Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001359230.2

Sequence Length

2233 nt

GC Content

0.7009

GCGCCGCGCUGGGGCUGGGCUUGGAGCGCGCGGAGCUCGGCUGCCAGAGAGCCGCGCGGGGGACGCGCCGGGACCGCGAGGAGCGCAGGAGCCUUCGAGGCGGUGAACGAGGGAGGGAGCCCAGUCCGCCGCGGGCCAUGAGCCACCGGGCCCGGGGAGCCCGGCCGCGGUCCGGGCAGCGCUCAGCCGGCGCCCCAGCCCGCUCGGCCGCAGCUGCGCGCCUGUAGCCGCAGGUGGCUGCGAUGGGACGGAAGCCAUGAAUGGUGCCGGCCCUGGCCCCGCCGCAGCCGCCCCGGUCCCAGUCCCGGUCCCGGUCCCGGACUGGCGGCAGUUCUGCGAGCUGCAUGCGCAGGCGGCCGCCGUGGACUUUGCGCACAAGUUCUGCCGUUUCCUGCGGGACAACCCAGCUUACGACACGCCCGACGCCGGCGCCUCCUUCUCCCGCCACUUCGCCGCCAACUUCCUGGACGUCUUCGGCGAGGAGGUGCGCCGCGUGCUGGUGGCUGGGCCGACGACUCGGGGCGCGGCCGUGAGCGCAGAGGCCAUGGAGCCGGAGCUCGCGGACACCUCUGCACUCAAGGCGGCGCCCUACGGCCACUCGCGGAGCUCGGAGGACGUGUCCACGCACGCGGCCACCAAGGCCCGCGUUCGCAAGGGCUUCUCGCUGCGCAACAUGAGCCUGUGCGUGGUGGACGGCGUGCGCGACAUGUGGCACCGGCGCGCCUCGCCCGAGCCCGACGCGGCAGCUGCCCCGCGCACCGCCGAGCCCCGCGACAAGUGGACGCGGCGCCUGAGGCUGUCGCGGACGCUGGCUGCCAAGGUGGAGCUGGUGGACAUUCAACGCGAGGGGGCGCUGCGCUUCAUGGUGGCCGACGACGCGGCCGCGGGCUCCGGGGGCUCGGCUCAGUGGCAGAAGUGCCGCCUGCUCCUGCGCAGGGCUGUGGCCGAGGAACGCUUCCGCCUGGAGUUCUUCGUGCCGCCCAAAGCCUCCAGGCCCAAGGUCAGCAUCCCACUGUCAGCCAUCAUUGAGGUCCGCACCACCAUGCCCCUGGAAAUGCCAGAGAAGGAUAACACAUUCGUCCUCAAGGUAGAGAAUGGAGCCGAAUACAUCUUGGAGACCAUCGACUCUCUGCAGAAGCACUCGUGGGUAGCUGACAUCCAGGGCUGCGUGGACCCCGGUGACAGUGAGGAAGACACCGAGCUCUCCUGUACCCGAGGAGGCUGUCUGGCCAGCCGCGUGGCCUCCUGCAGCUGUGAGCUCCUGACUGAUGUCGACCUGCCCCGCCCCCCAGAGACGACAGCCGUGGGUGCAGUGGUGACAGCCCCCCACAGCCGAGGUCGAGAUGCCGUCAGAGAAUCCCUGAUCCACGUCCCGCUAGAGACCUUUCUGCAGACCCUGGAAUCCCCGGGCGGCAGCGGCAGUGACAGCAAUAACACAGGGGAACAGGGUGCAGAGACGGAUCCCGAGGCUGAACCCGAGCUGGAGCUAUCCGACUACCCAUGGUUCCACGGGACACUGUCCCGGGUCAAGGCUGCUCAACUGGUUCUGGCAGGGGGGCCCCGGAACCACGGCCUCUUCGUGAUCCGCCAAAGUGAGACUCGGCCUGGGGAGUACGUGCUGACCUUCAACUUCCAGGGCAAGGCCAAGCACCUGCGCCUGUCCCUGAACGGCCACGGCCAGUGUCACGUACAGCAUCUGUGGUUCCAGUCUGUGCUUGACAUGCUCCGCCACUUCCACACACACCCCAUCCCACUGGAGUCAGGGGGCUCGGCCGACAUCACCCUUCGCAGCUAUGUGCGGGCCCAGGACCCCCCACCAGAGCCGGGCCCCACGCCCCCUGCCGCGCCCGCGUCCCCGGCCUGCUGGAGCGACUCGCCCGGCCAGCACUACUUCUCCAGCCUCGCCGCGGCCGCCUGCCCGCCUGCCUCGCCCUCCGACGCCGCCGGCGCCUCCUCGUCUUCCGCCUCGUCGUCCUCUGCCGCGUCGGGGCCCGCCCCCCCGCGCCCCGUCGAGGGCCAGCUCAGCGCGCGGAGCCGCAGCAACAGCGCCGAGCGCCUGCUGGAGGCCGUGGCCGCCACCGCCGCCGAGGAGCCCCCGGAGGCCGCGCCCGGCCGCGCGCGCGCCGUGGAGAACCAGUACUCCUUCUACUAGCCCGCGGCGCCGCCCGGGUGGGACACGCCAAGCUCUUCAGUGAAGACACGAUGUUAUUAAAAGCCUGUUUUAGGGACUGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-1094.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -1132.29

