Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001367837.2

Sequence Length

2216 nt

GC Content

0.5221

GUGCAGCUCUCGCCGGAGCCGAGCCCAGCCGAGCGUCCGCCGCUGCCCGUGCGCCUCUGCGCCUCCGCGCCAUGGCCGGCCUCAACUCCCUGGAGGCGGUGAAACGCAAGAUCCAGGCCCUGCAGCAGCAGGCGGACGAGGCGGAAGACCGCGCGCAGGGCCUGCAGCGGGAGCUGGACGGCGAGCGCGAGCGGCGCGAGAAAGCUGAAGGUGAUGUGGCCGCCCUCAACCGACGCAUCCAGCUCGUUGAGGAGGAGUUGGACAGGGCUCAGGAACGACUGGCCACGGCCCUGCAGAAGCUGGAGGAGGCAGAAAAAGCUGCAGAUGAGAGUGAGAGAGGAAUGAAGGUGAUAGAAAACCGGGCCAUGAAGGAUGAGGAGAAGAUGGAGAUUCAGGAGAUGCAGCUCAAAGAGGCCAAGCACAUUGCGGAAGAGGCUGACCGCAAAUACGAGGAGGUAGCUCGUAAGCUGGUCAUCCUGGAGGGUGAGCUGGAGAGGGCAGAGGAGCGUGCGGAGGUGUCUGAACUAAAAUGUGGUGACCUGGAAGAAGAACUCAAGAAUGUUACUAACAAUCUGAAAUCUCUGGAGGCUGCAUCUGAAAAGUAUUCUGAAAAGGAGGACAAAUAUGAAGAAGAAAUUAAACUUCUGUCUGACAAACUGAAAGAGGCUGAGACCCGUGCUGAAUUUGCAGAGAGAACGGUUGCAAAACUGGAAAAGACAAUUGAUGACCUGGAAGAUGAGUUAUACGCUCAGAAGCUCAAGUACAAAGCUAUCAGCGAGGAACUGGACCACGCUCUCAACGACAUGACCUCUCUCUGAGAGGCAGCCAGGUCGCUGCCCUCUGUCCUUCUCACAUGGUGCCUCCUACGCCCCUGUGGGCUUCUAGGAGCUCCGGUGGCCUGCCUUCUGGUUUGAACGUCAGAGCCUUCUUCUGAUGUGUCUGUGACUCUACAACCGAAAUAAAGACGGGCAGUCCUCCUCUUCAUGCCCCCUCAUUCUCAUUUUCUCCACUUGCUGCCUUUGAGCUGUAGCUGUGUGCCCUUAACCAUAGCCUGAAACACAAAGUGGGUGGUUAGCCUCUCUCACUCACAAAUGAAAAGCUUAUUACAAAAAGAAAAUUAUGCCUACAGGAUGCUUUUCUGAAGACGUGAAAACAAAAGCAAACUGGGCAUGUGCUCUCAGAUACCGCUGUUAGCUAACGGCAUCUGCAUGCCAAUAAUUUUUUUUUGUUUUUUUGUUUUGAGACAGGGUCUUGCUUUGUCACCCAGGCUGGAGUGCAGUGACACCAUCAUAGUUCACUGCAACCUCCACCUACAAGGCUCAAGCUAUCCUCCCACCUCGACCUCCCAAGUAGCUGGAACUACAGGUGUGCACCACCACACAAGGCUAAUUUUUGUACUUUUUUUUUUUUUUUUUGAGGCGGAGUCUCACUAUGUCGCCCAGGCUGGAGUGCAGUGGUGCAAUCUCGGCUCACUGCAACCUCCGCCUCCCGGGUUCAAGCAAUUCUCCUGCCUCAGCCUCCCAAGUAGCUGAGAUUACAGGCAUACACCACCACACCUGGCUAAUUUUUCUUUUGGAUUUUUAGUAGAGACAGGGUUUCACCAUGUUGGUCAGGCUGGUCUCAAACUCCUGACCUUGUGAUCCGCCUGCCUUGGCCUCCCAAAGUGCAGGGAUUACAGGCUUGAGCCAUCACGCCUGGCCAUUUUUGUACUUUUUGUAGAAGCGGGAGGGUUUCACUAUGUUGCCCAGGCUGGUCUUGAACUGCUGGGCUCAGGCAGUCUGCCCACCUCACCCUCCCAGGGUGCUGCAAUUACAGGCAUGAGCCACCGCGCCCAUCCCCAAUGGUUUUUCCUUAAAUAGAAAUUGUUGUGAAUGGAGGCUCAUCCUUGUAAACCGCUUAGGCAGCUUAAGAGUCAACAGGGAUUUGGAAAAACCAGCAAGCCUGUGUCAAAAAUGAGGCUCCCCUUGAAUGGGGCUUGAGCUACAGAUUCAAACAGCGGCAGUGACAUUUUGAUCUCCAUUUCCUCCUUUUCUUGUGUCUUUUCUCUGUGUUACACUGUGAGUGUGGUGACUGGGGCUUCCCGUGGCUUUACUCUUCACUGUUCAUCCAGCUCCCAGUCCUGGGAGGAAGUUCACCUCCACGCCCUGCCCUUAGAAAACUGACUGUACAAGGAGUGAACGGGCCUCCAUGAACAGGGAAAGUGCUGUGACGUCAGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-785.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -826.28

