Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001364745.2
Sequence Length
1517 nt
GC Content
0.6124
ACCUCGCCACGUCACCGACUGCAAACCUUCAGCUGUCUCAGGCUCGGGUGCAAUCCGUACCCUCAGUGGGUUCCCUUUCAGUGGGUUCCUUUGUCCCCAGGCCCAUUAUUCCGUCCUCCCCUCUUCCCUGAUGUAUUUUGGCGCGGUCUCCUGGCUCUGCGGGCCCAGGGCUCCGGAUGAGGUCUCCCGCCGUCCCGACCCCCGCAAGGGGCCAGCUUGGUGUCGCCUUCGUUCUUCUGCCACCCCAUUCGGAAGGUGCUCGGGUCUUCGGGGCACUGGGUCCCAUCGGUCCCUCCUCACCUGGGCUCACCCUCGGGGGUCUGGCCGUGAGCGAGCACCGGCUCAGCAACAAGCUGCUGGCUUGGAGCGGCGUCCUCGAGUGGCAGGAGAAGCGCAGACCCUACUCUGACUCCACUGCAAAGCUGAAGCGGACCCUGCCCUGCCAAGCCUACGUGAACCAAGGCGAGAACCUGGAGACCGACCAGUGGCCGCAGAAGCUGAUCAUGCAGCUGAUCCCUCAGCAGCUGCUGACCACCCUGGGCCCCCUGUUCCGGAACUCCCAGUUGGCACAGUUCCACUUCACCAACAGAGACUGCGACUCGCUCAAGGGGCUCUGCCGCAUCAUGGGCAACGGCUUCGCGGGCUGCAUGCUGUUCCCCCACAUCUCCCCCUGUGAGGUGCGCGUGCUCAUGCUCCUGUACUCGUCCAAGAAGAAGAUCUUCAUGGGCCUCAUCCCCUACGACCAGAGCGGCUUCGUCAGUGCCAUCCGGCAGGUCAUCACCACCCGCAAGCAGGCAGUGGGACCUGGUGGUGUCAACUCAGGCCCAGUCCAGAUCGUCAACAACAAGUUUCUGGCAUGGAGUGGUGUCAUGGAGUGGCAGGAGCCCAGGCCUGAGCCCAACAGUCGGUCCAAGAGGUGGCUGCCAUCCCACGUCUACGUGAACCAGGGGGAGAUCCUGAGGACCGAGCAGUGGCCAAGGAAGCUGUACAUGCAGCUCAUCCCGCAGCAGCUGCUGACCACCCUAGUGCCGCUGUUCCGGAACUCGCGCCUGGUCCAGUUCCACUUCACCAAGGACCUGGAGACACUGAAGAGCCUGUGCCGGAUCAUGGACAAUGGCUUCGCCGGCUGCGUGCACUUUUCCUACAAAGCAUCGUGUGAGAUCCGCGUGCUUAUGCUCCUGUACUCUUCAGAGAAGAAAAUCUUCAUUGGCCUCAUCCCCCAUGACCAGGGCAACUUUGUCAACGGCAUCCGGCGUGUCAUUGCCAACCAGCAGCAGGUCCUGCAGCGGAACCUGGAGCAGGAGCAACAGCAACGAGGGAUGGGGGGGUAGUGGUUACCCCGGGCUGGGCCCCUCCAGGAGUCACAGAUGAGGCCCCCGCAGAGACUGGUGACACGCUUCUGAGCAGGGGCCCCUGGGGACUUCAACUGCCCAGCAACAUGGAGGAUGGUGUCCUGAGGCCUCCAAGGACGGUCCCCACCCCUCUACGUUUCCCCAAUAAAGCCUUUUAAAAACCUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-601.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -627.90
Frequency: 0.0000
Diversity: 505.28
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((....(((...))).......((((((.((((((((((..((((((.....))))))...(((((((((.....((((((..(((........))))))))).....((((((...((((((((...((.((((((..(((.((...(((((...(((((..((((((((((((((((....(((((.......((((....))))......)))))..))).))))))...((((((.((((...((((.(((((.((((...((((((((((......((((((((..(((.(((.((.((((.((((.((......)).)))).((((....))))((((......))))(((((((((.(((((((((.(((.((((..((....((((......))))..))..))))...)))))...))))...))))).)))))))...)))).)).))).))).....)).)))))))))))).((((.(((((((.(((.(((((((.........)))))))))).......((((((((((((..((((((.((....))...))))))........))))).....(((...)))....)))))))((((........)))).)))))))))))