Frequency: 0.0000

Diversity: 357.96

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((((((((..(((((((((...((((((.(((((.((((....((..(..(((((((((..(.((.(((.((.(((.(.(.(((((.(.(..((((((((...((((((.(((..(((.(((((((((.(((((..((......(((.((((((....((((.(((((..((.(((.(....(((((((((((..(((((.(((((((..(((((.((.....)))))))))))))).).))))..))...........))))))))))))).))..))))).)))))))))).)))..))..))))))))...))))))((((((.(((..(((((..(((.((((((((((((((.((((.............(((((((........)))))))....(((((..((.(((((........(((((..((((((((((......((...(((......))).))....))).))))))).)))))))))).))..)))))(((((.......(((((((.(((.((((.(((((((...((((((....)))).))....))))))).)))).))).))))))).)))))..((((((.((((((.(((((((((..(((((((.(((((((((((.((.(((((((.(((...)))..)))).))).)).)))).....)))))).).))))))).)))))))(((..(((.(((...)))))).)))...(((((........)))))..)).)))))).))))))..((((..(((((((((...))).))))))..))))(((((...((((((.((((((.....(((.....))).(((((...(((((((.(..(((((..(((((((.(((((....((((((((((((((.((((((....))))))((((......))))(((((((((((.((((...))))((((((((..(((.(.......).))).))))))))..(((((((((.(((((((((((.((......(.(((((((.((((..(((..((((.....))))...(((((.........)))))....(((((((((((..((((.......))))...))))....)))))))....)))...))))((((((.........))))))))))))).))))))))))).)))(((((....((.(((((.......))))))))))))(((((......)))))..(((((.((.((..((((((..((.(((((..(((((((((((.((((.(((..(.((.(((((.((.((....)).))..))))).)).)..)))(.((((..(((((.......)))))...)))).)((.((((....)))))).....)))).......))))))....)))))))))).))......))))))..)).)))))))..(((..((((.(((((((.((((...(((((((((..........))))))))))))).((((....(((((((((((((......(((((((((..((....))))))))))))))))).....)))))))....))))....))))))).))))...)))))))))))).......(((((..((((((......)).))))..)))))..))))))))))).((((((.((((((...(((......))).)))))).))))))((((((..........................))))))..(((((((.((((............((((......))))))))..)).))))).....)))))))))))).)).......))))).)))))))..)))))..))))))))...))))).)))))).))))))...))))))))).))))))))))))..)).)))))))).....)))))))))))).)))))))))...))))))))..).).)))))).).))).))))))))))))))))).)..))...))))))))).)))))).))))).))))..))))).)).)))).(((.((.(((.((((...)))).))).))(((((((.(((((.(((((....)))))..(((.(((((((((.(....((((.......))))..))))))))))))))))))(((......))).))))))).(((....)))............(((((......))).)))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((((((((((..(((((((((...((((((.(((((.((((....((..{..(((((((((..{.(,{(((.((.(((.(.(.(((((,{.,..((((((((.,.(((((({(((..(((.(((((((((.(((((..{.,..{{.(((.((((((....((((.(((({..(((({(.(....(((((((((,(,{((((({(({,((({{({{,,,(({{{{.,,,)))))))))))}).)))).}))..}}..,,...)))))))))})}}}))).))))).)))))))))).))).))}..)))))))),..))))))((((((.(((..(((((..(((.((((((((((((((.((((.,.,,{....}}}|{{{{((,{,..,|.}}})))}..(((((({..,..,,((({.,,((,{(((((..(((((((,{({{....,(,{{(({......))).))....,))}))))))).)))))))))}},)))))))))){((,....,}|((((((.(((.((((.(((((((,{.{{((((....)))).,)}...))))))).)))).))).)))))),.}))},..((((((.((((((.(((((((((..(((((((.(((((((((((.((.(((((((.{{{....,)..)))).))).)).)))).....)))))).).))))))).)))))))(((..(((.(({...)))))).))).{.(((((........))))),.)).)))))).))))))..((((..(((((((((...))).))))))..))))(((((...((((((.((((((......{{.....}},,(((((...(((((((.{,.(((((..(((((((.((((({,..((((((((((((((.((((((....))))))((((......))))(((((((((((.((({...})))((((((((..{({.{.......,.})).))))))))..(((((((((.(((((((((((.({......(.(((((((.((((..(((..((((.....)))).{.(((((.......,.)))))}...(((((((((((..((((.......))))...))))....)))))))....))}.,.))))((((((.........))))))))))))).})))))))))).)))((((,...,((.(((((.......))))))))))))(((((......))))).{(((((.((.((..((((((..((.(((({..(((((({((({,({,,.(((..(.((.(((((.((.((,...}).))..))))).)).}..))),.{{{{..(((((.,....,))))),,.}|||..((.((({....}))))).},,.,}||.....,.))),))}.}.)))))))))).)}......))))))..)).))))))).}{((..((((.(((((((.((((...(((((((((..{.......))))))))))))).((((....(((((((((((((......(((((((((..((....))))))))))))))))).....)))))))....))))....))))))).))))...)))))))))))).......(((((,.((((({......)).)))),.)))))..))))))))))).((((((.((((((...(((......))).)))))).))))))((((({..........................})))))..((((({(.((((,...........{{({.....,))))))))..}).})))),....)))))))))))).))......,))))).)))))))..)))))..})))))))...))))).)))))).))))))...))))),))).))))))))))))..)).)))))))).....)))))))))))).)))))))))...))))))))..}.},)))))).).))).)))))))}))))))))).,,.))..,))))))))).)))))).))))).))))..)))))},).)))).{(({((.(((.,((({.,|},}.}}|.||(,((,{|.}}}|}.|||,||{((((,{{{.(((.(((((((((.(....((((.......))))..))))))))))))),))),)))).,.}))},.))})))),|||..|{||....|||..,...{{(((......))).)}}}.