Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001360452.2

Sequence Length

1686 nt

GC Content

0.4205

GCAGUGGCGGCAGCGGCGGCGACGGCAGUAACAGCGGCAGCUACAGCGGGGACGCGAGCGGGGCGGUGACGGUGUGGGAGGUGGUCUCACUCUUGGGAAAACUGCUGGGCACCGUCGUCGCGCUGAAGGUGGUUCUGUACCUGCUCCGAGUGUGCUUAGCGAUGGCCUGGAAAUCCGGCGGCGCCAGCCACUCGGAGCUAAUCCACAAUCUCCGCAAAAAUGGAAUCAUCAAGACAGAUAAAGUAUUUGAAGUGAUGCUGGCUACAGACCGCUCCCACUAUGCAAAAUGUAACCCAUACAUGGAUUCUCCACAAUCAAUAGGUUUCCAAGCAACAAUCAGUGCUCCACACAUGCAUGCAUAUGCGCUAGAACUUCUAUUUGAUCAGUUGCAUGAAGGAGCUAAAGCUCUUGAUGUAGGAUCUGGAAGUGGAAUCCUUACUGCAUGUUUUGCACGUAUGGUUGGAUGUACUGGAAAAGUCAUAGGAAUUGAUCACAUUAAAGAGCUAGUAGAUGACUCAGUAAAUAAUGUCAGGAAGGACGAUCCAACACUUCUGUCUUCAGGGAGAGUACAGCUUGUUGUGGGGGAUGGAAGAAUGGGAUAUGCUGAAGAAGCCCCUUAUGAUGCCAUUCAUGUGGGAGCUGCAGCCCCUGUUGUACCCCAGGCGCUAAUAGAUCAGUUAAAGCCCGGAGGAAGAUUGAUAUUGCCUGUUGGUCCUGCAGGCGGAAACCAAAUGUUGGAGCAGUAUGACAAGCUACAAGAUGGCAGCAUCAAAAUGAAGCCUCUGAUGGGGGUGAUAUACGUGCCUUUAACAGAUAAAGAAAAGCAGUGGUCCAGGUGGAAGUGAUUUUAUCUUCUGCUCUUUCUUCUUCCACACAUGCAAGGGAUGAAUUGUAAAAGCAACAUCAGCUUGACCAGUAUAAAAUUACAGUGGAUUGCUCAUCUCAGUCCUCAAAGCUUUUUGAAAACCAACACCAUCACAGCUUGUUUUGGACUUUGUUACACUGUUAUUUUCAGCAUGAAAAUGUGUGUUUUUUUAGGGUUUCUGAUUCUUCAAAGAGGCACAGAGCCAAAUUGGUAGAGGAAGGAUGCAAAGUAUAAAUUUGUGUAAUAUUACUUUAACAUGCCCAUAUUUUACUUGGAAAUAUUAAAAGAAAGGGUUCUGUAAAAUGGAAAACUUAGUUUGUGAAUUGAUUUUGAGGAGUGGUUUUUCUUUUCUUGGACACUUAAUUCUGUUCUGAUAUUAAUUUAUCAGAUUGCUUUUGUGCAUUGGAUAACACCACCAUUCACAAGUUAAGAUUCUUGGUAUUUGGAUAUCUGUUAGAUGCUACUAAGAAAAUAGAGAUGAGCUUUCUUUUUAAAGCUUUUGAUGUGGUGUCAUAGAAUAGCAUGUUGUAGAUACAAUCAGCUGCUUUGUUACCUUAAAACUAGGCAUUUGUAAAUAUUAAACCAUAAGAUGGCAGGUGAUGUCCUGUAAACACUCAGCUGUUCAGAUUGGACAUAACUGACUUAGUUCUUCCCUUCUCUCUCUCUCAAAAUUAUAGGAGACUUGUAGUUUAGUGUGGUUUUCUGUUUCUAAUUUGCUGCUGAUAAUGUAUAUGAACUUAACAUGCUGUGUAAGCUGUGUCCUAGUUCUUGAACAGUUUAUGCAGUGCUGCUUUGCCAAAUAAAGUUAAAAGUAAAAGAGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-496.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -529.05

