Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001369777.1
Sequence Length
1446 nt
GC Content
0.6113
GGACGCAGGUGCCGGCCGGAGCGGAGCUAGUGGCGCCGACGGGCCGGGCCGGGCCGGGACCGGGGCCGAGGCGAACCGAGGGGCCUGUGCGGCCGCCCGGCCCGGCCGCGGAUCAGCUCGUCUCAAACUCCUGGCCUCAAGUGAUCCUCCUGCUUGGACCUCCCAAAGCGCUGGGAUUACAGGCUCCUGGAACCAUGGGCCUCAGGCCCUGAGGAUACGGGGCUCCCGGUGGCCAUGACGACGGGUGACUGCUGCCACCUCCCCGGCUCCCUGUGUGACUGCUCCGGCAGCCCUGCCUUCUCCAAGGUCGUGGAGGCUACGGGCCUCGGACCGCCCCAGUAUGUGGCACAGGUGACUUCAAGGGAUGGCCGGCUCCUCUCCACCGUCAUCCGUGCCUUGGACACACCGAGUGAUGGUCCUUUCUGCCGGAUCUGCCAUGAGGGAGCGAACGGGGAGUGCUUGCUGUCCCCGUGUGGCUGCACCGGCACGCUGGGUGCCGUGCAUAAGAGCUGUCUGGAGAAGUGGCUUUCCUCAUCUAACACCAGCUACUGCGAGCUGUGCCACACGGAGUUUGCAGUGGAGAAACGGCCUCGACCCCUCACAGAGUGGCUGAAGGACCCGGGGCCGCGGACGGAGAAGCGGACACUGUGCUGCGACAUGGUGUGUUUCCUGUUCAUCACACCGCUGGCCGCCAUCUCAGGCUGGUUGUGCCUGCGCGGGGCCCAGGACCACCUCCGGCUCCACAGCCAGCUGGAGGCCGUGGGUCUCAUUGCCCUCACCAUCGCCCUCUUCACCAUCUAUGUCCUCUGGACGCUGGUCUCCUUCCGCUACCACUGCCAGCUGUACUCCGAGUGGAGAAAGACCAACCAGAAAGUUCGCCUGAAGAUCCGGGAGGCGGACAGCCCCGAGGGCCCCCAGCAUUCUCCACUGGCAGCUGGACUCCUGAAGAAGGUGGCAGAGGAGACACCAGUAUGAAUGCUGGGCUCUCCGGACCCUGCAGCAGAGAGGCCAGAGGUAGCUGGUGAUACCCUGUCCUGUGGAAGGACUUCCACUUCAACACUUCCACUUCAACAGUUCCCGCACGGCCUGAACGCUUCUUAGGCCAAGAGACACCAUGCAGAGCCUAGUCUGUGAUCCUGUGUGAAGAUAUUUUCAGGGUUUUUUUUUUUUUUUUUUUGCAUAUGGAGGACAGGUGGACAUGGUCCUGAGCUCUGGACGGAGCAGGCACCCUGAUCUCAUUCUGAGGUCCACAUGGCACCUUCUGGGCCAGCAGCUGUGGCCGGUGUAUCAAGGGCGCCCUUAAAGCUGGAACAUUCCAGCAAGCUUCUUGCGCUUCUCUGCACCCGGCAGGCCCACUUUCCUGGCACCCUCGACUUUAUAUAAAAGUUGCACUGCGUUUCAAAAACCCACCCCUGAAUGAAUAAAAGGAGCCCUGGCUGGACAAAA

Secondary Structure

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Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-622.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -645.85
Frequency: 0.0000
Diversity: 308.09
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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