Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001363140.2

Sequence Length

1453 nt

GC Content

0.6559

AGAGCUGCCGCAGCGCCGGAGCCGGAGCCGGAGCCGGAGCGCGCGAGCUCGCAGGGCGCGAGGAACGAGCGGUGGCUGGCUACGCACCCGAGACCCGGGCACUGCUGCGCUCCUGCUCAGGACCCGCGACCCGAGCGCCUGAUCCCGGCCCUAUCCCCCCUCCGGCCCCUGGUCCACCCCGGCCUGGCCUAGCGGAGCCCCCGCGUCCGCCCGCCGCAGCCGCCGCUCCAUCCCCAGCCCCGGCCCCGCAUCCAGGUUUCAAGGACGCUAGGACUCUCCGCGGCCCUGAGGCUUCGCACUGGGGAGUGGGGCCGCCAGGAUGGACGUGUUCAUGAAGGGCCUGUCCAUGGCCAAGGAGGGCGUUGUGGCAGCCGCGGAGAAAACCAAGCAGGGGGUCACCGAGGCGGCGGAGAAGACCAAGGAGGGCGUCCUCUACGUCGGAAGCAAGACCCGAGAAGGUGUGGUACAAGGUGUGGCUUCAGUGGCUGAAAAAACCAAGGAACAGGCCUCACAUCUGGGAGGAGCUGUGUUCUCUGGGGCAGGGAACAUCGCAGCAGCCACAGGACUGGUGAAGAGGGAGGAAUUCCCUACUGAUCUGAAGCCAGAGGAAGUGGCCCAGGAAGCUGCUGAAGAACCACUGAUUGAGCCCCUGAUGGAGCCAGAAGGGGAGAGUUAUGAGGACCCACCCCAGGAGGAAUAUCAGGAGUAUGAGCCAGAGGCGUAGGGGCCCAGGAGAGCCCCCACCAGCAGCACAAUUCUGUCCCUGUCCCUGCCCCGCCCCCCAGAGCCAGGGCUGUCCUUAGACUCCUUCUCCCCAAUCACGAGAUCUUCCUUCCGCUCUGAGGCAACCCCCUCGGAGCCUGUGUUAGUGUCUGUCCAUCUGUCUGUCCUACCCGCCCGCGUCCAACCCCGGGGCAUGGACAGGGCCAGGGUUGCGGUCGCGGCUGGGAGCCUCGCCCCUCCAGUGUUGCCUCCUCCCAUCCAGCGUCUGCGCGGAUGUAGCAUGUUCUAUGUGUUUUUAAACGAAGAUCCGAGCGACGGCUCCUCCCCGAUCCCCGACAGUGGCUCUCCAAGCGGCCCCCGGGCAGCCCCAGAGCACCCCGCCCGACUCCCAUUAACCUCGAGAACCUUUUUUUUUUUAACCAAAACCAGGAGCCAGGCUGUGCCAUGUCCCCCGCCCCCCAUCCCAGCCGGCCCGGUCCGAACGCGGGCGUCGUGUGUUGUGAUUGUGGCAUGGAGAGUCCCCAUCCCCCCCAUGUGAGCGUGUCCCGGGCGGGUGGGCCCGGCCGCCCCCGAGAGUCCAUGAAUAAAGCUAAUCUGUCUGUAGCCAGAGCCGCACCGGCAGGGCUGGGCUGGGCGCCGGGUGGGGGCGACACGUGGCGGCGAGUCUUCCAGGUCCCAGCCUACCCCUCUGUGCUCUUUGGGGUCUGGCACACACAGCCCAGGUACAAGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-614.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -639.79

