Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001365578.1

Sequence Length

1841 nt

GC Content

0.4340

CUCCCGGAAGCGGAGCACCGAGCCGGCAAAGGCUUGGGUGUGAGACAGCAGCGGUGGCAGACACCGCAGAAGCAAAGAGCAGUGAGGCUCCUGCAUUCGGGUGGAGCACCAUGGACGAAGCUGGCAGCUCUGCGAGCGGCGGGGGCUUCCGCCCGGGCGUGGACAGCCUGGACGAACCGCCCAACAGCCGCAUCUUCCUUGUGAUCAGCAAGUACACACCUGAGUCGGUGCUGAGGGAGCGCUUCUCGCCUUUUGGCGACAUCCAGGACAUCUGGGUGGUGCGGGACAAGCACACCAAGGAGUCCAAGGGCAUUGCUUUCGUCAAGUUCGCCCGCAGCUCACAGGCCUGCAGGGCCAUGGAGGAGAUGCAUGGCCAGUGCCUCGGCCCCAACGACACCAAGCCCAUCAAGGUUUUCAUUGCUCAGUCCCGAUCAUCUGGAAGUCACCGAGAUGUUGAAGAUGAAGAACUUACAAGAAUCUUUGUUAUGAUACCAAAGUCCUACACAGAAGAAGAUCUGCGGGAAAAAUUUAAGGUGUAUGGAGAUAUCGAGUAUUGCAGCAUUAUUAAGAAUAAAGUGACUGGAGAAAGUAAAGGUUUGGGCUACGUACGAUACUUAAAACCAUCACAAGCUGCCCAAGCAAUAGAAAACUGUGAUCGAAGUUUUAGAGCAAUCUUGGCUGAACCUAAAAAUAAAGCAUCUGAAUCCUCUGAACAAGAUUAUUAUAGUAAUAUGAGGCAAGAAGCUUUGGGACAUGAACCUAGAGUAAAUAUGUUUCCAUUUGAACAACAAUCUGAAUUUUCAAGUUUUGACAAGAAUGAUAGCCGAGGCCAGGAAGCAAUCUCCAAACGCUUGUCAGUUGUAUCAAGAGUUCCUUUCACUGAAGAACAGCUUUUCAGCAUUUUUGAUAUAGUACCAGGAUUGGAAUAUUGUGAAGUUCAACGAGAUCCUUAUUCAAAUUAUGGUCAUGGAGUGGUUCAGUAUUUUAAUGUAGCAUCAGCUAUUUAUGCAAAAUACAAAUUACAUGGAUUUCAGUACCCUCCUGGGAACCGAAUAGGUGUUUCCUUCAUUGAUGAUGGAAGUAAUGCAACAGAUCUCCUUAGAAAAAUGGCAACACAGAUGGUAGCUGCACAGCUUGCAUCAAUGGUGUGGAAUAACCCAAGUCAGCAACAAUUUAUGCAAUUUGGAGGAAGCUCUGGAUCACAGUUGCCUCAAAUCCAGACAGAUGUUGUACUUCCAUCAUGCAAAAAAAAAGCUCCUGCUGAAACUCCUGUGAAAGAAAGACUUUUUAUUGUGUUUAAUCCUCAUCCUUUACCUUUAGACGUAUUAGAAGAUAUAUUCUGUCGUUUUGGUAACCUGAUCGAAGUUUACCUUGUGUCAGGAAAAAAUGUGGGGUAUGCCAAGUAUGCCGAUAGAAUAAGUGCUAAUGAUGCCAUUGCCACUCUACAUGGAAAGAUUCUGAAUGGGGUGAGACUUAAAGUUAUGCUGGCAGAUUCGCCAAGAGAAGAAUCUAACAAACGGCAAAGAACUUACUGAUUCUUGAGGUGAUGAUUUUCAUACUUGUGUUGUGUUCUUUCUACAGAACAAAGACUAAAUAAUGACAUAAUCCUCAGCUGACUGACUGAAAAUGUGACUGGACGCAUUCCCUGUGGACAGUUGACAGCUUUUUUUUUUUCCAUAUACCUGAUAGUCUGUGUACAGCAUUGUUUUGUCUGGGAAGCAGGGAUUGCUGACAUGUAUUUUUGAAUCCAUACAUUAAUGCUAAAACGAAUAUAGUAGUUGUUCCUUAGAGCAAUAUGUUGUUACGUGUAGCAGAAAUAAAGUUUUCUUUGCUUAACUAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-536.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -568.10

