Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001369595.3

Sequence Length

634 nt

GC Content

0.5962

AGAGACUCCCACCCCAGCUCAGAGGGAGCAGGGGCCCAGCCAGGGACGGACCCUCAUUCCUCCCAGGGACCCCAGACCUCUGUCUCUCUCGGCAGGCCUUGGCUCCUUGAACUUUUGGCCGCCAUGUGCUUCCCGAAGGUCCUCUCUGAUGACAUGAAGAAGCUGAAGGCCCGAAUGGUGAUGUCGAGCCUGGCAGAGCUGGAGGACGACUUCAAAGAGGGCUACCUGGAGACAGUGGCGGCUUAUUAUGAGGAGCAGCACCCAGAGCUCACUCCUCUACUUGAAAAAGAAAGAGAUGGAUUACGGUGCCGAGGCAACAGAUCCCCUGUCCCGGAUGUUGAGGAUCCCGCAACCGAGGAGCCUGGGGAGAGCUUUUGUGACAAGUCCUACGGAGCCCCACGGGGGGACAAGGAGGAGCUGACACCCCAGAAGUGCUCUGAACCCCAAUCCUCAAAAUGAAGAUACUGACACCACCUUUGCCCUCCCCGUCACCGCGCACCCACCCUGACCCCUCCCUCAGCUGUCCUGUGCCCCGCCCUCUCCCGCACACUCAGUCCCCCUGCCUGGCGUUCCUGCCGCAGCUCUGACCUGGUGCUGUCGCCCUGGCAUCUUAAUAAAACCUGCUUAUACUUCC

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-211.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -223.24

Frequency: 0.0000

Diversity: 158.07

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

...........((((.((((.....)))).))))....(((((((.((...((((((......((((((.((.((...((((((......)))))).)).)).)))))).......(((((((((.((.((((.(..((((((((.(((...........((((..((((.(((((....)).))).)))).....))))...........))).))))))))..).)))).)))))))))))....)))))).((((((((((((((((....((((.(((....)))..))))..(((((..(..((.(((((......(((((..((((((.(((.(......).))).))).)))....)))))..))))).))..).)))))...(((((.((((((((((((..(((((.((............((((.(((.....................)))))))............)))))))........(((((......((((........))))......)))))...((........)).......)))))))))..))).)))))....).)))))))....)))))))))))))))))...........................

Thermodynamic Ensemble Prediction

.,.(({...,,,,((((.((((((,..((((((((((((.(((((..((({(((((..,.(((..(((((....({..(((((..,.((((((|.{((..,(((((((,.......(((((((((.{{,((((.(..((((((((.(((.,.........((((..((((.((({{....,}.))).)))).....)))).........}.))).))))))))..).)))).)}))))))))).....,))))))){((.......))}...{(((((.(((........)))))).)))....))))))))))..)))))}}....)))))))).}.))))).}||,{.....|{|{|(,.{(((((({((,,,,(((.,...{{,,.|||},{,{,.,{{{({{.{.,({{{{,{{},...,..|,|,.,.}})))}.....,.{((.(({...})).)))..,,....,...,,.)}})}))},)},...(((((...,..((((........))))..,...)))))...}}.}))}}},}),..,,,.)))}))))).)))).))))))))..}..)))))).))))}).,)}}.,...|||{..,,.........,}}}.........