Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001363309.2

Sequence Length

1794 nt

GC Content

0.5624

GAUUCCCGGGACUAGGUUGCGGGAGAAAGCCUGUUGCGUGGAAGAUAAGGCGGCGCGGGAAGUGGACACAGGAUCUAACUGGACUCUCGCUCCUGCUGGCUGGACAUGGAGGAUUUGGAGGAAGAUGUAAGGUUUAUUGUGGAUGAGACCUUGGACUUUGGGGGGCUGUCACCAUCUGACAGCCGUGAGGAGGAAGACAUAACAGUGUUGGUGACUCCAGAGAAACCACUUCGACGGGGCCUCUCCCACCGAAGUGACCCAAAUGCAGUGGCACCUGCCCCCCAGGGUGUGAGGCUCAGCCUAGGCCCCCUCAGUCCAGAGAAGCUGGAGGAGAUCCUCGAUGAGGCCAACCGGCUGGCCGCUCAGCUGGAGCAGUGUGCCCUGCAGGAUCGGGAGAGCGCAGGCGAGGGCCUGGGGCCUCGCCGAGUGAAGCCCAGUCCUCGGCGGGAGACCUUUGUGCUGAAGGAUAGUCCUGUCCGAGACCUGCUGCCCACUGUGAACUCUUUGACGCGGAGCACCCCCUCCCCAAGCAGCCUGACGCCUCGACUCCGGAGUAAUGAUAGGAAGGGGUCAGUCAGGGCUCUCCGGGCUACAUCUGGAAAGAGGCCCUCCAACAUGAAGAGGGAGUCACCCACUUGCAAUCUGUUCCCUGCAUCCAAAAGCCCAGCAUCUUCUCCUCUUACCCGAUCGACUCCCCCAGUCCGGGGGAGAGCCGGGCCCAGUGGGAGAGCAGCAGCCAGUGAGGAGACCAGAGCAGCCAAGUUGCGGGUGAGUGGGAGUGGGGAGUUUGUGGGAUUGACCCUGAAAUUUCUCCACCCCUCUCCACCAGGCCCACCCACCCCCAUCAGAUCCGUCCUGGCCCCACAGCCUUCUACCAGCAACUCUCAACGCCUGCCCCGGCCGCAGGGAGCAGCUGCUAAAUCUUCCAGUCAACUGCCCAUUCCCUCGGCCAUCCCCAGGCCUGCCAGCCGAAUGCCACUCACCAGCCGGAGUGUGCCACCUGGCAGAGGUGCCCUACCUCCGGAUUCUCUGUCAACUCGAAAAGGGCUUCCAAGACCAAGCACUGCAGGACACAGAGUGCGGGAAAGUGGACACAAGGUUCCUGUUUCCCAGCGACUAAAUCUUCCUGUCAUGGGUGCCACUCGCAGCAAUCUGCAGCCCCCCAGGAAAGUGGCAGUCCCAGGACCUACCAGGUAAAGAGAUCAGGACAGCAAGCAAGACUUCAGUAGCAAACCACUACAGUCAGUACCUGGACUCGCCUCUACCCAGCAGACCCUGACUCCAGCAGAUUCUGGCCCAGGGACAGGAGGAAGAGAUGCCACCAGGGCUGGUCUCCCAGGAGUAGAGACCAUGGGAAAUGGGGUGGAUUAGGAUUGAGCUGGAGAAGACUUAAACUCUCUGGGUUGAAAGAAGAUUAGGGGAAAAGAGGUCACCUUCCAGCAGUGAAAUGAACAAAUAGAAGAUGAGAAGUACAGGCAAGUGGUUUGUCUUUAUCCACCCCCACUGUUGUGGUCAGCCCCAGAGAAUUUUAUCUUCUUCCUUGGCAUUGGUUCACUGGACAUUUCCACGUGAGCGGCCUCCGUAGCUAACCUCCCUGCCCUCUGAGGAGCCAUCUUCCUGAAUCGCAUUCUCUACUGGACUCUGGCCUGCUUGGAGAGGUGGCAGCAGGCACCUGGUCUUCAGAAAUUGUUUCCUGUGAAUUCUGUGACUCCUAAUAGGCCAGUUUGUGAUAAGCUUACUCUAUGAGUCUUCAUUUUUCUAAAAUAAAGUGAAUGUAUUUUUAUAUUCUCUGUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-679.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -711.29

Frequency: 0.0000

Diversity: 433.66

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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