...((((((.((..((.((((........)))).)).))))))))...(((....)))...(((((.(((((...))))).))))).....))))...)))).))))).)))).....((((....)))).(.(((((((((((((.........)))))...)))))))).)......((((((.((((..(((..(((.....)))..)))..)))).))).))))))).))))))))))))).))))))))))....)))))..))))))(((((...))))).((((....)))).))..))))))))....)))))).(((((((((((.(((.((((((....)))))).......((((....)))).....))).).)))))))))).)))))))))))))))(((((.(((..........))).))))))))))))))).((((((((.((....(((.(((((((..((((((.((((((((...........(((((.((((.(....)))))))))).......)))))...((((.(((((...))))).))))............((((.(((....))).))))...))).)))))).)))))))))).)).))).)))))(((((..(((...)))..))))).((....))..)))))..((((((((((((((...(((((((...((((((((((((((((((((.....((....)).....)).)))....))))))).).))))))))))))))...)).)))))))...(((.((((((.(((((((((..((...)).))))))....)))..)))))).))).))))).....................
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{{{{{..,.{{..,,(|({((....{{{{{(,({{{,{((((,.((((((.....))))))...((((({{{{.....,(((((..((,..,,,,..|||||||},.,.,,((((((,,{(({(((((,..,,.,,{(((..(((,((,,{(((((,,{((({{..((({(((((((({(({...,|{{||{,|{{,,{|||,,..)))),}|{,.,((({(,{{{{({((((..,.((((((((....{(..({{((((((((....((((.({(((,..,..}}))}}))},,,,}}}})))},},|},,,,))))}.,))).},)))}))}}}}}}}}}{((({....,,)))}}||||||,|}||}|,,,.({(((,(((({{(..{{{(((({{{{.{||||..,,..|}|}...)}||{{|.|||,.|||},,|{|||||||{....,,,}.,))))}}..,}|,||||}|||,,||(,((((,({(,,(,((.(((.(((((((.........)))))))))).}}..}}|||||,,}||.|.}||..||}||,}|}))}},))}))).))}},....)})))...{{{...})).,..))))}))||{{,}..,,{{||||.||||||||||||},||{(({(({.....|}}||{,,,,|||}}},|||,||||}|}|,,,|||||||||||||{(((.(((((...))))).)))))}}}},}}.,,,,{{{{.,.,.|||.}}}}..,{{{{..,,|}||{({({(((({{(({({.....,,..))))),,,))})))}|,|..{,{,((((((.((((..(((..(((.....)))..)))..)))).))).))).}})))))))))))))}}.)))}))})}}....}}}}),.))}}||{((((...}}},,,|||{,,..)))).,,))))))))))....|||}}|,(((((((((((.(((.((((((....))))))......,((((....)))).....))).).)))))))))).))}})))||}||||,(((((,(((.,........}}}.})))}))}}|}}}}}.((((((((.((....(((.(((((((..((((((.((((({,{...........(((((.((((.{....}))))))))).{{{.,{{{......,{||.(((({...})))).||||..,,,,.....}}}},,}))}}}.....))},,},))).)))))).)))))))))).)).))}.))))),|}}}))|)),},}))},,)))).||.,,,))..}}))),,{||||(((((((((...(((((({..{((((((((((((((((((((.....((....)).....)),}))}...,)))))).).))))))))))))))...}),}))))))...,{{.{|||||,|||{||,,||.||||||...)))))}..})))},))})}}.}},.})))}....,,,,.............
Back