Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001369518.1
Sequence Length
4852 nt
GC Content
0.4996
GUCGCAGCCGAGGGAACAAGCCCCAACCGGAUCCUGGACAGGCACCCCGGCUUGGCGCUGUCUCUCCCCCUCGGCUCGGAGAGGCCCUUCGGCCUGAGGGAGCCUCGCCGCCCGUCCCCGGCACACGCGCAGCCCCGGCCUCUCGGCCUCUGCCGGAGAAACAGCAGGAUGGCCCAAUGGAAUCAGCUACAGCAGCUUGACACACGGUACCUGGAGCAGCUCCAUCAGCUCUACAGUGACAGCUUCCCAAUGGAGCUGCGGCAGUUUCUGGCCCCUUGGAUUGAGAGUCAAGAUUGGGCAUAUGCGGCCAGCAAAGAAUCACAUGCCACUUUGGUGUUUCAUAAUCUCCUGGGAGAGAUUGACCAGCAGUAUAGCCGCUUCCUGCAAGAGUCGAAUGUUCUCUAUCAGCACAAUCUACGAAGAAUCAAGCAGUUUCUUCAGAGCAGGUAUCUUGAGAAGCCAAUGGAGAUUGCCCGGAUUGUGGCCCGGUGCCUGUGGGAAGAAUCACGCCUUCUACAGACUGCAGCCACUGCGGCCCAGCAAGGGGGCCAGGCCAACCACCCCACAGCAGCCGUGGUGACGGAGAAGCAGCAGAUGCUGGAGCAGCACCUUCAGGAUGUCCGGAAGAGAGUGCAGGAUCUAGAACAGAAAAUGAAAGUGGUAGAGAAUCUCCAGGAUGACUUUGAUUUCAACUAUAAAACCCUCAAGAGUCAAGGAGACAUGCAAGAUCUGAAUGGAAACAACCAGUCAGUGACCAGGCAGAAGAUGCAGCAGCUGGAACAGAUGCUCACUGCGCUGGACCAGAUGCGGAGAAGCAUCGUGAGUGAGCUGGCGGGGCUUUUGUCAGCGAUGGAGUACGUGCAGAAAACUCUCACGGACGAGGAGCUGGCUGACUGGAAGAGGCGGCAACAGAUUGCCUGCAUUGGAGGCCCGCCCAACAUCUGCCUAGAUCGGCUAGAAAACUGGAUAACGUCAUUAGCAGAAUCUCAACUUCAGACCCGUCAACAAAUUAAGAAACUGGAGGAGUUGCAGCAAAAAGUUUCCUACAAAGGGGACCCCAUUGUACAGCACCGGCCGAUGCUGGAGGAGAGAAUCGUGGAGCUGUUUAGAAACUUAAUGAAAAGUGCCUUUGUGGUGGAGCGGCAGCCCUGCAUGCCCAUGCAUCCUGACCGGCCCCUCGUCAUCAAGACCGGCGUCCAGUUCACUACUAAAGUCAGGUUGCUGGUCAAAUUCCCUGAGUUGAAUUAUCAGCUUAAAAUUAAAGUGUGCAUUGACAAAGACUCUGGGGACGUUGCAGCUCUCAGAGGAUCCCGGAAAUUUAACAUUCUGGGCACAAACACAAAAGUGAUGAACAUGGAAGAAUCCAACAACGGCAGCCUCUCUGCAGAAUUCAAACACUUGACCCUGAGGGAGCAGAGAUGUGGGAAUGGGGGCCGAGCCAAUUGUGAUGCUUCCCUGAUUGUGACUGAGGAGCUGCACCUGAUCACCUUUGAGACCGAGGUGUAUCACCAAGGCCUCAAGAUUGACCUAGAGACCCACUCCUUGCCAGUUGUGGUGAUCUCCAACAUCUGUCAGAUGCCAAAUGCCUGGGCGUCCAUCCUGUGGUACAACAUGCUGACCAACAAUCCCAAGAAUGUAAACUUUUUUACCAAGCCCCCAAUUGGAACCUGGGAUCAAGUGGCCGAGGUCCUGAGCUGGCAGUUCUCCUCCACCACCAAGCGAGGACUGAGCAUCGAGCAGCUGACUACACUGGCAGAGAAACUCUUGGGACCUGGUGUGAAUUAUUCAGGGUGUCAGAUCACAUGGGCUAAAUUUUGCAAAGAAAACAUGGCUGGCAAGGGCUUCUCCUUCUGGGUCUGGCUGGACAAUAUCAUUGACCUUGUGAAAAAGUACAUCCUGGCCCUUUGGAACGAAGGGUACAUCAUGGGCUUUAUCAGUAAGGAGCGGGAGCGGGCCAUCUUGAGCACUAAGCCUCCAGGCACCUUCCUGCUAAGAUUCAGUGAAAGCAGCAAAGAAGGAGGCGUCACUUUCACUUGGGUGGAGAAGGACAUCAGCGGUAAGACCCAGAUCCAGUCCGUGGAACCAUACACAAAGCAGCAGCUGAACAACAUGUCAUUUGCUGAAAUCAUCAUGGGCUAUAAGAUCAUGGAUGCUACCAAUAUCCUGGUGUCUCCACUGGUCUAUCUCUAUCCUGACAUUCCCAAGGAGGAGGCAUUCGGAAAGUAUUGUCGGCCAGAGAGCCAGGAGCAUCCUGAAGCUGACCCAGGUAGCGCUGCCCCAUACCUGAAGACCAAGUUUAUCUGUGUGACACCAUUCAUUGAUGCAGUUUGGAAAUAAUGGUGAAGGUGCUGAACCCUCAGCAGGAGGGCAGUUUGAGUCCCUCACCUUUGACAUGGAGUUGACCUCGGAGUGCGCUACCUCCCCCAUGUGAGGAGCUGAGAACGGAAGCUGCAGAAAGAUACGACUGAGGCGCCUACCUGCAUUCUGCCACCCCUCACACAGCCAAACCCCAGAUCAUCUGAAACUACUAACUUUGUGGUUCCAGAUUUUUUUUAAUCUCCUACUUCUGCUAUCUUUGAGCAAUCUGGGCACUUUUAAAAAUAGAGAAAUGAGUGAAUGUGGGUGAUCUGCUUUUAUCUAAAUGCAAAUAAGGAUGUGUUCUCUGAGACCCAUGAUCAGGGGAUGUGGCGGGGGGUGGCUAGAGGGAGAAAAAGGAAAUGUCUUGUGUUGUUUUGUUCCCCUGCCCUCCUUUCUCAGCAGCUUUUUGUUAUUGUUGUUGUUGUUCUUAGACAAGUGCCUCCUGGUGCCUGCGGCAUCCUUCUGCCUGUUUCUGUAAGCAAAUGCCACAGGCCACCUAUAGCUACAUACUCCUGGCAUUGCACUUUUUAACCUUGCUGACAUCCAAAUAGAAGAUAGGACUAUCUAAGCCCUAGGUUUCUUUUUAAAUUAAGAAAUAAUAACAAUUAAAGGGCAAAAAACACUGUAUCAGCAUAGCCUUUCUGUAUUUAAGAAACUUAAGCAGCCGGGCAUGGUGGCUCACGCCUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGCCGAGGCGGAUCAUAAGGUCAGGAGAUCAAGACCAUCCUGGCUAACACGGUGAAACCCCGUCUCUACUAAAAGUACAAAAAAUUAGCUGGGUGUGGUGGUGGGCGCCUGUAGUCCCAGCUACUCGGGAGGCUGAGGCAGGAGAAUCGCUUGAACCUGAGAGGCGGAGGUUGCAGUGAGCCAAAAUUGCACCACUGCACACUGCACUCCAUCCUGGGCGACAGUCUGAGACUCUGUCUCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACUUCAGUUAACAGCCUCCUUGGUGCUUUAAGCAUUCAGCUUCCUUCAGGCUGGUAAUUUAUAUAAUCCCUGAAACGGGCUUCAGGUCAAACCCUUAAGACAUCUGAAGCUGCAACCUGGCCUUUGGUGUUGAAAUAGGAAGGUUUAAGGAGAAUCUAAGCAUUUUAGACUUUUUUUUAUAAAUAGACUUAUUUUCCUUUGUAAUGUAUUGGCCUUUUAGUGAGUAAGGCUGGGCAGAGGGUGCUUACAACCUUGACUCCCUUUCUCCCUGGACUUGAUCUGCUGUUUCAGAGGCUAGGUUGUUUCUGUGGGUGCCUUAUCAGGGCUGGGAUACUUCUGAUUCUGGCUUCCUUCCUGCCCCACCCUCCCGACCCCAGUCCCCCUGAUCCUGCUAGAGGCAUGUCUCCUUGCGUGUCUAAAGGUCCCUCAUCCUGUUUGUUUUAGGAAUCCUGGUCUCAGGACCUCAUGGAAGAAGAGGGGGAGAGAGUUACAGGUUGGACAUGAUGCACACUAUGGGGCCCCAGCGACGUGUCUGGUUGAGCUCAGGGAAUAUGGUUCUUAGCCAGUUUCUUGGUGAUAUCCAGUGGCACUUGUAAUGGCGUCUUCAUUCAGUUCAUGCAGGGCAAAGGCUUACUGAUAAACUUGAGUCUGCCCUCGUAUGAGGGUGUAUACCUGGCCUCCCUCUGAGGCUGGUGACUCCUCCCUGCUGGGGCCCCACAGGUGAGGCAGAACAGCUAGAGGGCCUCCCCGCCUGCCCGCCUUGGCUGGCUAGCUCGCCUCUCCUGUGCGUAUGGGAACACCUAGCACGUGCUGGAUGGGCUGCCUCUGACUCAGAGGCAUGGCCGGAUUUGGCAACUCAAAACCACCUUGCCUCAGCUGAUCAGAGUUUCUGUGGAAUUCUGUUUGUUAAAUCAAAUUAGCUGGUCUCUGAAUUAAGGGGGAGACGACCUUCUCUAAGAUGAACAGGGUUCGCCCCAGUCCUCCUGCCUGGAGACAGUUGAUGUGUCAUGCAGAGCUCUUACUUCUCCAGCAACACUCUUCAGUACAUAAUAAGCUUAACUGAUAAACAGAAUAUUUAGAAAGGUGAGACUUGGGCUUACCAUUGGGUUUAAAUCAUAGGGACCUAGGGCGAGGGUUCAGGGCUUCUCUGGAGCAGAUAUUGUCAAGUUCAUGGCCUUAGGUAGCAUGUAUCUGGUCUUAACUCUGAUUGUAGCAAAAGUUCUGAGAGGAGCUGAGCCCUGUUGUGGCCCAUUAAAGAACAGGGUCCUCAGGCCCUGCCCGCUUCCUGUCCACUGCCCCCUCCCCAUCCCCAGCCCAGCCGAGGGAAUCCCGUGGGUUGCUUACCUACCUAUAAGGUGGUUUAUAAGCUGCUGUCCUGGCCACUGCAUUCAAAUUCCAAUGUGUACUUCAUAGUGUAAAAAUUUAUAUUAUUGUGAGGUUUUUUGUCUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUGGUAUAUUGCUGUAUCUACUUUAACUUCCAGAAAUAAACGUUAUAUAGGAACCGUC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1653.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1740.20
Frequency: 0.0000
Diversity: 1465.33
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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