Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001364238.2

Sequence Length

2263 nt

GC Content

0.4326

CAUUUCGUCUUAGCCACGCAGAAGUCGCGUGUCUAGGUGAGUCGCGGUGGGUCCUCGCUUGCAGUUCAGCGACCACGUUCUGGUCCUCCCCGCUUUGCAGUUUGUUUCGACGCCGGACCGCGUAAGAGACGAUGAUGUUGGGCACGGAAGGUGGAGAGGGAUUCGUGGUGAAGGUCCGGGGCUUGCCCUGGUCUUGCUCGGCCGAUGAAGUGCAGAGGUUUUUUUCUGACUGCAAAAUUCAAAAUGGGGCUCAAGGUAUUCGUUUCAUCUACACCAGAGAAGGCAGACCAAGUGGCGAGGCUUUUGUUGAACUUGAAUCAGAAGAUGAAGUCAAAUUGGCCCUGAAAAAAGACAGAGAAACUAUGGGACACAGAUAUGUUGAAGUAUUCAAGUCAAACAACGUUGAAAUGGAUUGGGUGUUGAAGCAUACUGGUCCAAAUAGUCCUGACACGGCCAAUGAUGGCUUUGUACGGCUUAGAGGACUUCCCUUUGGAUGUAGCAAGGAAGAAAUUGUUCAGUUCUUCUCAGGGUUGGAAAUCGUGCCAAAUGGGAUAACAUUGCCGGUGGACUUCCAGGGGAGGAGUACGGGGGAGGCCUUCGUGCAGUUUGCUUCACAGGAAAUAGCUGAAAAGGCUCUAAAGAAACACAAGGAAAGAAUAGGGCACAGGUAUAUUGAAAUCUUUAAGAGCAGUAGAGCUGAAGUUAGAACUCAUUAUGAUCCACCACGAAAGCUUAUGGCCAUGCAGCGGCCAGGUCCUUAUGACAGACCUGGGGCUGGUAGAGGGUAUAACAGCAUUGGCAGAGGAGCUGGCUUUGAGAGGAUGAGGCGUGGUGCUUAUGGUGGAGGCUAUGGAGGCUAUGAUGAUUACAAUGGCUAUAAUGAUGGCUAUGGAUUUGGGUCAGAUAGAUUUGGAAGAGACCUCAAUUACUGUUUUUCAGGAAUGUCUGAUCACAGAUACGGGGAUGGUGGCUCUACUUUCCAGAGCACAACAGGACACUGUGUACACAUGCGGGGAUUACCUUACAGAGCUACUGAGAAUGACAUUUAUAAUUUUUUUUCACCGCUCAACCCUGUGAGAGUACACAUUGAAAUUGGUCCUGAUGGCAGAGUAACUGGUGAAGCAGAUGUCGAGUUCGCAACUCAUGAAGAUGCUGUGGCAGCUAUGUCAAAAGACAAAGCAAAUAUGCAACACAGAUAUGUAGAACUCUUCUUGAAUUCUACAGCAGGAGCAAGCGGUGGUGCUUACGAACACAGAUAUGUAGAACUCUUCUUGAAUUCUACAGCAGGAGCAAGCGGUGGUGCUUAUGGUAGCCAAAUGAUGGGAGGCAUGGGCUUGUCAAACCAGUCCAGCUACGGGGGCCCAGCCAGCCAGCAGCUGAGUGGGGGUUACGGAGGCGGCUACGGUGGCCAGAGCAGCAUGAGUGGAUACGACCAAGUUUUACAGGAAAACUCCAGUGAUUUUCAAUCAAACAUUGCAUAGGUAACCAAGGAGCAGUGAACAGCAGCUACUACAGUAGUGGAAGCCGUGCAUCUAUGGGCGUGAACGGAAUGGGAGGGUUGUCUAGCAUGUCCAGUAUGAGUGGUGGAUGGGGAAUGUAAUUGAUCGAUCCUGAUCACUGACUCUUGGUCAACCUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUCUUUAAGAAAACUUCAGUUUAACAGUUUCUGCAAUACAAGCUUGUGAUUUAUGCUUACUCUAAGUGGAAAUCAGGAUUGUUAUGAAGACUUAAGGCCCAGUAUUUUUGAAUACAAUACUCAUCUAGGAUGUAACAGUGAAGCUGAGUAAACUAUAACUGUUAAACUUAAGUUCCAGCUUUUCUCAAGUUAGUUAUAGGAUGUACUUAAGCAGUAAGCGUAUUUAGGUAAAAGCAGUUGAAUUAUGUUAAAUGUUGCCCUUUGCCACGUUAAAUUGAACACUGUUUUGGAUGCAUGUUGAAAGACAUGCUUUUAUUUUUUUGUAAAACAAUAUAGGAGCUGUGUCUACUAUUAAAAGUGAAACAUUUUGGCAUGUUUGUUAAUUCUAGUUUCAUUUAAUAACCUGUAAGGCACGUAAGUUUAAGCUUUUUUUUUUUUUAAGUUAAUGGGAAAAAUUUGAGACGCAAUACCAAUACUUAGGAUUUUGGUCUUGGUGUUUGUAUGAAAUUCUGAGGCCUUGAUUUAAAUCUUUCAUUGUAUUGUGAUUUCCUUUUAGGUAUAUUGCGCUAAGUGAAACUUGUCAAAUAAAUCCUCCUUUUAAAAACUGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-656.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -704.28

