Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001367847.1

Sequence Length

1040 nt

GC Content

0.5731

CUCUCUCUCUGAAUCUCUCUCUGCAGAAACCACCCACCUUCACCAUGUCUGACGAGGAAGUUGAACAGGUGGAGGAGCAGUACGAAGAAGAAGAGGAAGCCCAGGAGGAAGCUGCAGAAGUCCAUGAGGAAGUUCAUGAACCAGAGGAAGUUCAAGAAGAGGAGAAACCGAGACCCAAACUCACUGCUCCUAAGAUCCCAGAAGGGGAGAAAGUGGACUUCGAUGACAUCCAGAAGAAGCGUCAGAACAAAGACCUAAUGGAGCUCCAGGCCCUCAUCGACAGCCACUUUGAAGCCCGGAAGAAGGAGGAGGAGGAGCUGGUCGCUCUCAAAGAGAGAAUCGAGAAGCGCCGUGCAGAGAGAGCGGAGCAGCAGAGGAUUCGUGCAGAGAAGGAGAGGGAGCGCCAGAACAGACUGGCGGAGGAAAAGGCCAGAAGGGAGGAGGAGGAUGCCAAGAGGAGGGCAGAGGACGACCUGAAGAAGAAGAAAGCUCUGUCUUCCAUGGGAGCCAACUACAGCAGCUACCUGGCCAAGGCUGACCAGAAGAGAGGCAAGAAGCAGACAGCCCGGGAAAUGAAGAAGAAGAUUCUGGCUGAGAGACGCAAGCCGCUCAACAUCGAUCACCUUGGUGAAGACAAACUGAGGGACAAGGCCAAGGAGCUCUGGGAGACCCUGCACCAGCUGGAGAUUGACAAGUUCGAGUUUGGGGAGAAGCUGAAACGCCAGAAAUAUGACAUCACCACGCUCAGGAGCCGCAUUGACCAGGCCCAGAAGCACAGCAAGAAGGCUGGGACCCCAGCCAAGGGCAAAGUCGGCGGGCGCUGGAAGUAGAGAGGCCAGAAAGGCCCCUCGAGGCAGAGACCCUCCGCCCUCUUGCACACCAGGGCCGCUCGUGGGACUCCACAUCCUCCAGCCCCCACAAUCCUGUCAGGGGCUCCCUGACAGUCCUGGGGGUGGAGAGGCCAUCCCGGGGCGUCCCCCGCGUCUGUGUCCUUGCUGCCUUCAUCCCCUGGGGCCUGUGAAUAAAGCUGCAGAACCCCC

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-377.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -393.17

Frequency: 0.0000

Diversity: 195.69

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((((((((...(((((.(((((((...((.((..((((((((.(((.((((......)))).)))))))))))...................((....)).)).))...)))))))..(((....)))..(((.(((((........))))).)))..((.....))..((((....(((.((.(((((....(((.....(((...(((((((.(((((((((..((((.....((.(((........)))))..))))(((...)))..))))))).)))))))))....))))))...))))).))))).....)))).(((((...))))).........((.((((.(.....).)))).)).(((((....)).)))))))).)))))))))).(((((......)))))((.(((.(((((....((.(((((.(.((((((.....(((((((((((......((.....)).......)))))))))))..(((((((.....(((.((((.(((((((..((....))....(((.(((..(.......(((((.((((..(........)..))))))))).......)..))).)))........((.(((((((........)))))))))...)))).))))))))))((((.(((.((...((((((.(((.......(((..((((.((......)).))))....))).......))).))).)))...(((((((..((((...((((....((...)).....((((((....))))))..))))...)))))))(((.((((..((((((.((((.....)))).)))(((((.(((...))).).)))).)))...)))).)))))))))))).)))).....(((((.((((((.....(((((((((...)))))))))...))))))))))).)))..))))((((....)))))))))).).))))).)))))))..))))).((((.(((((........)))))..)))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((((((((...((((({(((((((...((.{(..((((((((.(((.,(((......)))}.)))))))))))...................((....)).)).))...))))))}..(((....))}..|||.(((((........))))).}},..{{.....}}..((((....(((.((.(((((....(((.....(((...(((((((.(((((((((..,((,...,.{(.(((........)))})..))),|||...))}..))))))).)))))))))....))))))...))))).)))))..,.,)))).(((((...)))))...,.....((.((((.{.....).)))).)).{|{{,,,.,)).)))))))).)))))))))),(((((......)))))|(.(((.(((((....((.(((((.(.((((((.....(((((((((((......((.....,,.,,....)))))))))))..(((((((.....(((.((((.(((((((..((....))....(((.(((..,...,...((((({((((..(........)..)))))))))...,...}..))).)))........{(.(((((((........))))))))}...)))),,)))))))))((((.{((,{{.,,((((((.(({,,.,,.,(((..((((.((......)).))))....))}...,}.,))).))).))),,|({((({(..{(((...((((....((...)).....((((((....))))))..))))...)))||}}(((.((((..{{,(((.((((.....)))).)))(((((.(((...))).)))))).}}}...)))).)))))))|}))).)))).....(((({,((((((.....(((((((((...)))))))))...))))))))))).)))..))))((((...,)))))))))).}.))))).)))))))..))))).((({.(((((........)))))..)))}.