Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001370193.1
Sequence Length
1457 nt
GC Content
0.4832
GCACUUCGCGCUCAAGCGACCGGAUCUUCAAACCGUGGGAGUGGUGCGGCGGCUAGAGUCCCUGGACUCCUCAACCUAGGGAGCUACUCGCGAGAUGGCUGCUGAGGACGAGUUACAGCUGCCGCGGCUCCCCGAGCUGUUCGAAACUGGUAGACAGUUACUGGACGAAGUAGAAGUGGCGACUGAACCCGCCGGUUCCCGGAUAGUCCAGGAGAAGGUGUUCAAGGGCUUGGACCUCCUUGAGAAGGCUGCCGAAAUGUUAUCGCAGCUCGACUUGUUCAGCCGAAAUGAAGAUUUGGAAGAGAUUGCUUCCACCGACCUGAAGUACCUUUUGGUGCCAGCGUUUCAAGGAGCCCUCACCAUGAAACAAGUCAACCCCAGCAAGCGUCUAGAUCAUUUGCAGCGGGCUCGAGAACACUUUAUAAACUACUUAACUCAGUGCCAUUGCUAUCAUGUGGCAGAGUUUGAGCUGCCCAAAACCAUGAACAACUCUGCUGAAAAUCACACUGCCAAUUCCUCCAUGGCUUAUCCUAGUCUCGUUGCUAUGGCAUCUCAAAGACAGGCUAAAAUACAGAGAUACAAGCAGAAGAAGGAGUUGGAGCAUAGGUUGUCUGCAAUGAAAUCUGCUGUGGAAAGUGGUCAAGCAGAUGAUGAGCGUGUUCGUGAAUAUUAUCUUCUUCACCUUCAGAGGUGGAUUGAUAUCAGCUUAGAAGAGAUUGAGAGCAUUGACCAGGAAAUAAAGAUCCUGAGAGAAAGAGACUCUUCAAGAGAGGCAUCAACUUCUAACUCAUCUCGCCAGGAGAGGCCUCCAGUGAAACCCUUCAUUCUCACUCGGAACAUGGCUCAAGCCAAAGUAUUUGGAGCUGGUUAUCCAAGUCUGCCAACUAUGACGGUGAGUGACUGGUAUGAGCAACAUCGGAAAUAUGGAGCAUUACCGGAUCAGGGAAUAGCCAAGGCAGCACCAGAGGAAUUCAGAAAAGCAGCUCAGCAACAGGAAGAACAAGAAGAAAAGGAGGAAGAGGAUGAUGAACAAACACUCCACAGAGCCCGGGAGUGGGAUGACUGGAAGGACACCCAUCCUAGGGGCUAUGGGAACCGACAGAACAUGGGCUGAUCUUCCCACAACACCACAGGACUGCAGGGUGCACAACUCCCCUGCCAAGGAAAACCAUGCAGUCCUCCCCUCCCUGGUCUCCUGCUUCAGCUCUGUACAACGAGGGCAAAGAUGCUAAAUCUUGCUUUGCAUUCAGUAAAGUGUCAAGUGAUUAAGUGUGUAUUUGUACCCUAGAUGAUAUGAACCAGCAGUCUUGUUUUGGCAUCAUCCUCAUCAUGUUGUAUUCCAGCUUCUUAAGUGGAAGGAAAAGAGUGCUGAGAAAUGGCUCUGUAUAAUCUAUGGCUAUCCGAAUUCUCUGAAAAAAUAAUAAAAGUCCCCUCUAUUAUAUGAGCCUGUACAGAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-449.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -472.70
Frequency: 0.0000
Diversity: 373.89
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((......))).(((((((((((...((.((((((..((((((((((.(((((....)))))(((..(((.((.(((((.((....))))))).)).)))..)))....)))))))))))))))))).((((..((((((((.....))))).((((((......(((.(((((........))))).))).......))))))...((((.((((((....))))))..)))).....((((((.((.......))))))))....)))..)))).....)))))))))))......((.((((((((..((((..(((((....)))))....((((((.((........)).)))))).......((((.(((((.(.......).))))).).))).........................(((((..((((((.........)))))))))))((((((((.........((((...(((((.((.........(((((...(((((((((((((((.((((((.(.(((((.((..(((((...................))))).))))))).(((((((((..((((((..(((((((((..(((...(((((......)))))))).)))))))))....))))))......))).))))))(((((.(((..(((((((((((((((((((.((((((((.(((.........(((((........)))))..((((.((..(((((...)))))...))...))))..))))))))(((......))).((((((((............))))).)))...((((....)))).....))).))))))).))))..)))))))).....))).)))))).)))))).))))))..))).))).....)))((((..((......))..)).))...))))))).)))))...)))).....))))))))....))))..)...((((((....((((((.((((((((((...(((((.......(((((.(((((.((((.(((((.(.((....((.((((..((....((((((..(((((........))).)))))))).....))..))))..((((((..........))))))...))....)).).))))).))))))))).)).)))(((((...(((((........))))).(((((.....)))))(((((((.....))))))).(((.((.(((.((.(((......))).)).))).)).)))...)))))...)))))...)))))))))).))........))))..))))))..))))))).))..))))))........(((((.(((((((....((((...........................))))......))))))))))))..........
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({((((((......))),(({({(((((,...((.((((((..((((((((((.(((((....)))))(((..(((.((.(((((.((....))))))).)).)))..)))....)))))))))))))))))).{(((,,({.(((((.....))))).((((((......(((.(((((........))))).))).......))))))...{(((,(((({,{{{,||||,,,{|}}}|||..((((({,((.......)))))))),,,{|||{{||}||,...}}}}}))))))..{,,..,,(({({{,.{{((((..(((((....)))))})).|||{{{.||}},.},}.,,.})}}}),,,}}...,,,.(((((.(.......).))))).}|)))}}},.}}}}}}}},...........{((((..((((((.........))))))))))}{(((((((.......,.((((...(((((.((.........(((((,,,{{({{,.{{(((({(.(({((({{.,{{{{.(({,,((({...,,...}}},.......))))).,})))|{{{{{|||||||,((((({..(((((((((..(((...(((((......)))))))).)))))))))....)))))).,,,...,,.}))})|(((((.(((..((((((({(((((((((((.{{,(((({{(((.........(((((........))))),{((,,.{{..(((({...}))))...))...))))..))))))))(((......))).((((((((............))))).)))...((((....)))).....})).))))))),,)))..}))))))).....))).)))))},||||||{|,},||..{{{.,,,...}}),.}},,}}||}}.}},}},,,,.})),.))))))}.)))))...}))).....)))))))}|,..,,||,,,.,|{,||||....||..((.((((((((((..{(((((.......(((((.(((((.((((.(((((.(.((....({.{(((.,((,...((((((..(((((........))).)))))))).....))..)))}.,((((((.,........))))))...))....)).).))))).))))))))).)).)))(((({...({(((,,......||||}.(((((,,...}}}}}(((((((.....))))))),{{{,|{.{{{.{{.{|{|,.,,.}})})).)}).)).))}...)))))...))))),}.)))))))))).))...}},,.}}}}..|||||,..}}))))).,,..}))))).,,,....(((((.((((({{....(({{.,,.,,.,,.,,.,.............}},,......}))))}}))))),,}.......
Back