Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001362789.2
Sequence Length
1408 nt
GC Content
0.5249
AUCAUGUUUCGUGCGCUCCCAUUACGGAUCAUACCUCGCACCUCACCGCGUGGCCUCUGUAGUUCCAGAGCUCGCGAGGGCCAGGGCCGUUGGCGGCGGUUGGAACGAAACGAUGAGUGCCUCCUCGUGGCCCCAGAAUGGAAUGCCGCCGUCGUCCCUGUACGAGCGGUUAAGUCAGAGGAUGCUGGACAUCUCGGGGGACCGGGGCGUGCUGAAGGACGUCAUCCGAGAAGGAGCUGGAGACCUAGUGGCGCCUGAUGCUUCGGUGCUAGUGAAAUACUCGGGAUACCUGGAACACAUGGACAGACCCUUCGAUUCUAAUUACUUUAGGAAAACUCCUCGGCUAAUGAAACUUGGAGAGGAUAUUACACUGUGGGGCAUGGAGCUGGGCCUUCUGAGCAUGCGGAGAGGAGAGCUGGCCAGGUUUCUGUUCAAACCGAACUACGCCUAUGGAACGCUGGGCUGCCCUCCCUUGAUCCCCCCAAACACCACUGUCCUGUUUGAGAUUGAGCUGCUUGACUUCCUGGACUGUGCUGAGUCAGACAAGUUUUGUGCUCUCUCAGCUGCCCUAUUGCUUCUGCGCCGGCGAUCAGCACCCCCUGAAGAGCAGCACCUGGUGGAGGCCGCCAAGCUUCCUGUUCUCCUGAACCUGUCCUUUACAUACCUGAAGCUAGACCGACCCACCAUAGCCCUGUGCUAUGGAGAGCAGGCUUUGAUCAUUGACCAAAAGAAUGCCAAGGCCCUCUUCAGGUGUGGACAGGCUUGUCUUCUCCUGACUGAGUAUCAAAAGGCCCGGGAUUUUCUAGUUCGAGCCCAGAAGGAGCAACCCUUCAAUCAUGACAUCAAUAAUGAGCUGAAGAAACUGGCUAGCUGUUACAGGGACUAUGUGGAUAAAGAGAAAGAAAUGUGGCACCGCAUGUUCGCGCCCUGUGGCGAUGGUUCUACAGCAGGAGAAAGUUGAAGGUUCUUCACCUACCAACGAGGGGAGAGAGCUGUGGUUCUCCAUCAUUGGGGGAGUGGAAGGGAGCUCCCAGCGCAGCCGUGGCAGCCACCUUCCAGGAGCAGGGGCUGGAAUGUCCUGUGGCCGCAUCUCUCAUGGACGCGGCUGAAACGUGUUUUCACAGGUGCUGUUUUCUGUUUUCCGUGUUCGUAACAGAAGGGAGGGGAAAGCGCAGCUACUGACAAGUAGAACACUGCUACUUUUUUUAAGGCAGUUUCUUGUUUUUUUAGACGGAAUUAGUCCUUGGCUUCCCUCCCAGUCCCAGCCCUGCUUCCGGCUGCGAAUGUCCCUGAGUCAACACCAAUAGAGAUUGCUUUGUGUAUUUUGUAGGGUUCUCUGUUUUGAAGACAGAAUUAUGUUACAAAUGUUUUUGUUGUAAAUAAAUAAAACACUUCCUUGUCCUUGCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-490.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -517.22
Frequency: 0.0000
Diversity: 319.26
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
............(.((((..((((((((.....((.(((........))).))..))))))))....)))).)(((((((((((((.((((.(((((((((.(((((((((...(((.((((.(((...((((((.(.((..((((((((.(.((((((...((((..(((.((.((.....)))).)))..)))))))))).).)))).))((((((..(((.(((.....))).((.(((...((.(((((((.((....))))))))).)).....))).))...((((.....)).))...))))))))).((((((.....))))))....(((((..((((......)))).))))).))..)).).))))))...)))..)))))))(((.((..((..........))..)))))))))).)))).)))))......(((.((((..(((((((..((..((((((..((((((((((((.........)))))).......((((((...((((..((..(((((((((..((((((...)))).))..))))))((((....(((....)))..))))....)))..))..))))))))))...(((((((((((((..(((((.((.(((((.....(((((((.....((((((((((.............(((((((.....)))))))......(((((((..((((.........)))).)))))))..)))))))))))))))))......((((((((.(((((.((((...((((.((..(((((.(((((.......(((((......))))).....((....)).....))))))))))..))))))...((((((((((....(((((((............(((((....)))))))))))))))))))))).)))).)).))))))))))).((((.((((.....))))..))))))))).)).))))))))).)))))))))..))))))....)))))))).)))))))...))))))).........((.(((((((((.((((...(((((((((((((.(((.....))).))))).............)))))).))....(((((((...((....)).)))))))((((((((..((((((((((((....)))))....)))).........((((((((((((..((((....)))))))))).).))))))))))))))))....))))))))))))).)))))).)))).)))))...........((((((....))))))....(((((((.((..(((((((...)))))))...)).)))))))((((((.(((.......))))))))).......))))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
.....,..,{{{{.((((..((((((((.....((.(((........))).))..))))))))....)))).}||||{((({(((({(((,{((({(((({.(((((((((...(,(.(((({(((.,.((((((.{.((..{{((((((.{.((((((...((((..(((.(({{{.....}))).)))..)))))))))),),)))),}){(((((..(((.(((,.,.,||,,(({({{..,||,(((((((.((....))))))))).}}.....}}|{||...})}|,....,..}},..)}})))))}.((((((.....))))))....(((((..((((......)))).))))).,,..)).).)))))).,,,||{{}||}},|||{,||..,|,..}}}}}}.))..}}}},))))).)))).})))).....}|||.||||..{((((((..({.{((((((..((((((((((({.........}))}}},,,..,.((((((...((({..((..,{{(((({|||,|{{{|,,.,}))|||..}}})||{((,....{((....}}}..)))),}}}))),.,},.))))))))))...(((((((((((((..(((((.((.(((((,,.,.(((((((.....((((((((((.............(((((((.....))))))).|,{..(((((((..((((.........)))).)))))))}}))))))))))))))))).,,...((((((((.(((((.((((...(((((((..(((((.((((({......(((((......))))).....{{....},....,))))))))))..))))))...{(((((((((....(((((((,...........,((((....)))))))))))))))))))))}.)))).)).))))))))))).((((.((((.....))))..))))))))).)).)))))))))}})))))))).,)))))},...)))))))}.))))))|,,{||||||},,,,.....,|.((((((((((((((...({(((((((((((.(({,....))).))))),,,,,.....,,,)))))).))....(((((((...((....)).)))))))((((((((,,((((((((((((....)))))....)))).........{((((||||(((.,((((....)))))))),,.}.))))))))))))))))....)))))))))))))})))))).}}}}.}}}}}.,,,.{{{{.,{{(({{....)))))))}..,{(((((,({..(((((({...}))))))...}}.}}}}}}}{({{{{{{((.......)}}))))}}...,,,.))))))))..
Back