Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001367849.1

Sequence Length

1019 nt

GC Content

0.5819

CUCUCUCUCUGAAUCUCUCUCUGCAGAAACCACCCACCUUCACCAUGUCUGACGAGGAAGUUGAACAGGUGGAGGAGGAAGCCCAGGAGGAAGCUGCAGAAGUCCAUGAGGAAGACACCGCAGAGGAGGACGCGGAAGAGGAGAAACCGAGACCCAAACUCACUGCUCCUAAGAUCCCAGAAGGGGAGAAAGUGGACUUCGAUGACAUCCAGAAGAAGCGUCAGAACAAAGACCUAAUGGAGCUCCAGGCCCUCAUCGACAGCCACUUUGAAGCCCGGAAGAAGGAGGAGGAGGAGCUGGUCGCUCUCAAAGAGAGAAUCGAGAAGCGCCGUGCAGAGAGAGCGGAGCAGCAGAGGAUUCGUGCAGAGAAGGAGAGGGAGCGCCAGAACAGACUGGCGGAGGAAAAGGCCAGAAGGGAGGAGGAGGAUGCCAAGAGGAGGGCAGAGGACGACCUGAAGAAGAAGAAAGCUCUGUCUUCCAUGGGAGCCAACUACAGCAGCUACCUGGCCAAGGCUGACCAGAAGAGAGGCAAGAAGCAGACAGCCCGGGAAAUGAAGAAGAAGAUUCUGGCUGAGAGACGCAAGCCGCUCAACAUCGAUCACCUUGGUGAAGACAAACUGAGGGACAAGGCCAAGGAGCUCUGGGAGACCCUGCACCAGCUGGAGAUUGACAAGUUCGAGUUUGGGGAGAAGCUGAAACGCCAGAAAUAUGACAUCACCACGCUCAGGAGCCGCAUUGACCAGGCCCAGAAGCACAGCAAGAAGGCUGGGACCCCAGCCAAGGGCAAAGUCGGCGGGCGCUGGAAGUAGAGAGGCCAGAAAGGCCCCUCGAGGCAGAGACCCUCCGCCCUCUUGCACACCAGGGCCGCUCGUGGGACUCCACAUCCUCCAGCCCCCACAAUCCUGUCAGGGGCUCCCUGACAGUCCUGGGGGUGGAGAGGCCAUCCCGGGGCGUCCCCCGCGUCUGUGUCCUUGCUGCCUUCAUCCCCUGGGGCCUGUGAAUAAAGCUGCAGAACCCCC

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-377.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -393.59

Frequency: 0.0000

Diversity: 191.66

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((((((((.......(((((((((((.((..((.((((((((.(((.((((......)))).))))))))))).))....((....))..(((((.....(((.((.((......)).))..)))((.(.(((...........))).).))....(((.((.(((((....(((.....(((...(((((((.(((((((((..((((.....((.(((........)))))..))))(((...)))..))))))).)))))))))....))))))...))))).)))))..(((..((((((((...)))))...)))..))).((((.(.....).)))).)))))...)).))).)))))))).)))))))))).(((((......)))))((.(((.(((((....((.(((((.(.((((((.....(((((((((((......((.....)).......)))))))))))..(((((((.....(((.((((.(((((((..((....))....(((.(((..(.......(((((.((((..(........)..))))))))).......)..))).)))........((.(((((((........)))))))))...)))).))))))))))((((.(((.((...((((((.(((.......(((..((((.((......)).))))....))).......))).))).)))...(((((((..((((...((((....((...)).....((((((....))))))..))))...)))))))(((.((((..((((((.((((.....)))).)))(((((.(((...))).).)))).)))...)))).)))))))))))).)))).....(((((.((((((.....(((((((((...)))))))))...))))))))))).)))..))))((((....)))))))))).).))))).)))))))..))))).((((.(((((........)))))..)))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((((((((....{{.(((((((((((.((..((.((((((((.(((.,(((......)))}.))))))))))).))....({....))..{((((.,...(((.,,.||,.....||{|,..,,.,,.,}|||....,,.....)),.{,||....(((.((.(((((....(((.....(((...(((((((.(((((((((..,((,...,.{(.(((........)))})..))),|||...))}..))))))).)))))))))....))))))...))))).)))))..{{{|}||((((((...}}}}}...}}}..,||.{{{{.|.....}.)))).)))))...)).))).)))))))).)))))))))),(((((......)))))|(.(((.(((((....((.(((((.(.((((((.....(((((((((((......((.....,,.,,....)))))))))))..(((((((.....(((.((((.(((((((..((....))....(((.(((..,...,...((((({((((..(........)..)))))))))...,...}..))).)))........{(.(((((((........))))))))}...)))),,)))))))))((((.{((,{{.,,((((((.(({,,.,,.,(((..((((.((......)).))))....))}...,}.,))).))).))),,|({((({(..{(((...((((....((...)).....((((((....))))))..))))...)))|}}}(((.((((..{{,(((.((((.....)))).)))(((((.(((...))).)))))).}}}...)))).)))))))|}))).)))).....(((({,((((((.....(((((((((...)))))))))...))))))))))).)))..))))((((...,)))))))))).,.))))).)))))))..))))).((({.(((((........)))))..)))}.