Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001363595.2

Sequence Length

1487 nt

GC Content

0.5777

CCUUUUGCAAGAGCUGCUAAGAGCGCUGGACUCUGCGGUGGAGCUGUGGAAGCCAGGCGCACAGGAUGCAAGCAGCCAGGCCCAGGGAGGCAGCAGCUGCAUCCUCAGAGAGGAAGCCAGGAUGCCCCACUCUGCUGGGGGUACUGCAGGGGUGGGGCUGGAGGCUGCAGAGCCCACAGCCCUGCUCACCAGGGCAGAGCCCCCUUCAGAACCCACAGAGAUCCGUCCACAAAAGCGGAAAAAGGGGCCAGCCCCCAAAAUGCUGGGGAACGAGCUAUGCAGCGUGUGUGGGGACAAGGCCUCGGGCUUCCACUACAAUGUUCUGAGCUGCGAGGGCUGCAAGGGAUUCUUCCGCCGCAGCGUCAUCAAGGGAGCGCACUACAUCUGCCACAGUGGCGGCCACUGCCCCAUGGACACCUACAUGCGUCGCAAGUGCCAGGAGUGUCGGCUUCGCAAAUGCCGUCAGGCUGGCAUGCGGGAGGAGUGUGUCCUGUCAGAAGAACAGAUCCGCCUGAAGAAACUGAAGCGGCAAGAGGAGGAACAGGCUCAUGCCACAUCCUUGCCCCCCAGGGCUUCCUCACCCCCCCAAAUCCUGCCCCAGCUCAGCCCGGAACAACUGGGCAUGAUCGAGAAGCUCGUCGCUGCCCAGCAACAGUGUAACCGGCGCUCCUUUUCUGACCGGCUUCGAGUCACGGUGAUGCUUCUGGAGACAUCUCGGAGGUACAACCCUGGGAGUGAGAGUAUCACCUUCCUCAAGGAUUUCAGUUAUAACCGGGAAGACUUUGCCAAAGCAGGGCUGCAAGUGGAAUUCAUCAACCCCAUCUUCGAGUUCUCCAGGGCCAUGAAUGAGCUGCAACUCAAUGAUGCCGAGUUUGCCUUGCUCAUUGCUAUCAGCAUCUUCUCUGCAGACCGGCCCAACGUGCAGGACCAGCUCCAGGUAGAGAGGCUGCAGCACACAUAUGUGGAAGCCCUGCAUGCCUACGUCUCCAUCCACCAUCCCCAUGACCGACUGAUGUUCCCACGGAUGCUAAUGAAACUGGUGAGCCUCCGGACCCUGAGCAGCGUCCACUCAGAGCAAGUGUUUGCACUGCGUCUGCAGGACAAAAAGCUCCCACCGCUGCUCUCUGAGAUCUGGGAUGUGCACGAAUGACUGUUCUGUCCCCAUAUUUUCUGUUUUCUUGGCCGGAUGGCUGAGGCCUGGUGGCUGCCUCCUAGAAGUGGAACAGACUGAGAAGGGCAAACAUUCCUGGGAGCUGGGCAAGGAGAUCCUCCCGUGGCAUUAAAAGAGAGUCAAAGGGUUGCGAGUUUUGUGGCUACUGAGCAGUGGAGCCCUCGCUAACACUGUGCUGUGUCUGAAGAUCAUGCUGACCCCACAAACGGAUGGGCCUGGGGGCCACUUUGCACAGGGUUCUCCAGAGCCCUGCCCAUCCUGCCUCCACCACUUCCUGUUUUUCCCACAGGGCCCCAAGAAAAAUUCUCCACUGUCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-573.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -598.77

Frequency: 0.0000

Diversity: 293.53

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(((..(((.....))).))).(((((((..((((((((...))))))))..))).))))..((((.(((.((.(((((((((((((.((((....((((.(((((...))))).).)))..))))))..((((..((((((.((((..(((((((((((..((((....))))..)))))))))))......)))).))))))..))))..........(((((.(((..(((((((((((.((((.(((.(((((......))))).....((...))(((((.((((((((((...((((((((((..((......))...))))).)))))(((((...(((....)))...)))))((((..((((((((((..((((.(((.....((((.(((....)))))))((((((((.....(.((.(..(((((((...((.((((.........)))).))..)))))))..).)).))).))))))((((....).)))..((((.((((.(...(((..((((...((((((((...(((....)))...)))..((((....)))).))))).............))))..))))))))..))))....((((((((((.((((...))))))).)))))))...)))))))....))))))))))..))))(((..(((.((((.((.((((....(((((((.((((((.(((...)))))))))((((.....))))((((((...((.((........)))))))))).(((((((..(((.((.(((((.(((((((((...............)))))))...(((((...(((((((.(((((((.........))).))))...)))))))....((.(((.......))).))..))))).)).)))))..)).)))...)))))))(((((((((((((....))))......))))).))))..))))))).....)))).)).)))))))))).)))))))))).)))))........(.(((.((.((((((.((.((((((((........((((.....((((..((((....))))..))))..))))....))))))))...).).))))))..)).))).).........))).))))...)))))))))))..))).)))))..))).)))))))).))))).)))).((((((((............((((.......((((((((.((((..(((....)))))))((((...........))))..((((((((.(((((..(((.((...((((((.(((....)))..))))))...)))))..)))).).))).)))))...(((((((.(((..(((((((.....((..((((((((....))))))))..))....))))))))).).))).)))))))))..)))))))............)))))).)).

Thermodynamic Ensemble Prediction

.{((..(((.....))).))).(((((((..((((((((...))))))))..)))}})))..((((.((,,((.(((((((({{(((.((((....((((.(((((...))))).)},))..))))))..((((..((((((.((((.,(((((((((((..((((....))))..)))))))))}).},...)))).))))))..)))).....{{{..(((((.(((..(((((((((((.((((.(({.(((((......)))))....,({,...,(((((.((((((((({.,.((((((((((..((......)}...))))}.)))))(((((...(((....)))...)))))((((..((((((((((..((((.(((.....((((.(({..,,)}}}}}}(((((({{.{.,.{.(({(,.{((((((...((.((((.........)))).))..)))))))}})}},,}}),)))))|{{({....}.,}}|.{(((.((({.{...(((..({((,,.((((((((...(((....)))...})),.((((....)))).}))))...........,,})))}.))))))))..))))....((((((((((.((((...))))))).)))))))...)))))))....))))))))))..))))(({..(((.((((.((.((((....(((((((.{(((((.(((...})))))))}((((.....))))((((((...((.{,........},)))))))).(((((((..(((.((.(((({.{{{((((((...............))))))),,.(((((...(((((((.(((((((.........)))}}}))...))))))){{{...}|||...,,,.|||.}}..))))).,}.}))))..)).)))...)))))))(((((((((|,({{....))),..,,.))))).))))..))))))).....)))).)).)))))))})}.}))))))))).))))).,,.....|.({{.{{.{(((((,,,.((((((((,,,...,,((((..,{,{{{{,,||||..,,)})),,)}}}..}}}}....))))))))...}.).)))))),.)}.))).,......}},))).))))...)))))))))))..))).)))))..))).)))))))).))))).)))).{{((((((............((((.......((((((({.{(((..(((....)))))),((((.{{.....,,.)))}..((((((((.(((((..(((.((.,.((((((.(((....)))..)))))).,.)))))..)))),}.))).)))))...{((((((.(((..(((((((.....((..((((((((....))))))))..))....))))))))).}.))),)))},}})),,}))))))............)))))).}}.