Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001369778.1

Sequence Length

1649 nt

GC Content

0.6010

GGACGCAGGUGCCGGCCGGAGCGGAGCUAGUGGCGCCGACGGGCCGGGCCGGGCCGGGACCGGGGCCGAGGCGAACCGAGGGGCCUGUGCGGCCGCCCGGCCCGGCCGCGGAUCAGACUGGAGACUGGGUCUUGCUCUGUUACCCAGGCUGGAGUGCAGUGGUGUGAUCAUAGCUCACUACAGCCUUGAACUCCUGGGCUCAAGAGGUUGAGGCUCCCUCCUCAGCCUCCCAAGUAGCUGGGACUACAGGCUUUCAGCACCAUGCCUGGCUAAUUCAAAAAAACCUUCAGAGAGAUAGGGUCUCUCUAUGUUGCCCUAGCUCGUCUCAAACUCCUGGCCUCAAGUGAUCCUCCUGCUUGGACCUCCCAAAGCGCUGGGAUUACAGGCUCCUGGAACCAUGGGCCUCAGGCCCUGAGGAUACGGGGCUCCCGGUGGCCAUGACGACGGGUGACUGCUGCCACCUCCCCGGCUCCCUGUGUGACUGCUCCGGCAGCCCUGCCUUCUCCAAGGUCGUGGAGGCUACGGGCCUCGGACCGCCCCAGUAUGUGGCACAGGUGACUUCAAGGGAUGGCCGGCUCCUCUCCACCGUCAUCCGUGCCUUGGACACACCGAGUGAUGGUCCUUUCUGCCGGAUCUGCCAUGAGGGAGCGAACGGGGAGUGCUUGCUGUCCCCGUGUGGCUGCACCGGCACGCUGGGUGCCGUGCAUAAGAGCUGUCUGGAGAAGUGGCUUUCCUCAUCUAACACCAGCUACUGCGAGCUGUGCCACACGGAGUUUGCAGUGGAGAAACGGCCUCGACCCCUCACAGAGUGGCUGAAGGACCCGGGGCCGCGGACGGAGAAGCGGACACUGUGCUGCGACAUGGUGUGUUUCCUGUUCAUCACACCGCUGGCCGCCAUCUCAGGCUGGUUGUGCCUGCGCGGGGCCCAGGACCACCUCCGGCUCCACAGCCAGCUGGAGGCCGUGGGUCUCAUUGCCCUCACCAUCGCCCUCUUCACCAUCUAUGUCCUCUGGACGCUGGUCUCCUUCCGCUACCACUGCCAGCUGUACUCCGAGUGGAGAAAGACCAACCAGAAAGUUCGCCUGAAGAUCCGGGAGGCGGACAGCCCCGAGGGCCCCCAGCAUUCUCCACUGGCAGCUGGACUCCUGAAGAAGGUGGCAGAGGAGACACCAGUAUGAAUGCUGGGCUCUCCGGACCCUGCAGCAGAGAGGCCAGAGGUAGCUGGUGAUACCCUGUCCUGUGGAAGGACUUCCACUUCAACACUUCCACUUCAACAGUUCCCGCACGGCCUGAACGCUUCUUAGGCCAAGAGACACCAUGCAGAGCCUAGUCUGUGAUCCUGUGUGAAGAUAUUUUCAGGGUUUUUUUUUUUUUUUUUUUGCAUAUGGAGGACAGGUGGACAUGGUCCUGAGCUCUGGACGGAGCAGGCACCCUGAUCUCAUUCUGAGGUCCACAUGGCACCUUCUGGGCCAGCAGCUGUGGCCGGUGUAUCAAGGGCGCCCUUAAAGCUGGAACAUUCCAGCAAGCUUCUUGCGCUUCUCUGCACCCGGCAGGCCCACUUUCCUGGCACCCUCGACUUUAUAUAAAAGUUGCACUGCGUUUCAAAAACCCACCCCUGAAUGAAUAAAAGGAGCCCUGGCUGGACAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-704.40 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -730.56

