Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001365715.1
Sequence Length
7129 nt
GC Content
0.4664
GGGCCCGAGUGUUGUCGGCUGGGAAAUGGCGGCCGCGGGCUUGGUCGCUGUGGCAGCGGCUGCCGAGUACUCUGGCACGGUAGCGUCGGGAGGUAACCUCCCUGGUGUUCACUGCGGCCCAAGCUCCGGGGCAGGCCCUGGUUUUGGCCCGGGCUCGUGGAGCCGCUCUCUCGAUCGAGCCCUGGAGGAGGCGGCGGUCACUGGGGUGCUGAGCCUGAGCGGCCGGAAACUGAGGGAGUUUCCCCGGGGAGCGGCCAACCACGACCUGACGGACACCACCCGGGCGGACCUGUCGCGAAAUCGCCUUUCAGAAAUUCCUAUAGAAGCAUGUCACUUUGUUUCUCUGGAAAAUCUCAACUUGUACCAAAAUUGUAUUCGUUAUAUUCCAGAGGCAAUUUUAAACCUACAAGCUCUAACAUUCUUAAAUAUUAGUCGGAACCAACUGUCAACAUUGCCGGUACACUUGUGUAAUUUGCCAUUGAAAGUCUUAAUUGCUAGUAAUAACAAAUUGGUGUCACUUCCAGAAGAAAUUGGACACCUUAGACAUUUGAUGGAACUUGAUGUGAGCUGCAAUGAAAUUCAAACUAUACCUUCCCAAAUUGGUAACCUGGAGGCCUUGAGAGACCUUAAUGUAAGAAGAAAUCACCUAGUACAUUUGCCUGAAGAGCUGGCGGAGUUGCCUUUGAUACGGUUAGACUUCUCAUGCAAUAAAAUUACCACAAUCCCUGUUUGUUAUCGGAACCUCAGGCACCUACAGACGAUCACCCUAGAUAACAAUCCACUACAAUCACCUCCUGCACAGAUAUGUAUAAAAGGCAAAGUCCACAUAUUUAAAUACCUGAACAUACAAGCUUGUAAGAUUGCUCCAGAUCUGCCGGAUUAUGAUAGGAGACCGUUGGGUUUUGGCUCCUGCCAUGAAGAACUGUACUCAAGUCGCCCUUAUGGAGCCCUUGAUUCAGGCUUCAAUAGUGUGGACAGUGGUGAUAAGAGAUGGUCAGGGAAUGAACCUACAGAUGAAUUUUCAGAUCUGCCUCUUCGAGUAGCAGAGAUUACUAAAGAACAAAGACUACGAAGAGAAAGCCAGUACCAAGAGAACCGCGGCAGUUUGGUAGUAACAAACGGCGGAGUGGAACAUGAUCUGGAUCAGAUUGACUACAUAGACAGCUGCACCGCAGAGGAAGAGGAGGCCGAGGUGAGACAGCCCAAGGGACCAGACCCAGACAGCCUUAGUUCACAGUUUAUGGCGUAUAUUGAACAGCGGCGAAUCUCUCAUGAGGGUUCACCAGUAAAGCCAGUAGCCAUUAGGGAGUUUCAAAAAACAGAAGAUAUGAGAAGAUAUUUACAUCAAAACAGGGUUCCAGCUGAGCCAUCUUCCCUCCUGUCACUAUCAGCAAGUCACAAUCAGCUGUCACACACAGACCUGGAACUUCAUCAGAGAAGGGAGCAGUUAGUAGAGCGCACUCGGAGAGAGGCUCAGCUUGCUGCCCUGCAGUAUGAGGAGGAGAAAAUAAGGACCAAGCAGAUCCAGAGAGAUGCUGUCCUGGACUUUGUCAAACAAAAAGCAUCACAAAGUCCACAAAAACAGCACCCGCUCCUAGAUGGCGUAGAUGGUGAGUGCCCCUUCCCAUCCAGAAGGUCUCAGCACACUGAUGAUAGUGCCUUGUGCAUGUCGCUGUCAGGGUUGAAUCAAGUGGGCUGUGCUGCUACCCUGCCUCAUUCUUCUGCCUUCACGCCUCUUAAGAGUGAUGACAGACCUAAUGCUCUAUUAAGUUCACCUGCAACAGAAACAGUUCAUCAUUCCCCUGCAUAUUCUUUUCCUGCUGCUAUCCAGAGAAAUCAGCCUCAGCGCCCUGAAAGCUUCCUUUUCCGAGCAGGUGUCAGGGCAGAAACCAACAAAGGUCAUGCUUCACCCCUUCCUCCAUCUGCUGCACCUACCACUGAUUCUACAGAUUCCAUAACAGGACAGAAUUCAAGACAGAGAGAAGAAGAGCUGGAAUUAAUAGACCAACUGCGUAAACAUAUUGAGUACCGGUUGAAAGUGUCUCUACCUUGUGAUCUCGGAGCAGCUCUAACUGACGGUGUUGUUCUUUGCCAUUUGGCCAAUCAUGUGCGACCUCGAUCUGUCCCAAGCAUUCAUGUUCCCUCACCAGCUGUACCUAAAUUAACAAUGGCGAAAUGCAGGCGAAAUGUGGAAAAUUUCCUAGAAGCUUGCAGAAAAAUUGGUGUACCUCAGGAGCAAUUAUGUUUGCCUCUCCACAUUUUAGAAGAGAAAGGUUUGAGCCAGGUUGCAGUGACGGUCCAGGCUCUCCUGGAACUUGCCCCACCCAAGCAACAGCAGCACCAGUUAUCUGCUGUUUGAGGAUCCCCAGGACGGUGGGCACUGGCCUGGCCAAAACAAGGAACAGGACACCGUGAUUGCUGCUGCCAGCUGUCUGCUUAAACAAAGCUCUUGUGUGUUCUCAGAAGGGACCGUUCCCAUGAUUCCUAACAGGAAUAUUUUGCUUCAUUUCUCCAUUUUAGGGGAGGUUAUUUCCAUUUCCAUUGAAUUUUUUUACGAAGACACCAUUGGUUUUCUCAGAUGAAACUUCUCUUACUGAAAACCCAGCACCUAACUUGGCUGUGUUUUCCUGGAGAGCAGGCGUGUUUCACGUGCCAGAAAGCACAUCUUCUGUGUUAGGCACAAGCAUGCUGUGCCAUUGUUUUUACCUGGUCUCAAGACAACUGGUCUGCUGGUUUCUAAACUUGGUUGUUCAUUAGACUCUCCUGGAGUAUUUGUUAAAAUACAGAUUCACAUUCAGUAGAGCUGGGGUAAGGCCUAGGAAUCUGCAUUUUCAACAACCAUUGCACAUGUUUUUGUUUUUGUUGGAGAAGGAGUUCUGCUCAGUCGCCCAGGCUAGAGUGCAGUGGCAUAAUCUCAGCUCACUGCAACCUCCGCCUCCCGGGCUCAAGCGAUUCUCCUGCCUCAGCCUCCCGAGUAGCUGGGACAACAGGUGCCCGCCACCAUGCCUGGCUAAUUUUCUUGUAUUUUUAGUAGAGAUGGGAUUUUGUCAUGUUGGCCAGGCUGGUCUCAAACUCCUGACUUCAAGUGAUCCACCUGCCUCGGCCUCCCAAAAUGCUGGGAUUACAGGCGUGAGCCACUGUGCCCGGCCUCCCAGAGUGCUGGGAUGACAGGCGUGAGCCCCCGCGCCCGGCCUCCGAGAGUGCUGGGAUUACAGGCGUGAGCCACUGUGCCCGGCCUCUGAGGGUGCUGGGAUUACAGGCGUGAGCCACUGCGCCCGGCGCCCGGCCCAUUGCACGUGUUUUUCAUGUAGUGGAACCACUGUUCAAAGCUAGAUAUUUGUAUGUUUGCGGGGGAGGGUAAUGGCCCCCUGCAUUUUUCACCCACAUUUAAAAUCAAAAGCUAUAUUAUGAGGAGUUGGACUGUUCUGUCAAAGGCAAAACAAAAAUAAUAUAGAAGGCCUAGGUUUUGCAUAGUCUUCUUUUUUUUAAGAGUUGGGGUCUUGCCGUAUUGCCCAGGCUGGUCUGAAACUCCUGGGCUCAACUGAUCCUCCCGCCUCAGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACUGGAGUGAGCCAUCGGGCCUGGCCCAGAUUUUGCAUAGUAAAACAGUGAAACAGAUAGAGUUGUAUUUAAGGUCAGUAUUCUAGGCCUCCCUUCAACUGCAGUCAUACCAUCAUAGAAGAUAGUUCUAUGUCAUCCUGUUAUCUGGACAUUAUAAUAAACAACAAGCCCUCUAUACACAGGUUCCAAACCCCGUUAUCUAGACAUUAUCAACAACAAGCCCUCUCUCUAUACAGAGUUUCCAAAUUCUGAAGCUGAUAGCGCACUUGGUCUCACUGAGCCUCCCUCCCCGCCCUCCUGCUGCUCCUCAGACAUCUGGGCCUGCAGACACAUUGCAGUUACAGCACAUACACUUCUAGCUCGGAAAAGCCUAGUUUCUUGUAUUUCUUUCAGGUAACUGCCAGUUUCUGUGGCUGAAUUUAAGCACUUACAGCAUCUUCCUAGCUGGGUGUGGUGGCUCACACCUGUAAUCUCAGCACUUUGGGAGGCUGAGGCGGGCAGAUCACCUGAAGUUGGGAGUUUGAGACCAGCCUGACCAACAUGGAGAAACCCCGUCUCUACUAAAAAUACAAAAUUAGCUGGGCGUGGUGGUGCAUGCCUGUAAUCCCAGCUACUCGGGAGGCUGAGGCAGGAGAAUUGCUUGAACCCAGGAGGCGGAGGUUGUGGUGAGCCAAGAUCGUGCCAUUGCACCCCAGCCUGGGCAACAAAAGCGAAAUUCCAUCUCAAAAAAAGAAAACGCGCCCCAUCUCGCUCCACCACAAGCGCCUUUAUAUACUCAAUGAUGGGUGGAGGAAAAGGGCCCAAGGGCUCACACCGCACAGGAGCCUUUACUCAAGUUUCAGCUAGUUUUCCUUCCCCUGCAUUUUGAACUCCUUUUAGUUGUUGGUGAUAUCCUUUGGUGUUCACUGCCUUUGUAAAACAAGUAAAUAAAGUAAGCGGAAGAUAUCUCUUUUGUUUCUGUAGUUGUUAACUGUUCUGGAUUUUCUUUACAAUGCAUCCAUUUGGGCAUAAUGUUAUCCCUCUUUUUAUCAGGUAAAUGUAGCAUCUAAAAGUAGCUUUGGAUCAAAUCAUGUUGAAUACCUGGUCAAAGUAAUGUUUUCUUCCUUGUUCUUGCAGAGAAACAAAUUCAUCAGAACAUUACCACUUGACCAGGUUUAAAAUUGUAUAACAGGCUGGGCAUGGUGGCUCAUGCCUAUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGCCGAGGCAAGAGGAUCACUUGAGCCCAGGAGUUUGAGAGCAGCCUGGGCAACAUAGCAAGACCCUGUCUCCCAAAAAUUAAAAAAAAAAAAAAAAAACCAGGUGUGGUGGCACCUGCCUGUACUCCCAGCUACUCAGGAGGCUGGGGUGGGAGGAUCACUUGAGCCUGGGAGGUUGAGGCUACAGUGAGCCAUGGCUGCACCACU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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-2520.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -2645.72
Frequency: 0.0000
Diversity: 1325.72
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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