Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001369496.1

Sequence Length

1796 nt

GC Content

0.6581

GAGAUACCCUGAAACCUCCCCCCUCUGACCCCGCAGCCAGGCCCCAGGCUGGCCGGGAGUGGCCCCUCACACUGGUUCUCCCCACUUUCUCUGCCUGUGGCAUCGAAGGCCCCGGGCACCAUGGCCCAGGCCCUGGGGGAGGACCUGGUGCAGCCUCCCGAGCUGCAGGAUGACUCCAGCUCCUUGGGGUCCGACUCAGAGCUCAGCGGGCCUGGCCCAUAUCGCCAGGCCGACCGCUAUGGAUUCAUUGGGGGCAGCUCAGCAGAGCCAGGGCCGGGCCACCCACCUGCAGACCUCAUCCGCCAACGGGAGAUGAAGUGGGUGGAGAUGACCUCGCACUGGGAGAAAACCAUGUCCCGGCGGUACAAGAAGGUAAAGAUGCAGUGCCGGAAAGGCAUCCCGUCUGCCCUGCGCGCCCGAUGCUGGCCCCUGUUGUGUGGGGCCCAUGUGUGCCAGAAGAACAGCCCUGGCACCUAUCAGGAGCUGGCAGAGGCCCCUGGAGACCCACAGUGGAUGGAGACCAUUGGCAGGGACCUGCACCGUCAAUUCCCUCUGCACGAGAUGUUUGUGUCGCCUCAGGGCCACGGGCAGCAGGGGCUCCUGCAGGUGCUCAAGGCCUACACCCUGUAUCGACCGGAGCAGGGCUACUGCCAGGCCCAGGGGCCCGUGGCUGCUGUGCUGCUCAUGCACCUGCCCCCAGAGGAGGCCUUCUGGUGCCUGGUGCAGAUCUGUGAGGUCUACCUCCCUGGGUACUACGGGCCCCACAUGGAGGCUGUGCGGCUGGACGCCGAGGUGUUCAUGGCCCUGCUGCGGCGGCUGCUUCCGCACGUGCACAAGCACCUGCAGCAGGUGGGCGUCGGACCCCUGCUGUACCUGCCCGAGUGGUUCCUGUGCCUCUUCGCCCGCUCCCUGCCCUUCCCCACAGUGCUGCGUGUCUGGGAUGCCUUCCUCAGUGAGGGUGCCAGAGUACUGUUCCGUGUGGGGCUGACACUGGUGCGCCUGGCGCUGGGCACUGCAGAGCAGCGAGGGGCCUGCCCUGGCCUCCUGGAGACACUGGGAGCCCUUCGAGCCAUCCCCCCCGCGCAGCUGCAGGAGGAGGCCUUCAUGUCACAGGUGCACAGCGUGGUGCUGUCAGAGCGGGACCUGCAGCGGGAGAUCAAGGCCCAGCUGGCCCAGCUGCCCGAUUCCGCGCCGGGACCCCCGCCCCGGCCACAGGUCCGCCUCGCCGGGGCCCAAGCCAUCUUUGAGGCCCAGCAGCUGGCAGGAGUGCGACGAGGCGCCAAGCCUGAGGUGCCUCGGAUUGUGGUGCAGCCCCCGGAGGAGCCCAGACCACCGCGGCGGAAACCCCAGACCCGCGGCAAGACUUUCCAUGGGCUCCUGACUCGGGCCCGGGGCCCCCCCAUCGAGGGGCCCCCCAGGCCCCAACGAGGCUCCACCUCCUUCCUGGACACCCGCUUCUGAGAGGACCAUGGACUUAGUGUCCCCCAGUCUCAAUUGCCUGAUGGCUGAUGCCGGCCCGGCAAAUAGGCACCGCACUUUACUCUUGGGACUCGGGGACUUGGCUUCCUUCCUGGCAAGGACCAGGCAGUGGGGAAGGAGGAGGUCCUCCGUGGUACAUACUGGGUCAGGCACUAGCAUGGAGGAGGGUCACAGAGUGGGGCACGUGAGGACCCAUGGAACCGUCCUGGUGCCCAGGCCCUCACAAGUACCAAAGCCAGCACCAAAGGAGUCAGGGAAGGGGUUGGCUGAGUCAAGGGACCCCAGAGGGCACCAGGAAUAAAAUCUUCUUGAACAGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-859.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -888.98