Frequency: 0.0000

Diversity: 424.55

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

........((.((((((((.((((((..(((((.(((..(((((((((((((((((((.(...(((((((((..........))))...)))))))))))))))))).))).(((((...(((((.((((((((((((((...(.((((((.((((.(((.(((....))).))))))).)))))).)....((.(((((((.((((((((((......))))))))))......(((((((....(((((............)))))....................((((((((...)))))))).......))))))).(((((..(((.((((((((..((((((((..(((((((.....)).)))))..))))))))((((((.((....)).))))))..(((((((......)))))))...(((((((((....(((((.(((.((.((...((((((((((((((..(((.(.(.(((((((((((.((((((...........))))))...))))...((((((..(((.....)))(((.((((..(((((((.((((..(((...........)))..)))).)))))))..))))..))).))))))....))))))).).).))).)))))))...))))))).))..)).)))))))))))))(((((.(((((.....))))))))))..(((((((.((.....)))))))))..........))))..((((((((((((.((.....)).)))))))))))).....((((((((...(((..(((.....))).)))...)))))))).((((((.(((((..((((((((......)))))))))))))))))))....(((.(((((((.........))))))).))).((((((((((.((.(((...(((((((((........)))))))))..(.((((......)))).)......((((.(((((........((((...))))((((((((((((..((((((....(((((((....((.(((((((((..............((((((((...........)))))))).((((...))))........))))))))))))))))))............)))))).)))))))..))))).)))).)..))))..))))).)))))).)))).)))))))).))).((.((.((....((((...(((((((................)))))))....)))).))))))..(((((((.......)))))))..)))))((((((....((((.((((....(((((((((((((.........................)))))))))).)))))))))))...))))))..))))))).)))))))))))).)))).).))))..)))))((.(((((((((.((....)))))).....)))))))(((((.......)))))......((((((....))))))..((.....))((......)).))))...))))))))))))..(((....(((((((.....)))))))...)))((((...)))).....(((...........))).)).))))))))))....

Thermodynamic Ensemble Prediction

,((((((({((({((((((((..(((((((.((({((,.{,(((((((((((((,{((.((((((((..((....))....)))))...))))))))))))))))))||||,.((((,{.{,{,,..||}}|||.}}}||{,.((((((,,(.((((.((((((.{......,},))))}){((({,{...{(({{((((...((((((((((......))))))))))...,}},|}}|))}...}}}||}....))}}}..)))))).}}................((((((((...))))))))..}.}))))))))))..}}}...,|||.||||{...((((((((..(((((((.....))}}))))..))))))))|||}|{,.|||,...{((((({..(((((((......))))))}.(((((((((((....(((((.(((.((.(,{{.((((((((((((((.{(((.(.(.(((((((({{(.(((((,...,,}},.}.)|||||,..,)))}},((((({,,{((....,})){((.((((..(((((((.((((..(((...........)))..)))).)))))))..))))..))).,)))))...}))))))).}.).))),)))))))...)))))))})}..)).))))))))))))),.})))))..,{{{{(({((,||((,,,{(((((,,{((((((,(,((....}}.,.}}}....}}}}((((((((((((.((.....)).)))))))))))).....((((((((...(((..(((.....))).)))...)))))))).((((((.(((((,.((((((((......)))))))))))))))))))...,,{,{(((((((((,......|||{{,,.((((((((.((((((.((((((({(((((((((........)))))))))..{.((((......)))),|,{{{.,,.{{{{{,{{((,,((,.{{(({{{||}|(((((((((((({.((((((...,(((((((....((.(((((((((.,............((((((((...........)))))))).((((...))))......,.)))))))))))))))))).,.......,..)))))).)))))))..)))))..,..(((.(((.((....))))).))).}},}},)}}})))))}}).))))))...{(((({{{(((((((................)))))))....,,,|,.....,..(((((((.......)))))))..}.},,.{{{{(((((,....,||||,{{((((({{{(({,,......}}}}}}}............,)))))))},.)))))))))),},...)))))))).))))))..,,,.)))))))),,.{{{{{{{...))))))),.,.{(((.((....)))))),)})})))))))|||||...,{((|,,,)}},...((((((....)))))).}}},,,,})}))......)))))))))}))))))..}))).))}}}}..{((((((.....))))))),,}))))}}|.......{{{,,({{...........))).},,,,)),)))......