Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001355139.2

Sequence Length

1944 nt

GC Content

0.6548

ACCUUCCCGGAACGCGCUCGGGACGCUCUGGACCCAGCGGGGACUGCCCGGGGGCCGCGCAAGGCGAAGGCGCACCCGCCGAUACGCGCGCGGAGCUGCGGCCCCAGGGACCCCGCGUCCCAGCCAGUGCCCCCCGACCCGCCCGGGGACUCUCGGGUCCCGCCCGUCUGACCCCCCAAGUGUUGGGAAACGGGGCCGAGCUGCCUGGGUCCUCCGGAAGAGAAGACACCGCGGAGGCGUGCCGGAGUUCAGGGCGCCGCCCGGCUAAUUGGCUGCGUGCUCCUCCUGGACCUGCCUCUUCUCGACUUUAAGAAGCGAUGAGAGAGGUCCAGCCGCCGCAGGGAAUGACGCCGGUGCUCCUGCAGCCACGGCUCCGGGCGGGGAAGGCGAGCCCCACAGCCGGCCCUGCGACGCCCGCCUGGGCAGCACCGAUAAGGAGCUGAAGGCAGGAGCCGCCGCCACGGGCAGCGCCCCCACAGCGCCAGGGACCCCCUGGCAGCGGGAGCCGCGGGUCGAGGUUAUGGAUCCAGCGGGCGGCCCCCGGGGCGUGCUCCCGCGGCCCUGCCGCGUGCUGGUGCUGCUGAACCCGCGCGGCGGCAAGGGCAAGGCCUUGCAGCUCUUCCGGAGUCACGUGCAGCCCCUUUUGGCUGAGGCUGAAAUCUCCUUCACGCUGAUGCUCACUGAGCGGCGGAACCACGCGCGGGAGCUGGUGCGGUCGGAGGAGCUGGGCCGCUGGGACGCUCUGGUGGUCAUGUCUGGAGACGGGCUGAUGCACGAGGUGGUGAACGGGCUCAUGGAGCGGCCUGACUGGGAGACCGCCAUCCAGAAGCCCCUGUGUAGCCUCCCAGCAGGCUCUGGCAACGCGCUGGCAGCUUCCUUGAACCAUUAUGCUGGCUAUGAGCAGGUCACCAAUGAAGACCUCCUGACCAACUGCACGCUAUUGCUGUGCCGCCGGCUGCUGUCACCCAUGAACCUGCUGUCUCUGCACACGGCUUCGGGGCUGCGCCUCUUCUCUGUGCUCAGCCUGGCCUGGGGCUUCAUUGCUGAUGUGGACCUAGAGAGUGAGAAGUAUCGGCGUCUGGGGGAGAUGCGCUUCACUCUGGGCACCUUCCUGCGUCUGGCAGCCCUGCGCACCUACCGCGGCCGACUGGCCUACCUCCCUGUAGGAAGAGUGGGUUCCAAGACACCUGCCUCCCCCGUUGUGGUCCAGCAGGGCCCGGUAGAUGCACACCUUGUGCCACUGGAGGAGCCAGUGCCCUCUCACUGGACAGUGGUGCCCGACGAGGACUUUGUGCUAGUCCUGGCACUGCUGCACUCGCACCUGGGCAGUGAGAUGUUUGCUGCACCCAUGGGCCGCUGUGCAGCUGGCGUCAUGCAUCUGUUCUACGUGCGGGCGGGAGUGUCUCGUGCCAUGCUGCUGCGCCUCUUCCUGGCCAUGGAGAAGGGCAGGCAUAUGGAGUAUGAAUGCCCCUACUUGGUAUAUGUGCCCGUGGUCGCCUUCCGCUUGGAGCCCAAGGAUGGGAAAGGUGUGUUUGCAGUGGAUGGGGAAUUGAUGGUUAGCGAGGCCGUGCAGGGCCAGGUGCACCCAAACUACUUCUGGAUGGUCAGCGGUUGCGUGGAGCCCCCGCCCAGCUGGAAGCCCCAGCAGAUGCCACCGCCAGAAGAGCCCUUAUGACCCCUGGGCCGCGCUGUGCCUUAGUGUCUACUUGCAGGACCCUUCCUCCUUCCCUAGGGCUGCAGGGCCUGUCCACAGCUCCUGUGGGGGUGGAGGAGACUCCUCUGGAGAAGGGUGAGAAGGUGGAGGCUAUGCUUUGGGGGGACAGGCCAGAAUGAAGUCCUGGGUCAGGAGCCCAGCUGGCUGGGCCCAGCUGCCUAUGUAAGGCCUUCUAGUUUGUUCUGAGACCCCCACCCCACGAACCAAAUCCAAAUAAAGUGACAUUCCCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-906.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -939.29

