Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001364750.2
Sequence Length
1483 nt
GC Content
0.6365
GUGGCUCGCGCGUCUUCCCAGGACUCCCCCGCGCCGGAGAGGCCCGCAGGACCGCCGAGCCCACACUCCGCUCCCGCCCGGGCCCCGCUCCCCCGCGCCGCCUUGGUACGCUCCGGCCACGCCCCCUCGGACGCGCUUGGUACGCGCCGGGCUCCCCCGCUCGCCUCAGUGGUUCGGCCGCGGCGACCCCACUCCGGCGGCGCGUCCCCCGAGCUUGGAAGGUGCUCGGGUCUUCGGGGCACUGGGUCCCAUCGGUCCCUCCUCACCUGGGCUCACCCUCGGGGGUCUGGCCGUGAGCGAGCACCGGCUCAGCAACAAGCUGCUGGCUUGGAGCGGCGUCCUCGAGUGGCAGGAGAAGCGCAGACCCUACUCUGACUCCACUGCAAAGCUGAAGCGGACCCUGCCCUGCCAAGCCUACGUGAACCAAGGCGAGAACCUGGAGACCGACCAGUGGCCGCAGAAGCUGAUCAUGCAGCUGAUCCCUCAGCAGCUGCUGACCACCCUGGGCCCCCUGUUCCGGAACUCCCAGUUGGCACAGUUCCACUUCACCAACAGAGACUGCGACUCGCUCAAGGGGCUCUGCCGCAUCAUGGGCAACGGCUUCGCGGGCUGCAUGCUGUUCCCCCACAUCUCCCCCUGUGAGGUGCGCGUGCUCAUGCUCCUGUACUCGUCCAAGAAGAAGAUCUUCAUGGGCCUCAUCCCCUACGACCAGAGCGGCUUCGUCAGUGCCAUCCGGCAGGUCAUCACCACCCGCAAGCAGGCAGUGGGACCUGGUGGUGUCAACUCAGGCCCAGUCCAGAUCGUCAACAACAAGUUUCUGGCAUGGAGUGGUGUCAUGGAGUGGCAGGAGCCCAGGCCUGAGCCCAACAGUCGGUCCAAGAGGUGGCUGCCAUCCCACGUCUACGUGAACCAGGGGGAGAUCCUGAGGACCGAGCAGUGGCCAAGGAAGCUGUACAUGCAGCUCAUCCCGCAGCAGCUGCUGACCACCCUAGUGCCGCUGUUCCGGAACUCGCGCCUGGUCCAGUUCCACUUCACCAAGGACCUGGAGACACUGAAGAGCCUGUGCCGGAUCAUGGACAAUGGCUUCGCCGGCUGCGUGCACUUUUCCUACAAAGCAUCGUGUGAGAUCCGCGUGCUUAUGCUCCUGUACUCUUCAGAGAAGAAAAUCUUCAUUGGCCUCAUCCCCCAUGACCAGGGCAACUUUGUCAACGGCAUCCGGCGUGUCAUUGCCAACCAGCAGCAGGUCCUGCAGCGGAACCUGGAGCAGGAGCAACAGCAACGAGGGAUGGGGGGGUAGUGGUUACCCCGGGCUGGGCCCCUCCAGGAGUCACAGAUGAGGCCCCCGCAGAGACUGGUGACACGCUUCUGAGCAGGGGCCCCUGGGGACUUCAACUGCCCAGCAACAUGGAGGAUGGUGUCCUGAGGCCUCCAAGGACGGUCCCCACCCCUCUACGUUUCCCCAAUAAAGCCUUUUAAAAACCUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-617.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -643.92
Frequency: 0.0000
Diversity: 369.23
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((((((.((..(((((((((((((((((((.((((.(((((((.(((..((.(((......))).))))).))..)))))...))))...))))(((((((((..((((((((((.((((((..((((((((((((....(((((((((...(((((......)))))...)))).)))))...))).......)))))))))(((((((.........))))))).....((((...((((.((((..(((........))))))))))).)))))))))).)))))).))))((((....))))((((......))))(((((((((.(((((((((.(((.((((..((....((((......))))..))..))))...)))))...))))...))))).))))))).......))))))))).....((.(.(((((((....(.((((.(((((((.(((.(((((((.........)))))))))).......((((((((((((..((((((.((....))...))))))........))))).....(((...)))....)))))))((((........)))).))))))))))).).((((((.((..((.((((........)))).)).))))))))....(((((((((((((((((.(((((...))))).)))))........((((((((.....))..)))).))((((....)))).(.(((((((((((((.........)))))...)))))))).)....((((((((.((((..(((..(((.....)))..)))..)))).))).))).)))))).))))))))...(((....))).....)))))))).)).(((((...))))).((((....)))).....))))))).))))).)))(((((((((((((.(((.((((((....)))))).......((((....)))).....))).).))))))))).))).)).))))((((.(((((((((...((.(((......))).))..(((.((.((((((((.((....(((.(((((((..((((((.((((((((...........(((((.((((.(....)))))))))).......)))))...((((.(((((...))))).))))............((((.(((....))).))))...))).)))))).)))))))))).)).))).))))).)).))).)))).))))).)))).((....))...(((((.((((((((((((((...(((((((...((((((((((((((((((((.....((....)).....)).)))....))))))).).))))))))))))))...)).))))))).....(((.....))).((((((..((...)).))))))..))))).)))))................)))).............
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((({((({(,..(((((((((((((((((((.((((.(((((((.(((..((.(((......))).))))).)}.,)))))...))))...))))(((((((((.{((((((((((.((((((..((((((((((((....(((((((((...(((((......)))))...)))).)))))...}}}..,,,..)))))))))(((((((.........))))))).....((((...((((.((({..(((........)))))))))))}))),)))))).)))))).))))((((....))))((({......)))}(((((((((.(((((((,(.(((.((((..((....((((......)))).,))..))))...))),,.,.))))...))))).))))))).....,.))))))))).....{{{(,({(((({,,{.((((,({(,,(,((.(((.(((((((.........)))))))))).}}..}}|||||,,|||.|.,||.,|||||.|,{((,,.||,.||{{{{{.,,.,|.|,{{{{(,{...,||{{,.|||||||((((,{..,,{,||||.|}|||||||||{|.((((((.((..{{.((((........)))).)).))))))))....(({{{{({{{{{(((((.(((((...))))).)))))........,,{{{{{{.,.,.|}..}})).,}((((....)))}{(,({((((({(((((......,..)))))..,)))))))).}....,||||||{.{(((,,{{{..{{{.....))},,))),.)))),))),))),)))})))))))))))},.|||.}},))}...},))))))},.,||}||||.,,}},...((((....)))).....))))))).))))).))}(((((((((((((.(((.((((((....))))))......,((((....)))).....))).).)))))))))},)).,,.))))|(((.(((((((((.{{,{.,,.,{{{{{||}.|,..(({.,(,((({{(((.({....(((.(((((((..((((((.((((({,{...........(((((.((((.{....}))))))))).{{{.,{{{......,{||.(((({...})))).||||..,,,,.....}}}},,}))}}}.....))},,},))).)))))).)))))))))).}).))}.)))))})),})).)))),})))).)))).||....}}...(((((.((((((((((((((...(((((({..{((((((((((((((((((((.....((....)).....)),}))}...,)))))).).))))))))))))))...}),})))))).....{.((({((,|{,,{{{|{..{,,,})),,))}}},,))))).)))))...}},..........)))).............
Back