Frequency: 0.0000

Diversity: 301.47

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

......((((((..((..(((((((((((.(((((((((((((((..(..((((((.((((((((.......((((((((((((((((.(((.((((((((.....((((..((((.....((((((.((((((((((((((..(((...)))))))))(((((((..(((((.((((((((..((((......))))))))).((((((((((((.......)))))))...)))))..))).)))))....))))))).......))))))))))))))....))))..).))).....))).)))))))).))))))(((((((.....))).))))))))))..))))(((.(((((((((((.(..(((..(((((..(((((.....)))))..)))))(((.((.(((((...(((.((((((((((((.((.(((((.((.(((.((.(((..(((((((((......))))).))))(((((((....(((....)))((((((.......))))))((((....))))...........)))))))........))).)).)))..))))))).)).))))))))))))...)))))))).)).)))....))))))))))).)))).))))))))))).)).))))).))))))..))))))).((((((((..((((((.((..(((((((....))))))).))..))))))....(((((((........(((((((((((.((((....(((((.(((((((((((.((..((((.(.....).)))))).))))).))))))...(((.(((((((....(((..(((((((((.((........)))))))))))..))).((((.(((......)))..))))((((((((((.(((((((((((.((((((((((...((((((.((..(((((((((((((((((.((.(.(((((....))))).))).))))))).)))..)))))))..((((...))))((((((((...(((.((.(((...))).).).))).)))))))))).))))))...))))))))....((((((((((....(((((....)).))).((((((.((.(((((((((((((((..((((..((((..(((..(((((...)))))))).))))))))((((((........))))))..)))))))((((((((((((.(...(((((.((((((((((..((...(((..(.((((......)))))..))))).)).))))))))..)))))...).))))))(((((((((.....((((((.(...........)))))))............))))))))).....(((((.((((((((........))))))))...)))))...))))))......(((.....)))....))).))))).)).))))))........((((((.(((((((((((((....(((((....))))).)))))..((((...)).))......)))))))).))))))..))))))))))((((......)))))).)))))))))).).)))(((((((((.((....(((...)))....)).)))))))))........)))))))))))))).))).))))).....))))))))))))))).)))))))........)).))))))....)).)))))))..))))..)).....)).)))).(((....)))...((((((.......))))))......

Thermodynamic Ensemble Prediction

......((((((..((.,(((((((((((.(((((((((((((((.,,..((((((.((((((((.......((((((((((((((((.(((.((((((((...,,((((..((((.....((((((.((((((((((((((..(((...)))))))))(((((((..(((((.((((((((..((((......))))))))}.((((((((((((.......)))))))}..})))).,))).)))))....))))))).......))))))))))))))....))))..).))).....)))},))))))).))))))(((((((.....))).))))))))))..)))){({.(((((((((((.{..{((,.(((((..(((((.....)))))..)))))(((.((.(((((...(((.((((((((((((.((.(((((.{{.((({(({.....{{{{{||||,,,...}|||}.}))){{{((((|{||((,.....,.|||{||,,{{...))}|||((,((,...|,,.,,}})}..,,)))))||{{{{....,))}))}})},.),))))).)).))))))))))))...)))))))).)).))).,,,,,}}))))))).)))).))})))))))).)).))))).))))))..))))))).((((((((,.((((((.((..(((((((....))))))).))..)))))),,..(((((((........(((((((((((.((((....(((((.(((((((((((.((..((((.{|,.,}).}))))}.}}}})||)))}}...{{{.({{((((....(((..(((((((((.((.,....,.)))))))))))..))).{(((.(((,,,...|||,|}}}|((((((((((.(((((((((((.{{((((((((...((((((.({..(((((((((((((((((.((.(.(((((....))))).})).))))))).)))..)))))))..((((...))))((((((((...(((.{{.(((...))).}.).))),)))))))))).))))))...)))))))).||.((((((((((....,{{,,...,|},},,.((((((.((.(((((((((((((((..((((({.,((..(({.,(((((...)))))))).))))))))((((((........))))))..))))))}(((((((((((({,...(((((.(((((((({{..(,.,.(((..(.((((......)))))..))),).}),))))))))..)))))...},))))))(((((((((.....((((((.((.....},...,))))))............))))))))).....(((((.((((((((......,.))))))))...)))))...)))))),.,,..{{{.....)))...,)))}})))).)).)))))).,,.....((((((.(((((((({((((.,.,(((,,..}})),,}.))))}..{{{{...}}.},......)))))))).))))))..))))))))))((((......))))},.)))))))))).).)))(((((((((.((....(((...)))....)).)))))))))......,.))))))))))))}).))}.))))),..,,))))))))))))))).))))))).,......}),})))))....)).)))))))..))))..)).....)),}))).(((....)))...((((((.......))))))......