Frequency: 0.0000

Diversity: 596.19

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

........((((.(((((((((.(.(((((((((((((((((.....((((.(((((((..(((((..((((....))))....)))((((((.((((((((((((((((((((((((((((((...(((((((.((((((((((.((.(((((((((((((....(((((((......).))))))...)))))))(((((.((.((..((((((...............))))))....))))))))).((((((.(((((......((((.(((.(((((((((((((((..(((((.(((.(((....)))))).)))))))))))((((((.((((((....((....))..)))))).))...))))(((((((((....(((.(((........)))..)))....))))))))).((((.((.....)).)))).))).))))))))).))))))))).)))))).......(((((((...)))))))..)))))))).)))).)).))))..))..((((((.(((((....(((((.(((....))))))))))))).))))))((((((((........)))))))).))))).((((...(((((((((((((((((.((.(((((......)))))..)))))...))))....(((....((((.(((.(((.........))).)))))))....)))...))))))))))))))))))))))))...)).))))...........((((((((.((((((((.((((...(((((..((((((((.((.......)).))))..))))..))))).(((((((.....(((((((.(((((..((((((((((((((....(((....)))....)))).(.((.(((((.........))))).)).)......((((((....)).)))).)))))).)).))...))).)).)))))))...)))))))(((((....))))))))).))))...)))))))))))).)))))))))........(((((((((((((((.....(((((....((((((.....))))))))))).))))))).....))).)))))..))))).))))))..))..)))))))..))))(((((......))))).((.((((((........)))))))).)))))))).))))))).)).))))).(((..(((((...)))))..)))((((((((((((......)))))).((((((((((.....((((((.......))))))))))))))))....(((((..((((((((.((((((.(((((((....((....))))))))).))))))...)).))))))...)))))((((.(((...))).))))..((....))..(((((((...((((((((..((((((((..((((.(((((.(((((.......))))).)))))))))((.......)).((((.(((((.(((..((((((((.((.((((((((((((.....(((((.((((((((.((((...(((((..(((.((..........(((((((.((((..(((.((((.(((.((..((((...)).))..)).))))))).))).))))))))))).)))))......))))))))).))))).)))))))))))))).))))))))))))..))))..))).))))).))))))))))))....)))).))))....))))))).))))))((((....(((......((((.((........((((((..((((.((((..((((.((((((.(((..((((((....))))))....)))))).....))).))))...)))).))))...))))))))))))..)))...)))).....)))).).))))..

Thermodynamic Ensemble Prediction

..,,{{{{((,..{{(({((((.(.(((((((((((((((((....,((((.(((((((..{((((..((((....))))....)))((((((.((((((((((((((((((((((((((((((({((,,((,(((((({((({(((,,..{{((((({{{(||||.,,|,{,,|,,,.}.,}))))...}}))||}|||,|,|}}|}}},(((((((((((......{(((((((((((.((((.,....((((((.(((((......((((.(((.(((((((((((((((..(((((.(((.(((....)))))).))))))))))){(((((.((((((....((....))..}))))).)}..,)))|(((((((((....(((.(((........))).}}))....))))))))).((((.((.....)).)))).))).))))))))).))))))))).)))))).....(((((((((...))))))).))(((.((((((((((.(.....).))))).))}}}},,))))))).)))).))}}})))|{{{(((((((((,.(((........)))}))))))))||{{||,,....}}))))..))))))))))},{,,{{,(((((,,..,,|||||{{|,,|,...}..}}}}),||},,.((((...}}|||{{{......))).}))),))}})})})))))).)).))))},,.))))))))))...)).))))..,{{....,,|(((((((.((((((((.((((..,(((((,.(((((((({((....,}},}.))))..)))),,||||}.(((((((.....(((((((.(((((..{((((((((({(({....,{...,.....|,|}}},.,.||,{((((.........))))).}).,.,....((((((....)).)))).)))))).)),))...)}}.)).)))))))...))))))){||||,,,,)}))))))).}})),,.)))))))))))}.)))))))))......,.((((((({((({{(({{(({{.{((,,,.{({{{{.....})))))}}))))))))))).....))).))))).}))))).))))))..))..)))))))..)}))(((((......))))).,(,((((((........))))))})})))))))).))))))).)).)))))}|||..(((({...|}))|,,}}|||||}|((((((......)))))).((((((((((.....((((((.......))))))))))))))))..({(((((.{((((((((.((((({.(((((((....{|....,,))))))).))))))...)).)))}}),}.))))))),({((({{{|,|.,,||,{(({{{,((((((.(((((,,((.(((.,.,((((,(((,(((((.(((({.(((((.......))))).}))))))))))))))))|||,||,}}},})}).)}..)))})))))))},..))}}||{||}|((..{{,.{(({,,{,{(((((((((.((.(((((.(({......((.(((((((.((((..(((.((((.(((.((..({({...}}.))..)).))))))).))).)))))))))))))......)).).))))).)))))).}.))))|(((.(((((((.....(((((({{(((,((((((((((((..(({....,)).)))).)))).))))}.||||||..{|||,,,))))})))))....))))))).)))}.,,..((((((..((((.((((.,((((.(((((({{,({.((((((....))))))}}..,,)))).....})).))))...)))).))))...)))))},,))}},},)),.}))).......},)})}))))}.