Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001355034.2
Sequence Length
1283 nt
GC Content
0.4357
AUUCUCCUGGCAGCCCCCGCCCGCCCCGCCAGGGGGAGCGUCUGCGCCCGACGUAGGCUGCGGGGCCUGGGCUGGCGGCGCAGGGCGGUGACUCGGCUCGGUGGCUGCCCUCCCGCGUCCCCACCCCCUCCCCGCCCGCCCCCGGCGCGGCCCUGCCCGCCCCCUCCGCCCCCUCCCGCAGCGCCAUGCGCAGACUCAGUUCCUGGAGAAAGAUGGCGACAGCCGAGAAGCAGAAACACGACGGGCGGGUGAAGAUCGGCCACUACAUUCUGGGUGACACGCUGGGGGUCGGCACCUUCGGCAAAGUGAAGGUUGGCAAACAUGAAUUGACUGGGCAUAAAGUAGCUGUGAAGAUACUCAAUCGACAGAAGAUUCGGAGCCUUGAUGUGGUAGGAAAAAUCCGCAGAGAAAUUCAGAACCUCAAGCUUUUCAGGCAUCCUCAUAUAAUUAAACUGUACCAGGUCAUCAGUACACCAUCUGAUAUUUUCAUGGUGAUGGAAUAUGUCUCAGGAGGAGAGCUAUUUGAUUAUAUCUGUAAGAAUGGAAGGCUGGAUGAAAAAGAAAGUCGGCGUCUGUUCCAACAGAUCCUUUCUGGUGUGGAUUAUUGUCACAGGCAUAUGGUGGUCCAUAGAGAUUUGAAACCUGAAAAUGUCCUGCUUGAUGCACACAUGAAUGCAAAGAUAGCUGAUUUUGGUCUUUCAAACAUGAUGUCAGAUGGUGAAUUUUUAAGAACAAGUUGUGGCUCACCCAACUAUGCUGCACCAGAAGUAAUUUCAGGAAGAGACUGCAAUAUUAUAAGAAUUUUAACCUCUCAAUUUACUAACUACCAGCAUUGAGAACAUGAAGAUAUUUGUACAGUGUCGCUUUUUGAAUAGUUUGGAAAACAGGAGAAUUUAAUAUUUUUAAGAAUAACUCUUUGUCCUUCACUAUACUACUGAAAUUGAAAACAGAAGCUGAAGUUUGCUAGAUUUAUAAUGAACUUUUAAUAACUUUUCACCCAAACCAUGCUUAUUUGUGUGAAUGUUUUGCAUCUUGAUUAACUCAAUGCAGAAAUACUGUAGUAUUUUCUAUUUUUAUAAGCUUGUUGGCCUAGACUGCUCAAAGAAAUGAGAUUUGUGUAAAAAUAUGGCUGUGAGUAAGGCAGGAGUACCUAAUUUUAGAUUUGUCAAGUUUCAUCUUUUUUUUAAAUAUUAACUUAAUGUCAAAAAUUAUUUAAAAAAUUUUUAAAAAAAUGGUGUUGUCUAUCUUAAUUCUUUUAGGAAUAAAACAAUUCAGGACAUGGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-362.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -387.50
Frequency: 0.0000
Diversity: 359.42
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((((((.((........))...))))))))))..((((((((.....((..(((((((((...((((.(((((.(((((((((.(((.(((...(((....)))...))).))).))..........((((((....))).)))))))))))))))......))))..)))))))))))...))))))))(((..(((((((..((((((((((((.((....(((((.....((((((((..((((((((.((..((((((...(((((((...(((((((((....)))))))))..((((((((..(((.....((((((..(((.......((((.((....)).)))).......)))..))))))..)))...........(((....)))(((((((.((((.....(((..(.(((((((((....(((.........(((((((...(((.(((((.((((((((((((...((((((((((.(((((..((((.....))))..))))).)))))((((((..(((((((..(((((.............))))).)))))))..))))))....(((..((((((((((((((...))))....)))))))))).)))(((((((((.(((..((((.(((((.(((....))).)).)))..)))).....))).)))..)))))))))))))))))))))))((((((((..((...((((((((((..((.....((((........))))......))..))).))))))).)).))))))))......(((((((...((.......)).))))))))).))).)))....))))))).........)))...))))))))).)..)))...((((.....))))))))...)))))))))))))))...((.(((..........))).))..((((((((.((......)).))))))))..........)))))))...(((((......)))))....((((((((..(((.....)))))))))))....))))))....)).))))))))..)))))))).......)))))....(((((..(((..((.(((((.((.((((((.......)))).....)))).))))).))..)))..)))))....((((((((((.(((.....((((........)))).....))).)))))))))).))))))).))))))).(((((....))))).......)))))))..))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,{{(((((((.{({{{{....||...)},,))))).|,((((((((.....{{..(((((((((...((((.(((((.(((((((((,(({.{((...(((,{..|}}...}}).))).))}}}.,....,{(((((,,..})),)))))))))))))))......))))..})))))))),}...)))))))).,.(((((((((((((((((((((({,((,.{,{(({(.....((((((((,,((((((((,({,,({{{{{...{{(((({...(((((((((....)))))))))..((((((((..(((...,.((((((..(((...,,..((((.((....)).))))..,,...)))..)))))},.}}},{,,({(((,.,,,....,))}|}{{{,..,,,.....|||..{,{{{{{{{||.,..,,,.........{((({{{.,.{{{.{(({{.((((((((((((...((((((((((.(((((..((((.....))))..))))).)))))((((((..(((((((..(((({.{...........))))).)))))))..))))))....(({..((((((((((((({...}))}...,)))))))))).})}{(((((({(.,({,,{{{{,{((({.,(({{..,,,.,,})))..)}})}...})))}))}.,)))))}))))))))))))))))),{{{{{{{..,...,(((({(({{{.,||,,,,.{(((......,.}))}..,,,,||,,|}},|}}}}}}.,|.|||}}|||,,....(((((((...,,.......}}.))))))),,.})),))).,},))))))),,,.,},,,)))}.,}))))),,,.||{|||.,,{{...,.,,}}},}}},..,)))}}}}))))))))...{{.(((..........))).}}..((((((({.((......)}.}))))))).......,,,))))))}...(((((......)))))....{(((((({.,(((.....))))))))))},,,.}))}))....}},})}}}}}}..)))))))),,.,...}}}|||{,((,.{(({{(((({..,,{||,||,.,|{{|,,,,.,}))}},.,,.}}},.,},)),,,.,,,)}})))))}}})}|{((((((({(,,.....,,,|........))))}}}}}}},,|},,,,,},,,))))))),)}))))}..,))}}))))))))........,})))}...,,.
Back