Frequency: 0.0000

Diversity: 482.77

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(((((..(((.((.((((..(((....)))..)))).)))))..)))))((.((((((.((((.(((((((((.((((((.((....))))..)))).))))))).)).))))))...((((((((((((...((....(((((.((((((.(((((((...((((...((((......)))).))))..(((((((....)).)))))((((.((.((((((((.((.(((...(((.(((((((((.(((((((((((.((.(((..(((...)))))).)).))))))......)))))..))))))))).....(((((((.((((.....)))).))))))))))...))))))))..))))).)).))))..............(((((.((((.(((((.(((..((((..(((.(((((..(.(((....(((((.((((.(((((((((.(((.((((...)))).)(((((...)))))......(((((.(((.(((....((((((.((.((..........((((((((((......((.(((((...)).))).))...((((((((((((((((((..((((....))))...)))))....))).(((((((.....((.(((.(((.((.(((((((...((....((((.(.(((.....))).).))))....))..))))))).)).)))..))).)).((.(((((.(....).))))).)))))))))...))))).))))).))))))))))))))))))))...))).))))))))..)).))))))).........).).)))).)))))(((((((((......)))))))))......))).)..))))).))))))).)))...))))))).))...)))))))))...))).)))))).)))))))))))))))(((((((.((((((...((((((((((((((.(((((((.(((....))))))))..((.((.(((.(((........))).)))..)).))..(((((((..(((.......(((((((((((((...((((((..((((..((......))..))))...(((((((((...((.(((..((...................(((.((.(((.(((((.(..(((............))).))))))))))))))...((((((.(...).))))))))..))).)).)))).)))))(((((((.(((((((....))))....))).)))))))...))))))....))))).)))..............)))))...((((...((((...))))..)))))))..))).)))))).))))))))))).))).)))))).)))))))))))..(((.(((((............)))))..))).......))))..))......

Thermodynamic Ensemble Prediction

.(((((,,(((.((.((((..(((....)))..)))).)))))..)))))((.((((((,{(({.({(((((((.(((({{.((....)),}..)))).))))))),)),))))))...{({{{{{({(({|,.||||,,{{{((.((((((.(((((((,..((((.,,(({{....,,))}}.))))..((((,,,..}})).|||||,.((((((({{(((.((((.,..,,.,{(.(((((((((.(((((((((((.((.(((..(((...)))))).)).)))))),.....})))),.)))))))))...}}{((((((.((((.....)))).)))))))))}...))))))))))))))).},.))))}............,(((({.((((.(((((.(({..{(((..,((,(((((.,{.(((({.,(((((.((((.,,(((((((.(((,({{,.,,|}||,|((({{..,))}}}...,,,((((,,(((.(((....((((((.((.((..........((((((((({.{....((.(((((...)).))),))..,((((({{,,{|||||(((..((((....))))...))))),.,.||}.(((((((.....((.(((.((,.((.(((((((...((....((((.(.(((.....))).}.))))....))..))))))).)).,}}|,|}}.)),({.(((((.,....}.))))).}})))))))..,|}})),}}}})})))))))))))))))))))),..))).)))))))).,)).))))))).........}.).)))).)))))(((((((((......)))))))))..,,}.,)).}..))))).))))))).)))...))))))).))...}))))))))...))).)))))).))))))))))}))})(((((({,((((((,{.{{,(((((((({{{.{{(((((.(((....}}}))))}.,((,((,{{{.|||,,,.....}}}.}}},,}|,||..,{||}||,.,,{|.,,,,}}.,,||(((((((,..(({((,..,((({.{||,{{,,|{{{..{|{{{(,({{{{.........{{{,,,.....,,},,,........{{{.((.(((.(((((,|,.||{......,,....}},,,))))))))}}}||,,,.,,,|)))}},}},)))})}}}.}}),})},}|||}}}})|((((((,(({((((....))))....))).)))))))|||}|}})),,..}}}|||}}},,......,,,..,|||||,,,,|||,,,{{{|,..)))).}))))))),,)))})))))),))))))))))).})).)))))).)))))})})))..|||.{{{{{...{,,,.,...}||}}.,|}}......,)))),,)),,....