Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001366537.3

Sequence Length

1826 nt

GC Content

0.5340

ACUCCAUGUGAUGUUUGCUUGGUUGCCUGUUCCCUUUUCUACCUGCAGAGCACGGUUCCCAUAAGGGCGGCGAGAUCAGCCUCCUGUCUCAUCUGGAAGACCACCACUCUGGGGUCUCAGAGGAAUGAUGGAAGCCUUGGGGUUUCUAAAAUUGGAAGUGAAUGGCCCCAUGGUGACGGUGGCCCUGUCAGUGGCUCUCUUGGCCCUCCUGAAAUGGUACUCCACAUCAGCAUUCUCAAGACUGGAGAAGUUAGGCCUCAGACAUCCCAAGCCUUCUCCUUUCAUUGGAAACUUGACAUUUUUCCGCCAGGGUUUUUGGGAAAGCCAAAUGGAGCUCAGAAAGCUGUAUGGACCUCUGUGUGGGCGUCGGGUUUGGAGUUCAAGUCGGUAGCCGACAGCGUUCUGUUUUUACGUGACAAAAGAUGGGAAGAGGUCAGAGGUGCCCUGAUGUCUGCUUUCAGUCCUGAAAAGCUGAACGAGAUGGUUCCCCUCAUCAGCCAAGCCUGCGACCUUCUCCUGGCUCAUUUAAAACGCUAUGCGGAAUCUGGGGACGCAUUUGACAUCCAGAGGUGCUACUGCAAUUACACCACAGAUGUGGUUGCCAGCGUCGCCUUUGGCACCCCGGUGGACUCCUGGCAGGCCCCUGAGGAUCCCUUUGUGAAACACUGCAAGCGUUUCUUCGAAUUCUGCAUCCCCAGACCUAUCCUGGUUUUACUCUUAUCAUUUCCAUCCAUAAUGGUCCCACUGGCCCGGAUUUUGCCCAAUAAGAACCGAGACGAACUGAAUGGCUUUUUUAACAAACUCAUUAGGAAUGUGAUUGCCUUGCGGGACCAGCAAGCUGCCGAAGAGAGGCGGAGAGACUUCCUCCAAAUGGUCCUGGAUGCCCGACAUUCUGCAAGUCCCAUGGGCGUGCAAGACUUUGACAUCGUCAGAGACGUUUUCUCCUCUACUGGGUGCAAGCCGAACCCUUCCCGGCAACACCAGCCCAGCCCUAUGGCCAGGCCUUUGACUGUGGAUGAGAUUGUGGGCCAGGCCUUCAUCUUCCUCAUCGCUGGCUAUGAAAUCAUCACCAACACACUUUCUUUUGCCACCUACCUACUGGCCACCAACCCUGACUGCCAAGAGAAGCUUCUGAGAGAGGUAGACGUUUUUAAGGAGAAACACAUGGCCCCUGAGUUCUGCAGCCUCGAGGAAGGCCUGCCCUAUCUGGACAUGGUGAUUGCAGAGACGCUGAGGAUGUACCCGCCAGCUUUCAGAUUCACACGGGAGGCAGCUCAGGACUGCGAGGUGCUGGGGCAGCGCAUCCCCGCAGGCGCUGUGCUAGAGAUGGCCGUGGGUGCCCUGCACCAUGACCCUGAGCACUGGCCAAGCCCGGAGACCUUCAACCCUGAAAGGUUCACGGCUGAGGCCCGGCAGCAGCACCGGCCCUUCACGUACCUGCCCUUCGGGGCCGGCCCACGGAGCUGCCUCGGGGUGCGUCUAGGGCUGCUUGAGGUCAAGUUGACACUGCUCCACGUGCUGCACAAGUUCCGGUUCCAAGCCUGCCCUGAGACCCAGGUACCGCUGCAGCUAGAAUCCAAAUCUGCCCUAGGUCCAAAAAAUGGUGUCUAUAUCAAGAUCGUAUCCCGCUGACACAGAAGGCUGCCGGGUGGGGGGAGGGCACCCCCAAAUUCAAAGAAAACCCUAAGUGUGGAUGUUCAGAAUUUUGGAAAAAUGUCACUGAAGUGAUUGAAAGAGUGCCUGGCAUGCAAGGAUAAGAGGUUCUUUACAUAACAUUUCCUAAAUGCUUAAUAAACGUUUGUUGCACUUGGUUUUGACAUUGCCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-619.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -651.45