Frequency: 0.0000

Diversity: 611.40

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

...(((....))).((((((((((......))))).))))).........((((((.....))))))..(((((((((((((...((((((.((.((((.((((....))))...)))))).)).))))))))(((((((..((((...((.((((((.......)))))).))....))))....))))).))...(((((.....)))))..((((..(.((((((((((((((..........((((....))))((((((.((((.((((((((((.((((((.((((.......((((....((((...((((.....))))..))))...))))...((((.(((.(((((((.(.....).)))))))..)))...))))...........(((((......)))))....))))..)))))))))))))))).))).).).)))))(((((((.(...((((.((((((((.....(((((((..((((((((.(((((.((....((.((((((........((((((.(((((((.........(.(((((((.(((....))))))).))).)..........((((((((..(....(((..........)))....)..)))))))).....((((((........))))))...((..((((((((....(((.....(((((.(((....((((........................))))..))).)))))((((((((.((.....))...))))))))(((((...(((.(((.(((....))).))))))....))))).)))....)))))))).)).))))))).)))))).....(((((((((((((........(((((((.....))))))).)))))))))))))..((((((..((..(((..(((((((((......(((....(((.....)))....)))((((((..(((((((...(((((....)))))......))))))).)))))).)))))))))))).))))))))..(((.....)))((((......((((((((((((((...((((((..(((.....((.....((((((...((((..((((....))))..))))..(((.((......))))).....(((........))).((((((((....))))))))....)))))).....)).....)))))))))))))))))))).))).....)))))))))).))..)).)))))..))...)))))).))))))).......(((((((((((((...(((((...(((((......))))).))))).)))))((((((..(((.....)))..)))))).....(((((((((((((...))))))).........((((.(((((....))))).))))))))))((((...))))....)))))))).....(((((.(((((..((((((..........))))))......)))))...)))))...))))))))))))..).)))))))...((((((((((((((......))))))............)))))))).)))))))..))))))).)...))))((((..((((.....))))..))))...((((..((((((((((((.(((...(((((((((....))).)))))).))).))))))).)))))..))))..((((((..........))))))...(((((..(((((((..(((.((((((....)))))))))..)))).))).)))))............))))))))).......

Thermodynamic Ensemble Prediction

.{((((,..,|||{(({(((((((......)))))))||||,...,.||.((((((.....)))))).,{{(((,,(((({{.,.,||||{}||.|{{({(({{,{{,||||.,.,||||||||,||||}|}}{{(((((..((((.,.((.((((((.......)))))).)),,..))))....))))).}}...(((((.....)))))..,,|||||||||,{{||{{|{{|,}}}}}}.}|((((....))))|(((((,(({{.{|||||||(({(,,,,,.,|||}....,{((({,...{(((,.,((((,,.,,|}}}..||||{{,|||}...||{{,||{,|||{(((,(.,,,,|,))}}))).,}}},,,)))}......,....{((((......))))},,.,}))),.}}|}||}}|||||||}.}}}.},,,))))}||,,{{{|{,{,.||,.,.,|.,||||||||..,,,..,,,,,((((...((((......)))).)))}........{((((({((((((,.,,,{{{,,{,{,{{{{{,{{...,.,.{{{{{.,({{{{{..{{...{(((({(((,,(,,..,,,..,,,,,,,.,}}....|,{}},,,))).....,,,((({{{{{,..,||||{{({(...((.,,(((..............}}}..,.}}.,.}}}})}},..,|||}},,}}}}.....((((({,...((((((((.......)))))))).....)))))),{{(({,,,,..,,,.{{,...,))),))}}}),...},))).})))).))))).,,..))..))))))..))))){{{{{(((((((((((((........(((((((.....))))))).)))))))))))),..((({((,,{(,.{{{{{({{{{{{{,.||,,,,{{.|||||..,,,.,))}|,||||((((({..(((((({.,,(((((....))))}..,,..})))))).},||||,,||||||||||,{|{,,,,))}.{{{....,||}||||,.,|..{{{{(((((((((|,.,|(({{{..{||,,,,.{,.....((({{(...((({..{((|.,.,)))),.)}))..||||||,,....}}))}.{{|,(((........||}.{{(({(((....})))}}}}...,)))))),....}|,||,.||||)))))})))))))))}.}||.,,,.||||..,}))}}}}|,}}}}))||,{{,,,.,|}}}},,},)}}))}....((((((({(((((...(((((.,.(((((......))))),))))).))))}((((((..(((.....)))..)))))).....{((((((((((((...))))))).........{(((.{((((....))))).)))))))))){{{....})})....))))))))..|,.,{{{{.{{(((..((((((..,.......))))))......})))).,,||}},...}})))))|{(|{{{,({{{.{{{{..{{..(((.((((((......))))))..)))..}}..))))...}}}),)))|)},}}}}}},,,...{(((((((..((((.....))))..))))).}))}}})}}},,,)}}}))}}}}}})|||.|,|||,}}})))})})}}}}))))))))|{|||{|||,,|||,,,{(((((..........)))))}...(((((..(((((((..(({,((((((....)))))))))..)))).))).)))))..,,...,}}..))))))))}.......