Frequency: 0.0000

Diversity: 495.28

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

...((.((....)).))(((((.((((((..(((((((((.((((((((((..(((((.((((((((((((((((.((.(((..(((((....)))))..))).))..)))))))))))))......((((((.(((((((.((((((((((.(((..(((.(.(((.((....))))).)))).)))))))))))))............((((......))))..(((((...((((((...))))))...)))))..)).)))))))))))))).)).))).....(((.(((((......(((((((((((............(((((......((((((((((..(((((.((((((((((.(((...((((((((((((..((((((..((((((....)))))).))))))))))...))))))))...))).))))))...)))).)))))..)))).)))))).....((((.......)))).((((((....((((((.....))).)))...))))))..(((.......))).((.(((((.......))))).))...))))))))))))))))......))))).)))((((....((((((.(((((......))))).))).))).))))))))))))))((((.(((..((((......))))..))).)).))............((((((.......))))))((((((((.(((((((((((((.((((((......((((((((((.(((...))).)).((((.((((((((.......)))))))).))))..(((((((((((......((((((((....)))))))).))))).))))))..(((((.....((((.((((..((((....))))))))..))))....(((......))).))))).))).))))).(((((...(((((...(((............))).))))).....))))))))))).)))))....)))))))).....(((((.(((((..((((((...))))))..))))).)))))..((((...))))(((((((((..((((((((.....((((((.......((.(((((((((((.........)))........(((..(((..((((((...))))))..)))..)))..(((((((.(((((((((.((....)).)))))))))...)))))))...(((((((......))))))).(((......))).......(((((((...(((.(((((....((((((((....((.(((((...)))))))))))))))...(((((.......)))))....))))).))).))))))).........)))))))).)))))))).....))))))))........((((((((((((.................)))))(((((......)))))......((((.((((((...))))))...)))))))))))....))))).))))......((((((((((...))))))))))....))))))))..........)))))))))...((((.((......))))))((((((((((((((..............)))))))))))))))))))))))))........................

Thermodynamic Ensemble Prediction

...,(,((,{.{||,||(((,,.{{|{{{..(((((((((,{,{,((({({.,||{,,{((.(((((((((((((.((.(((..(((((....)))))..))).))..))))))))))))).))}..(((((,,((((({(.((((((((((.(((..(((.(.(((.((....))))).)))).)))))))))))))............(((,......})))..(((((...((((((...))))))...))))).,)).))))))))))}|||.|..|||...,{({{..,,,|}}}|(((,,,{||,..,......}},,|||..,,.....,((((((((((..(((((.((((((((((.{((...((((((((((((..{(((((.{((((((....)))))).)))))})))),,,))))))))...}}}.)))))),..}))).)))))..)))).))))))}...,{,.{{{{{{,..{{(((((((({{..((.{({...{{||,...........))}},{{.{{{...}}}....{{{{{({,{{,{{{{{(({....{{.||||||||||||,{{{{{,.,|({{{.,((({....{(((((.(((((......))))).))).)))|||||}|||)))}}}((((.(((..((((......))))..))).)).))...,,,,...,{((((((.......)))))))}....,,..{(((((((((({((,{({,,((({{(({.(((..(((....}))..)))|||,.|||{{{|,.}}},,.)))}))))})),,...,,...||||||,|}}},{(((((({....,,,,,))})))))))))),)}}}}}}}}}}.}}((((((.((((((,...,{{,{{{{{,||||{.,,,(((......))).,.(((..((((((((((((((...(((((...(({............})).))))).....))))).,{{{{(((...{(((((({...})))))}}{{({(((((({((((({.,,|}}}}},.}}))))))})},,(((,...}}}|,{{{..,..{{{{{{{|,,....}}})))),,,,...}|||.,||.{{(({{,((((,...,}}},}}}.........})))||})).,,,.||,,..((((((((((((({.{...,,{(((((.{{....,)}})))}}}}|,{,......,,,.(((((((......))))))).(((......))).(((......))),,)))))))))))))).{{{{(((({,,,{(.{{{{{.,,)))))))))))))))....)))))))))..))}...,{{|||,.{||||,,.((({{,{(,((((,,.}|}|,|}}}})),)}}}},|)})))},,.{{{.......)))|,,||,,.............,.,.})))||||}}}}},,}))}....,.{{{{.{(((({...,)))))...)))}..}))))).)))))),,}}}}||||.......,,,))))))),)),,)))}})))}))},,)))),,)),..,))))))))...((((.,,......},})))((((((((((((((............,.))))))))))))))))))))))))),.......................