Frequency: 0.0000

Diversity: 569.72

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((.((((((((((.(.((....((((.((....(((((((((((((...((((((...((((....))))...))).(((((...(((....)))(((......))).......)))))..)))))))).))))))))..((((....))))..)).)))))).).)))))))))).))((((((((((((.(((((((((((((((.....((((((..((........)).)))))))))))....(((((((((.((((((((((((((......))).....)))))))(((..(((.(.((((((.....(((((.((..((.((((((((((((......(((........)))((((.((((.((((((((.(...(((((((...((((..(((.......((((.(((.((((((..(((((((((((((((((...((((((.......)))))).)).))))...((((.(..((((((..(((((((((.(.(((.(.(((((((.((.((.......(((((((((((.((........)).))...)))))).))).)).)).))))))).).))).).((.(((.....))).))..((((((((......(((((((........))))).))............((((((.(.((((.(.((((..(((.((((((((..((((((((...((.......)).))).))))).......(((((.....)))))((((((.........)))).))((((.((.......)).)))).(((......)))..)))))))))))..))))).)))).).).)))))))))))))(((.(((.((.(((((.((((....))))...))))))).))))))..)))))))))))))))..).)))))))).))))))))))))).)).).))))....(((.........)))))).))))..)))))))...)))))))))))))......(((..(((((.........))))).))).))))((((((((..((.............)))))))))))))))))))))).))..))...))))).....(((((((((((((.((((..(((((.((..(((.((((((.(((((((((((.(((...((((((......(((((...((((((....))))))))))))))))).....))).))))))))))).)))))).))).)).)))))(((((((.....(((.(((((((((((((.((.......))))))))))..)))))))))))))))((.((((((.....................)))))).)).......(((((......))))).)))))))))))....))))))...........((((((((((.....((.((..((((((((.((((((((((((.((.......))))))))))..))))))))...)))).)))).....)))).))))))))))))).)))..)))......((((..............))))(((((...(((....)))...))))).(((.(((((..((((......(((((((..(((.....))))))))))..))))..).)))).)))..(((((((((((((((((((..(((((.(((....))).)))))...)))))))))))))..........))))))...(((..(((((((....((((...((((((((...(((((((((((.(((((.....((((((...))))))..((..(((((((.(((((((.......((((.(.(((((((((((........))))))))))).).)))).))))))).)))))))...))...)))))))...(((((.(((((...((((.....))))....))))).(((....))))))))(((......)))))))))))).))).))))).))))....)))))))..)))..)))).)))))))))))))))))))....))).)))))(((.((.(((((.(((.((.(((....))))).))).)))))..)).)))...((((((((((.((.(..(((((..((((((.(((......(((..((((....))))..)))...)))))))))...)))))..).)).))))....)))).))))))...

Thermodynamic Ensemble Prediction

...((((((((((,(..((((.((.,.(((((((.(((((.((.((((((((((.(((.((((((,((({{...{{{|||{,{.....,{{{||,|||}}....)))....|||}}|,{((((....))))))))}.))))))..}))..)))))).))))..)).))))).)))...)))),.)).)).)).,))))))}..))))....{(((((.((.(((((({{{{((.((..,,.)}}}}}})))).{|||||||,{{{(((,(((......)))})).,},}|||,{{{..,|||,|||.,((((......)))).({((({((((((((((((,....(((........))){(({{({.,((((.((((((.((((((((((((((((({({{,(((....,.|||...||,..,|||{{..,{{{.{{{||||,..((((((.......)))))).)),))))},)))|(((((((((...(((.((((((((.(((.(.(((((((.((.{{.,.....,{((((((({{.,,.,......}|.||,.,||}}}}}})).)),)).))))))).).))).).}},{,,.....,,}{{{{.((((((((......,,(((((........))))).}}.........,,.((((((.{.((((.(.((((..(((.((((((((.{((((....}}}|}.......,..|||,,||||{{,....({(((,...,|||}}{,((((.........)))).}}|||{.{{.......)).}))).|||......,},..)))))))))))..))))).)))).}.)})}))),)),,,,,(((.(((.({{(((((.((((....))))...))))))).)))))){{({({({{,,|||{,{.(((((((((.....})))))))){{|{{{|.,..,,,},}}},.....)),))))),)))))))),)))}})))).)))...)))))))))}.(((,{(((((.((((((((((((((....(((((......((((((..........(((((.((.((((..{(((..{(((.((((((((((......((((((((((({(((({{{..(((..(((((((,,......,.,,,.|,}})))))..)))||||{(.,,...(((({...({{{{,....}})))}}))))}))))).,}}}))))))))))))))))))))))))),.))))....(((((((.....(((.(((((((((((((.{{.......)}))))))))..)))))))))))))))....)))).)).))))).............|{{{,||...,,,),}(((((......))))).))))))........................{((((((.(((((((((...{(..((((((((.((((((((((((.((.......))))))))))..))))))))...)))).}}.{.(((((((((((((((((..(....)..))))))....((((..............))))(((((...(((....)))...)))))...{((({({,...,)).)))|(((((((((((,(((({......|.{({((((((({.{(((((((((....))}}}).))))))))))))))|))))))))....))))))))}...((.(((.....))).))))))))))))}.,..,..({((((,((((.(((...,.,{{{{{{|||.,,||||,,,|}}},,...((((({...})))))..},..{((((((.(((((((.......((((.{.(((((((((((........))))))))))).).}))).))))))).))))))}}}})))}.)))))).,,.}.|,,.{((((..,((((.....))))....)))))}.}.....)))))))))))))))}.)))))...)))))))).))))))..))))))))).,.}}}}))))))))))).)))))),))))}})))}})))))},|.,,,|||,..(((((.(((.((.(((....))))).))).)))))}))))).)))}))))))|||{.,{,{||(((((..(((((||(((..|...{{{..((((....))))..}}}|..)))))))))...)))))..}.})}))}...,.)).)).)))))}..