Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001367846.1
Sequence Length
1098 nt
GC Content
0.5820
AGUGCCUGCAGCCGGUGCUGUCCACAGGGAGCUCCAGCCCUUCUCACACUCGACCCGCAGAAACCACCCACCUUCACCAUGUCUGACGAGGAAGUUGAACAGGUGGAGGAGCAGUACGAAGAAGAAGAGGAAGCCCAGGAGGAAGCUGCAGAAGUCCAUGAGGAAGUUCAUGAACCAGAGGAAGUUCAAGAAGACACCGCAGAGGAGGACGCGGAAGAGGAGAAACCGAGACCCAAACUCACUGCUCCUAAGAUCCCAGAAGGGGAGAAAGUGGACUUCGAUGACAUCCAGAAGAAGCGUCAGAACAAAGACCUAAUGGAGCUCCAGGCCCUCAUCGACAGCCACUUUGAAGCCCGGAAGAAGGAGGAGGAGGAGCUGGUCGCUCUCAAAGAGAGAAUCGAGAAGCGCCGUGCAGAGAGAGCGGAGCAGCAGAGGAUUCGUGCAGAGAAGGAGAGGGAGCGCCAGAACAGACUGGCGGAGGAAAAGGCCAGAAGGGAGGAGGAGGAUGCCAAGAGGAGGGCAGAGGACGACCUGAAGAAGAAGAAAGCUCUGUCUUCCAUGGGAGCCAACUACAGCAGCUACCUGGCCAAGGCUGACCAGAAGAGAGGCAAGAAGCAGACAGCCCGGGAAAUGAAGAAGAAGAUUCUGGCUGAGAGACGCAAGCCGCUCAACAUCGAUCACCUUGGUGAAGACAAACUGAGGGACAAGGCCAAGGAGCUCUGGGAGACCCUGCACCAGCUGGAGAUUGACAAGUUCGAGUUUGGGGAGAAGCUGAAACGCCAGAAAUAUGACAUCACCACGCUCAGGAGCCGCAUUGACCAGGCCCAGAAGCACAGCAAGAAGGCUGGGACCCCAGCCAAGGGCAAAGUCGGCGGGCGCUGGAAGUAGAGAGGCCAGAAAGGCCCCUCGAGGCAGAGACCCUCCGCCCUCUUGCACACCAGGGCCGCUCGUGGGACUCCACAUCCUCCAGCCCCCACAAUCCUGUCAGGGGCUCCCUGACAGUCCUGGGGGUGGAGAGGCCAUCCCGGGGCGUCCCCCGCGUCUGUGUCCUUGCUGCCUUCAUCCCCUGGGGCCUGUGAAUAAAGCUGCAGAACCCCC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-395.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -412.98
Frequency: 0.0000
Diversity: 247.24
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....(((((((...(((.((((.(((((.(((((..((((((((...(((((...((((...((.((..((((((((.(((.((((......)))).)))))))))))...................((....)).)).))...)))).....(((....)))..(((.(((((........))))).)))....((((..........))))....((.....))..((((....(((.((.(((((....(((.....(((...(((((((.(((((((((..((((.....((.(((........)))))..))))(((...)))..))))))).)))))))))....))))))...))))).))))).....)))).(((((...)))))..)))))..((.((((.(.....).)))).)).(((((....)).))).))))))).)..)))))(((((......)))))((.((....((((((..((...(((..((.(.(((...(((((((((((......((.....)).......))))))))))).))).).))..)).).....))..))))))....))..)).((((.(.((((((..((((((..(((((((.....((((.....))))((((..........))))............((.(((((((........)))))))))...((((..((.((...(((...))).)).))((((((.(((.......(((..((((.((......)).))))....))).......))).))).)))..((((((.(((.((...(((((.........((((((.((((((....))))))..((((......((.((((.(((......(((.((((.....)))).)))....))).).))).))))))))))))......)))))..))))))).)))).....(((((.((((((.....(((((((((...)))))))))...))))))))))).)))).)))))))(((.....)))))))))...)))))).)))))...)))))))))..)))......))))))).......
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,,..(((((((...(((.((((.(((((.(((((..((((((((...(((({.{{((,{...{{.,{..((((((((.(((.,(((......)))}.))))))))))).{{,,,.,...........{{....}}.},.))..,)))).....(((.{{.||...(((.(((((........))))).))}....||,|,..,,.,,.,))))....{{.....))..((((....(((.((.(((((....(((.....(((...(((((((.(((((((((..,((,...,.{(.(((........)))})..))),|||...))}..))))))).)))))))))....))))))...))))).))))).....)))).(((((...)))))..}))))..((.((((.{.....}.)))).)).(((({....)).))).))))))).)..)))))(((((......)))))((.((....((((((.,({{.,(((..((,(,(({...(((((((((((......((.....,,.,,....))))))))))).}||,|,||..}}.|,,.,,||.,||||||..,,}}..)).{{{(,(.((({{(..{({{{(,(({{((({.....,,,,.....))))|||||.,.,......))).)))......,.{(.(((((((........))))))))}...})}}..|||||||||((({.{(({,{.{,{(((((.(({,{.,,.,{{{,,(({(,((......}}.}}}}..,.)},...,,.,})).))).)))|.{({(((,(..,(({..,((((....{{...||,,,..((((((....))))))..||||...}}}||}|(((.((({..,,.(((.((((.....)))).))){{{{|,|{|.,,)}),)))))),)))...})}),)))}}))|})}).)))).,...(((({,((((((.....(((((((((...)))))))))...))))))))))).))},.)))))})|},}})})))))))))).,,)))})).)))))...)))))))))..))}......))))))).,,....
Back