Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001369672.1
Sequence Length
5449 nt
GC Content
0.3738
GCACUGAGCCUAAGCAGCCGGUGAUGGCGGCAGCGGCUGUGGUGGCUGCGGCGGGUCCGGGCCCAUGAGGCGACGAAGGAGGCGGGACGGCUUUUACCCAGCCCCGGACUUCCGAGACAGGGAAGCUGAGGACAUGGCAGGAGUGUUUGACAUAGACCUGGACCAGCCAGAGGACGCGGGCUCUGAGGAUGAGCUGGAGGAGGGGGAAGCGCUCAGCUGUUAGAAGUGACAGCUGAAAACUUCUGUCGGGAGUAGCACUGCCGCUGCUGUUACAGCCACCAGGAGUUUUAUUUCGGGAGCAAGGGGGCUCUGCUGCAUCUUCCAAUCUUCCAGGGGUCAGUUAAAUGAAAGCAUGGACCAUGGGGGAGUUGGACCAUAUGAACUUGGCAUGGAACAUUGUGAGAAAUUUGAAAUCUCAGAAACUAGUGUGAACAGAGGGCCAGAAAAAAUCAGACCAGAAUGUUUUGAGCUACUUCGGGUACUUGGUAAAGGGGGCUAUGGAAAGGUUUUUCAAGUACGAAAAGUAACAGGAGCAAAUACUGGGAAAAUAUUUGCCAUGAAGGUGCUUAAAAAGGCAAUGAUAGUAAGAAAUGCUAAAGAUACAGCUCAUACAAAAGCAGAACGGAAUAUUCUGGAGGAAGUAAAGCAUCCCUUCAUCGUGGAUUUAAUUUAUGCCUUUCAGACUGGUGGAAAACUCUACCUCAUCCUUGAGUAUCUCAGUGGAGGAGAACUAUUUAUGCAGUUAGAAAGAGAGGGAAUAUUUAUGGAAGACACUGCCUGCUUUUACUUGGCAGAAAUCUCCAUGGCUUUGGGGCAUUUACAUCAAAAGGGGAUCAUCUACAGAGACCUGAAGCCGGAGAAUAUCAUGCUUAAUCACCAAGGUCAUGUGAAACUAACAGACUUUGGACUAUGCAAAGAAUCUAUUCAUGAUGGAACAGUCACACACACAUUUUGUGGAACAAUAGAAUACAUGGCCCCUGAAAUCUUGAUGAGAAGUGGCCACAAUCGUGCUGUGGAUUGGUGGAGUUUGGGAGCAUUAAUGUAUGACAUGCUGACUGGAGCACCCCCAUUCACUGGGGAGAAUAGAAAGAAAACAAUUGACAAAAUCCUCAAAUGUAAACUCAAUUUGCCUCCCUACCUCACACAAGAAGCCAGAGAUCUGCUUAAAAAGCUGCUGAAAAGAAAUGCUGCUUCUCGUCUGGGAGCUGGUCCUGGGGACGCUGGAGAAGUUCAAGCUCAUCCAUUCUUUAGACACAUUAACUGGGAAGAACUUCUGGCUCGAAAGGUGGAGCCCCCCUUUAAACCUCUGUUGGGUUUUACAUAUGUGGCUCCAUCUGUACUUGAAAGUGUGAAAGAAAAGUUUUCCUUUGAACCAAAAAUCCGAUCACCUCGAAGAUUUAUUGGCAGCCCACGAACACCUGUCAGCCCAGUCAAAUUUUCUCCUGGGGAUUUCUGGGGAAGAGGUGCUUCGGCCAGCACAGCAAAUCCUCAGACACCUGUGGAAUACCCAAUGGAAACAAGUGGCAUAGAGCAGAUGGAUGUGACAAUGAGUGGGGAAGCAUCGGCACCACUUCCAAUACGACAGCCGAACUCUGGGCCAUACAAAAAACAAGCUUUUCCCAUGAUCUCCAAACGGCCAGAGCACCUGCGUAUGAAUCUAUGACAGAGCAAUGCUUUUAAUGAAUUUAAGGCAAAAAAGGUGGAGAGGGAGAUGUGUGAGCAUCCUGCAAGGUGAAACGACUCAAAAUGACAGUUUCAGAGAGUCAAUGUCAUUACAUAGAACACUUCAGACACAGGAAAAAUAAACGUGGAUUUUAAAAAAUCAAUCAAUGGUGCAAAAAAAAACUUAAAGCAAAAUAGUAUUGCUGAACUCUUAGGCACAUCAAUUAAUUGAUUCCUCGCGACAUCUUCUCAACCUUAUCAAGGAUUUUCAUGUUGAUGACUCGAAACUGACAGUAUUAAGGGUAGGAUGUUGCUUCUGAAUCACUGUUGAGUUCUGAUUGUGUUGAAGAAGGGUUAUCCUUUCAUUAGGCAAAGUACAAAAUUGCCUAUAAUACUUGCAACUAAGGACAAAUUAGCAUGCAAGCUUGGUCAAACUUUUUCCAGCAAAAUGGAAGCAAAGACAAAAGAAACUUACCAAUUGAUGUUUUACGUGCAAACAACCUGAAUCUUUUUUUUAUAUAAAUAUAUAUUUUUCAAAUAGAUUUUUGAUUCAGCUCAUUAUGAAAAACAUCCCAAACUUUAAAAUGCGAAAUUAUUGGUUGGUGUGAAGAAAGCCAGACAACUUCUGUUUCUUCUCUUGGUGAAAUAAUAAAAUGCAAAUGAAUCAUUGUUAACCACAGCUGUGGCUCGUUUGAGGGAUUGGGGUGGACCUGGGGUUUAUUUUCAGUAACCCAGCUGCAAUACCUGUCUGUAAUAUGAGAAAAAAAAAAUGAAUCUAUUUAAUCAUUUCUACUUGCAGUACUGCUAUGUGCUAAGCUUAACUGGAAGCCUUGGAAUGGGCAUAAGUUGUAUGUCCUACAUUUCAUCAUUGUCCCGGGCCUGCAUUGCACUGGAAAAAAAAAUCGCCACCUGUUCUUACACCAGUAUUUGGUUCAAGACACCAAAUGUCUUCAGCCCAUGGCUGAAGAACAACAGAAGAGAGUCAGGAUAAAAAAUACAUACUGUGGUCGGCAAGGUGAGGGAGAUAGGGAUAUCCAGGGGAAGAGGGUGUUGCUGUGGCCCACUCUCUGUCUAAUCUCUUUACAGCAAAUUGGUAAGAUUUUCAGUUUUACUUCUUUCUACUGUUUCUGCUGUCUACCUUCCUUAUAUUUUUUUCCUCAACAGUUUUAAAAAGAAAAAAAGGUCUAUUUUUUUUUCUCCUAUACUUGGGCUACAUUUUUUGAUUGUAAAAAUAUUUGAUGGCCUUUUGAUGAAUGUCUUCCACAGUAAAGAAAACUUAGUGGCUUAAUUUAGGAAACAUGUUAACAGGACACUAUGUUUUUGAAAUUGUAACAAAAUCUACAUAAAUGAUUUACAGGUUAAAAGAAUAAAAAUAAAGGUAACUUUACCUUUCUUAAAUAUUUCCUGCCUUAAAGAGAGCAUUUCCAUGACUUUAGCUGGUGAAAGGGUUUAAUAUCUGCAGAGCUUUAUAAAAAUAUAUUUCAGUGCAUACUGGUAUAAUAGAUGAUCAUGCAGUUGCAGUUGAGUUGUAUCACCUUUUUUGUUUGUCUUUUAUAAUGUCUUCAGUCUGAGUGUGCAAAGUCAAUUUGUAAUAUUUUGCAACCCUAGGAUUUUUUUAAAUAGAUGCUGCUUGCUAUGUUUUCAAACCUUUUUGAGCCAUAGGAUCCAAGCCAUAAAAUUCUUUAUGCAUGUUGAAUUCAGUCAGAAAAGAGCAAGGCUUUGCUUUUUGAAAUUGCAACUCAAAUGAGAUGGGAUGAAAUCCUAUGACAGUAAGCAAAAACAGAACCAUGAAAAAUGAUUGGACAUACACCUUUUCAAUUGUGGCAAUAAUUGAAAGAAUCGAUAAAAGUUCAUCUUUGGACAGAAAGCCUUUAAAAAAAAAAUCACUCCCUCUUCCCCCUCCUCCCUUAUUGCAGCAGCCUACUGAGAACUUUGACUGUUGCUGGUAAAUUAGAAGCUACAAUAAUAAUUAAGGGCAGAAAUUAUACUUAAAAAGUGCAGAUCCUUGUUCUUUGACAAUUUGUGAUGUCUGAAAAAACAGAACCCGAAAAGCUAUGGUGAUAUGUACAGGCAUUAUUUCAGACUGUAAAUGGCUUGUGAUACUCUUGAUACUUGUUUUCAAAUAUGUUUACUAACUGUAGUGUUGACUGCCUGACCAAAUUCCAGUGAAACUUAUACACCAAAAUAUUCUUCCUAGGUCCUAUUUGCUAGUAACAUGAGCACUGUGAUUGGCUGGCUAUAACCACCCCAGUUAAACCAUUUUCAUAAUUAGUAGUGCCAGCAAUAGUGGCAAACACUGCAACUUUUCUGCAUAAAAAGCAUUAAUUGCACAGCUACCAUCCACACAAAUACAUAGUUUUUCUGACUUCACAUUUAUUAAGUGAAAUUUAUUUCCCAUGCUGUGGAAAGUUUAUUGAGAACUUGUUUCAUAAAUGGAUAUCCCUACUAUGACUGUGAAAACAUGUCAAGUGUCACAUUAGUGUCACAGACAGAAAGCACACACCUAUGCAAUAUGGCUUAUCUAUAUUUAUUUGUAAAAAUCCAAGCAUAGUUUAAAAUAUGAUGUCGAUAUUACUAGUCUUGAGUUUCUAAGAGGGUUCUUUAUGUUAUACCAGGUAAGUGUAUAAAAGAGAUUAAGUGCUUUUUUUUCAUCACUUGAUUAUUUUCUUUAAAAUCAGCUAUUACAGGAUAUUUUUUUAUUUUAUACAUGCUGUUUUUUAAUUAAAAUAUAAUCACUGAAGUUUACUAAUUUGAUUUUAUAAGGUUUGUAGCAUUACAGAAUAACUAAACUGGGAUUUAUAAACCAGCUGUGAUUAACAAUGUAAAGUAUUAAUUAUUGAACUUUGAACCAGAUUUUUAGGAAAAUUAUGUUCUUUUUCCCCCUUUAUGGUCUUAACUAAUUUGAAUCCUUCAAGAAGGAUUUUUCCAUACUAUUUUUUAAGAUAGAAGAUAAUUUGUGGGCAGGGGUGGAGGAUGCAUGUAUGAUACUCCAUAAAUUCAACAUUCUUUACUAUAGGUAAUGAAUGAUUAUAAACAAGAUGCAUCUUAGAUAGUAUUAAUAUACUGAGCCUUGGAUUAUAUAUUUAAUAUAGGACCUAUUUUGAAUAUUCAGUUAAUCAUAUGGUUCCUAGCUUACAAGGGCUAGAUCUAAGAUUAUUCCCAUGAGAAAUGUUGAAUUUAUGAAGAAUAGAUUUUAAGGCUUUGAAAAUGGUUAAUUUCUCAAAAACAUCAAUGUCCAAACAUCUACCUUUUUUCAUAGGAGUAGACACUAGCAAGCUGGACAAACUAUCACAAAAGUAUUUGUCACACAUAACCUGUGGUCUGUUGCUGAUUAAUAC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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1396.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1503.66
Frequency: 0.0000
Diversity: 1324.65
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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