((((......)))))......((((((......((((...........)))).....)))))).............(((....)))..((((((.(((((((.............(((.(((((................)))))..)))(((((...(((((((...(((((.....(((((.....(((......)))........)))))..)))))...))))..)))...))))))))))))))))))....))).))))))))...........))))))).)))......)))))))).)))))...((((.....)))))))))))))...)))))))))).))))))))))))).))))..))....)).)))).....).))))))))))))))))))))((((.......))))(((((((......).))))))(((((.((((((((......))))))))........((((((((((((...((((((......))))))((((...((((((........((((((((...)))).))))....(((((...((((((((........))))))))....)))))...))))))..))))))))))))))))..........(((.((((((.......)))))).)))......((((.(((((((((((((.((....)))))))))))))))))))........))))).(((...)))........)))))))).))))))................(((((.(((.(.((((((((.(....).)))))))).).))).))))).......

Thermodynamic Ensemble Prediction

.,{{.....(((((((({{(((((,.((.{((((((....)))))))}}.,(((((((...(((((((((.............((.(((({{{{{{..(((........))).))).},))},),}|.(((......)))....{,...((((((((((((.,......,.)))))).))))))..,,.....)))))))))...)))))))....((((((((..,(({...((((.....))))))))))))))))..))))))))))))))...,..}}}}...((((((.(((((((((((((.(((({,((((.{{..(((((((...,,,,,.....{(({...((((,,((.(((.((((((((.(.{((............))).).))))))))..))).)))))))))))))))))).,}.))))))))).)).}},,((((((,..{(((,,(((((((((.{((((.((,.((..((((.{((((((.......((((((....{(((((((({..((((((....)).))))(((((((((..(((((.{((({......{{{{...(((.((((.(((...........(((((((({((((.((.(((((.((.......)).))))).)).))..((..(((........))).)).,,...{,{((((......)))))}.....,,((((......||||...........||||,...|||||||......,......(({....}))..((((((.{((((({.,.,,........}||,(((((................))))}...,,(((((,..,((((((({{(((((.....(((({....,{{,.|||..,,,........))))}..))))})).))))..}))...)))))))))))}))))))....))).))))))))...........))))))).)))......)))))))).)))))...({{{.....)))))))))))))...,))))))))).))))))))))))}.))))..))....}).)))).....}.))))))))))))))))))))|(((.......)))}{((((((......),}))))}(((((.((((((((......))))))))...{{{,.{(((((((((((...{{,(((,.,{{{|,,,))}}}}}}}{(((((..,{{...((((((((...)))).))))....(((((,,.((((((((........))))))))....}))))}},))))))..,,..))))))))))))...,,,....(((.((((((.......)))))).)))...,..((({.((((((((((({({((....)))))))))))))))})))..,.,...))))).(((...)))....,,.})))))))).))))))................(((((.{((.{.((((((((.(....).)))))))).}.))).))))).......