Frequency: 0.0000

Diversity: 477.44

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.......((((((((((((..(((((((((((((((....((((((...))).)))......))))).))))......(((((((((...((((((((((((..((((.((((((((((....(((..((((((((....))))))))..))).....)))..))))))).))))..))).(((((.((((.((((((((((((....((((..(((....)))..))))..(((.(((((..(((((((((.((...........)).)).)))))))..)).))))))............(((((((((((((((((.....))))(((.((((.....)))).)))))))).))).))))).((((((.((((.(.(((.((.(((((..(((((....))))).....(((.(((((((((((((((((((..((((...((((((...(((((((....)).))))).((((......))))....))))))....))))..)))))...((((((((((......(((...)))....(((((((.((((((((...(((((((((...(((((((((((.......)))))))).)))...)))))))))......((.(((.((((..(((....))))))))))))....(((((.((...)).))))).)))))...))).)))))))(((......)))...............((((((((((.(((((((.(.(((.(((.((((........)))))))..........(((.((.(((((((........))))))).)).))))))..).))))))).....(((((.......))))).(((.....)))(((..((((.((.(((((((((.........)))....)))))).)).))))))).....(((((((..................((((...((((.........))))..)))).(((..(((....)))..)))))))))))))))))).))..)))))))))).......))))).))))..(((..(((....)))..)))..........))))).)))))))).))))).).)))).)))))).)))))))).)))).)))).)).)))....((((((....))))))...((((.(((.((((((((((((((.(((.(((.....))).))).))...)))...))))))...))).)))........)))).)))))))))....))))))))).(((((((....((.(((((.((((((.......(((((.(((..(.(.....).)..))))))))))))))))))).))..)))))))...((((.((((.(..((((((((....)).))))))..)))))..)))).))))))))))((((((((((..(((((((...((((((((.(((...(((((((.....(.(((((((...((((.(((((....))))).......)))).))))))).)...))))))).......))).))))))))...)))))))...((((((..((..(...((((....((((.(((.....)))..)))).....)))).)..))..)))).))..)))))..))))).((((((.......)))))).........((((((..(((((((((((((.((.((((.(((((...(((((....)))))....((((.((((...((......))...)))).))))........))))).)))).)).....)))))))...))))))))))))))))))))...

Thermodynamic Ensemble Prediction

.,,,,..({(((((({((((((({((({,,{({{{,,{{{(,(((({{.}},,|||.,{...,||||{(((..{,,,.({{((((((...{((((({(((((.,(({{.((((((({((....{((..((((((((....))))))))..))).....)))..))))))).))))..))),||{((.((((.((((((((((((....((((..(((....)))..))))..{((.(((((..(((((({,,.((,..........}}.,)})))))))..)).)))))}............{((((((((((({((((.....))))(((.((((.....)))).)))})))).))).))))}.((((((.((((.{.{(.{((.(((((..(((((....))))).....(((.((((((({(((((((((((..((((...((((((.,.(((((((....})}}}})).||{{......}}}}....))))))....))))..))))}...((((((((((......({(...}}|,..{(((((((.((({((({...(((((((((...(((((((((((,....,.))))))))},)).,.)))))))))......((.(((.((((..{{{....))))))))))}}..|.(((((.({...)).))))).}))))...))).)))))))|{{......))},...........,,,({((((((({.,((((,,.({(((((((.((((,.....,,))),))),{,.,..{,.((({(,,((,,,,,.,,,.,},))))|||{||.,,,||,.,,{|||||||.....,,(((.......)))((((,{....,)))}...,}|||}||.|,||,,,||}}}}{{{{.|||{...)))),)})).},|{{((((...))))}}}..},,,}}}}.,,,.{{{((({...((((.........))))..,.,,.|||}}|,,....)))}})}},...}}})))))))),))..))))))))))......,))))).}}},,.(((..(((....)))..)))........})))))).)))))))).))))).}.)))).)))))).)))))))),,))).)))).)).))),,,,|||{{{..,,))}}}}...((((.(((.((((((((((((((.(((.(((.....))).})).))...)))...))))))...))).)))....,,,,|}||,|||||}}}},,,.}|||||}}|.(((((((....((.(((((.((((((.......(((((.(((..{.{.....}.}..))))))))))))))))))).))..))))))).{.((((.(((({(..((((((((....))}})))))..)))))..)))).}|..((((((((((((((..((((((((.....,((((({,((({....).)))))))))))))))))..)))))))...,{(((({...,))).}}.,.,...))))))).........||||....))}.)))}},.....,,)).}}}))))})),)}))}.....,{{||,,.{{||,{{{.....})}.{||},.....,}}}.,,.}}}}},})}..}.},))))})})))))|((((|......))))),...,,....(({{{(,.{((((((((((({.{{.{(({.((({{..,(((((....)))}}..,,{({{.(({{..,{{...,,,|,...}}}}})))}.,....,.})))).}))).)).....}))))))...)))))))))))))))))))),,.