Frequency: 0.0000

Diversity: 751.47

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

...((((.(((((.(((((.......))))).)))))))))(((.(((((((((((.((((.((((((.((((((((((((..(((.((((((((.(((..(((((((.((((......))))..)))))))...))).))))..))..)).)))..))))..))))))..(((.((((((....)))))).)))((((.(....((((.(((((.((.......))..)))))...))))...).))))....(((((..(((((....((.((.(((((((((..(((((.((.((((((((((.............((..((((((((((.(((((((.((........(((.((..((((.((((.(((.((((((..(((((((((.(((..((....))...))).)))))))))..)))))))))))))..))))))))).)).)))))))..))))))))).)..)))))))).))))))))))).)))(((((........))))).....)))))).))))..))))).))))).((((......))))..)).))))))..)))).)))).(((((((((...)))))))))(((((((((((.........(((......((((((((((....(((.......................)))...))))).))))).....)))))))))..))))).......))))))).)))((((((((((((.(((((.(.(((((((.........)))))))((((((((((((((((((((((.(((..((((((((((((((.(((((((.((((((((((..(((((((....)))))))..)))))).........((((((((....))))))))..((((((((((((((..(((((((((.(..........).)))))))))..))))))))).)))))....(((.((((....)))).)))...((.((.((((((..(((((((.(.(((((((...........((((...((((((................))))))..))))..))))))).).))))))).........)))))).)))).((((..((.(((((((....((((.((((...(((((((....((((.((((.(((.((((....)))).)))..................(((((((.((.....)).)))))))((....))(((((....))))).............(((((((.((.....)).)))))))((....))..((.(((((((((.(.((((((...........(((.((((((.((...)).))))))))).......((((..((((.....))))..)))))))))).))))).))))).)).)))).)))).))))))))))).))))...))))))).))...))))(((((.(((......))))))))...((((.(((((((..((((((.(((..(((.((((....)))).)))(((((.....((((((((...(.(((......))).)....)))))))))))))...(((.(((.((........)).))).)))))).))))))..)))))))..))))............)))).))))))).)))..(((((.(((((((((((((((.((..((((..((.((((((..(((((...)))))..)))))).))))))..)).)))...........(((((....)))))..((((((.((....((...))....)).))))))......)))))))))))).)))))))))))))))))))))).)))))((......))..((((...(((((((((((.(......).))))).))))))...))))))))))))))).)))...((.((((.(((.......))))))).))((((((((((((((.((.((....)).)).)))))))).))))))..((((((..(((((((...((((((....)))))).....))))))))))))).)))))).))).)))))))))............((((((((.....((((...((((((.(((((((((.(((....(((((((.((((((((.((((.....)))).)))))))).......)))))))..))))))))))).((((..((((((((...))).))))).))))..).))))))...))))...)))))))).....

