Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001367555.1
Sequence Length
752 nt
GC Content
0.6011
AGAGGCCACGCCCCCGGAAGCGGCGGUGCAGAACCCAGGGACCAUGGGCGCCUCCAGGCUCUAUACCCUGGUGCUGGUCCUGCAGCCUCAGCGAGUUCUCCUGGGCAUGAAAAAGCGAGGCUUCGGGGCCGGCCGGUGGAAUGGCUUUGGGGGCAAAGUGCAAGAAGGAGAGACCAUCGAGGAUGGGGCUAGGAGGGAGCUGCAGGAGGAGAGCGGUCUGACAGUGGACGCCCUGCACAAGGUGGGCCAGAUCGUGUUUGAGUUCGUGGGCGAGCCUGAGCUCAUGGACGUGCAUGUCUUCUGCACAGACAGCAUCCAGGGGACCCCCGUGGAGAGCGACGUAGAGACGGGGUUUCACCGUGUUAGCCAGGAUGGUCUCGAUCUCCUGACCUCGUGAUCCUCCCGCCUCGGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGAAAUGCGCCCAUGCUGGUUCCAGCUGGAUCAGAUCCCCUUCAAGGACAUGUGGCCCGACGACAGCUACUGGUUUCCACUCCUGCUUCAGAAGAAGAAAUUCCACGGGUACUUCAAGUUCCAGGGUCAGGACACCAUCCUGGACUACACACUCCGCGAGGUGGACACGGUCUAGCGGGAGCCCAGGGCAGCCCCUGGGCAGGAGACGUGGCUGCUGAACAGCCGCAAACCAUCUUCACCUGGGGGCAUUGAGUGGCGCAGAGCCGGGUUUCAUCUGGAAUUAACUGGAUGGAAGGGAAAAUAAAGCUAUCUAGCGGUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-307.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -319.03
Frequency: 0.0000
Diversity: 267.11
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((((((((((((....))).)).)).(..(((((((.((((...((((.(((((........))))).((((((((((.((((((.((...(((..........)))...)))))))).)))))))))).))))..)))))))))))..)...((.(..(((((.((....(((.((..(((((((((.((((.((.((.((((((..((((((((.(((.(((((...(((((...(((((((((.((((.(.((....)).).))))..))).))))))....)))))))))).)))..))))).((.((((.(((...))).))))..))...((.((.((((.......)))).)).))(((((.(((....))))))))....)))..)))))).))((((((((.....)).))))))...........)).))).).))))))))).)).)))....)).)))))..).))..))))))....((.((((.(((((((((((((.((((((((..(((((..........((.((((.(((.(((((((..((...))))))))))))......(((((....(((((...)))))))))).((((((((....)))))))).))))))(((((((.....)))))))......)))))..)).))))))..))))))....))))))).((((((((((......))))))))))..........)))).))........
Thermodynamic Ensemble Prediction
....((({(((((((((..{({,,{{{||,,..(((((((,.,((((({((({(((((||,,|{.{|||||.((((((((((.((((((.((...(((..........)))...)))))))).))))))))))}}},}|.,}})}|||)))}||...,|,|..{{||{.,,..||{||,,{|,|||((((((({(((,({.,(({(((({,.((,(((((.(((.((((({{{,((,,...||||||{{(.{{((.{.{{.{{{||,|{||,,..}}}.))))))},}}}}})}})))).)))..))))).||.((((.(((...))).))))..||...({.((,(({{.,,,,,.)))),)).}){{{{{.|||,,,.,))))))).)}})}),.}})))),}))),}}))|{{{{.....,))))}.........,))})))}}}}))}}|||.{|{((({{...||{|||||..|{{..(((((({((..,.{{{,,.|{{((((({,{(,{(({{,|||.,||,}},,.,|,.}}))}......((,{(((((((..({...)})))))))))).}}}}.}))..)))).)))...})))))))}))}((((((((....)))))))).{{|||.(((((((.....)))))))...,,.)}})).,)))))}})....,}))}),}...,||}}|((((((((((......)))))))))}...........{||.,,,)))}}}.
Back