Thermodynamic Ensemble Prediction

...{(((.(((((.(((((.......))))).))))))))}..((((({(((((((,{{,({(((((((({((((((,{{{..(((,({((((((.(({..(((((((.((((......))))..)))))))...})).}))}.,)},,))}))},.)))}..))))))...,,.,,(((,((((((|(((((||(((,{{((.,((((.(((((,((......,))..)))))...}))}...,.})})|...{||....,|{{{.{{{...,,,}}}}}))))))))}}).)))))).))},})))))))}...,,{....}||(((((((.((((((({({........(((.(,.{((((.((((.(((.((((((..(((((((((.{((..{,....}}...))}.)))))))))..)))))))))))))..)))))}))}.,,.)))))))..))))))))).,,))...)))))))}{(({,,({{{,.{((((........))))),.}}))}}},.)))),{((((.((.{(((.((((......)))).,,)))})).)))))|((((((((((((((((...))))))))).(((((((({,{{(,,,,,,{(({....}||((({,,,,.....,,({{{{{,,{{{{{(,{,{,{.{{{{{...|||,,.,||{|,{|,,|||||.,{|{|||,{{{,.,,,,,(((((((...,,((({,((((((({{{{(,((((({(({{,.,,..,|,}|||,,(((({{,..{|{|,,,.||||.{{|,|||}}}|,}|||||{{{.,{{{,,}..|||||||||||.|||||||{{{|,{,|,||||||,||.....,.((((((((....))))))))|.((((((((((((((..(((((((((.{..........}.)))))))))..))))))))).))))).}....}}.}}}})))))})))))}}}||,|{,((({{{.}|||{{{{.|,|||{{{{.,..,,,,.,,||||.,,{({({{,{,..........,,.)}}}||,,|||}..}|||||}.|,||||}||,,,...,,{}|||||.||,|{,{{{..||.|||||||,||}{{{{.{{|{||.,{||||{....||((.((((,(((.((((....)))).))).....|,,..........(((((((.((.....)).))))))),|}}}},)||,||}|},}))}}.............(((((((.((.....)).)))))))||,,}.}}.}))}})},||||(((,{({{((,.....||}..|,|}|||||{,||,..,)}))))),|||.{{,.{,(((.|{((((.....)))).)),)))}),.),..))),)))}).))})))).))),.)}))})))))).}}}},,||||||||.(((....))).,{({{{...}}}}}..,,,||,..((((.((((((({{((((((.(,{{.,(({((({..}})))).,}}(({{(,,...((((((((...{,{{{......}}}.}},..)))))))),}}}}.,,||||{{(.((,,.,,...,}.,}),}))))}.)))))).))))))))..))))......,,,,,,,||,,,||||,..})))}}}|}}}}}}},.,|,|||}}|||||{{,,{||,|||,...||,||}|{{.(((({.((((((((.(((....(((((((.(((((((((((.(((((...(((((({({,{((({{{|,,,.{((((((..((((((((..(((((((({...,{{{,{(({....}}}}..,,.}}}})))))))))....))))),}))....(((((.,,,,((({{{.(((,||||,..,.,)),|,||})||..}}}))})))))........)))))))}}}}}}|{(((((....)))))||{{{(({..,.{{||,.,}.,..}}}}||||{(((((((({((((,,{(((((((...((((((....)))))).....)))))))))))))....)),,))))),..,||....}}|||,,(((((((({......}))))))))...|||{{,{(({((({{.,,,..|}.,.},)))}))))))))}))))))))}.))).))))))))......))})))))...))).)))))))).}))))))}}}}}})},.,,}}}}}))))),........)))))))}......))))).