Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001370481.1

Sequence Length

2403 nt

GC Content

0.4241

ACUCUUUCCUGCUGCCUAGUCUGCUGAGCAGAGCUUCAGUCUCCACCAUCAAUCAUCCAGUGAGGAAUUUGCACUUACACAAGGAACUCUUCCUCGGAGAGAUCCCCUCCUGAGAUGGAGUUUCACCACGUUGUCCAGGCUGGUCUCGAACUCCUGGGCUCAAGCAAUUUACUUGCCUCAGCCUCCCAAAGUGCUAGGAUUGCAGACGUGUGCCACCACGCCCAGCCUAGAUGGCGUUUCGCCAUAUUGCCCAGGCUGGUCUUGAACUCCCGACCUCAAGUGAUCCACCCACCUGGACCUUCCAAACUGCUGGGAUUACAGGCAUGAGCCACCGUACCUGGCCGAUAUUGAAGUUUUUAAUUCCUCUGACUUUGUGUAAGAUGUGUGAGUCACUUCAAUCAAAUGGAACCAGGAAAUGAUACACAAAUUUCAGAAUUUCUUCUUCUGGGAUUUUCACAAGAACCUGGACUGCAACCCUUCCUCUUUGGGCUGUUCCUGUCCAUGUACCUGGUCACUGUGCUCGGGAACCUGCUCAUCAUCCUGGCCACAAUCUCAGACUCCCACCUCCACACCCCCAUGUACUUCUUCCUCUCCAACCUGUCCUUUGCUGACAUUUGUGUUACUUCCACCACCAUUCCAAAAAUGCUGAUGAACAUCCAGACACAGAACAAAGUCAUCACCUACAUAGCCUGCCUCAUGCAGAUGUAUUUUUUCAUACUCUUUGCUGGAUUUGAAAACUUCCUCCUGUCCGUGAUGGCCUAUGACCGGUUUGUGGCCAUCUGUCACCCCCUGCACUACAUGGUCAUUAUGAACCCUCACCUCUGUGGACUGCUGGUUCUAGCAUCCUGGACCAUGAGUGCUCUGUAUUCCUUGCUACAAAUCUUAAUGGUAGUACGGCUGUCCUUCUGCACAGCCUUAGAAAUCCCCCACUUUUUCUGUGAACUUAAUCAGGUCAUCCAACUUGCUUGUUCUGAUAGCUUUCUUAAUCACAUGGUGAUAUAUUUUACAGUUGCGCUGCUGGGUGGAGGUCCCCUGACUGGGAUCCUUUACUCUUACUCUAAGAUAAUUUCUUCCAUACAUGCAAUCUCAUCAGCUCAGGGGAAGUACAAGGCAUUUUCCACCUGUGCAUCUCACCUCUCAGUUGUCUCCUUAUUUUAUGGUGCAAUCCUAGGGGUGUACCUUAGUUCUGCUGCCACCCGCAACUCACACUCAAGUGCAACAGCCUCAGUGAUGUACACUGUGGUCACCCCCAUGCUGAACCCCUUUAUCUAUAGUCUGAGGAAUAAAGACAUAAAGAGGGCUCUGGGAAUACAUUUGUUGUGGGGAACAAUGAAAGGGCAAUUUUUCAAGAAGUGCCCAUGAUUGCAGGGCUCUAAGCUUCAGAGGUAGUAACUGUCAUUCUUCAAUCAGAUAGUGGAAAUAGAACUUGCUCCUUCUAUUAAUACUUAUUAUAUUUCUGGGAGUUUCAAUUUGUUGUGAUUUCAACUGGUCUUGUAGAAUUUAAGCAACUCCUUUUAUUAAGCUUUCUGCUCUCUGAUAUCCAACAGUUUUUUCUCUUUGUUGUUUUCCUACUUUCUCAAGGUUAUUUCCGACUUUGGAUCAGAAACACUUUGGAGAUUUCCAUUUGUCUCAUACAGGGAAGAGUUGUAUGUCUCCUGUGGCAUAGACUACACUUGGCAAUUGGGGUAAUUGAUGUAAAUUUAUAGUGGAAUAUGACCUGAGACCACAAUUUGUUCACUUUUGUAUUCUUCAGUCCUAUGUCUGUCUCUACCUUCAAUGCUCCUCCUGAUAAUGUAGACCUGAACAUACUUGUGUAUUUUGCAGCUGGUCAUGAGAUUGUGUUGUCCUCAUUAGGACAUCAUGUCUUUGUCAGUGCCAUGUCCACAGUAUCUGCCAUACUCCCUGGCAUAGUACGGUAAGGCAAAAAUUGUUUAUCAAAAAUAUGUUCCGAGUGCAAUGCCCACUGAAAGACAAACUUGCAUAUGUUGAUUAACUUAAUAUGGACUUACAGUCAGAGAUGACCUUAAAUAUGAUGGAGUAAAAUUGUCAAUCAUACAUUGAAUUGCUAUGGAAGACUUGUUUUUAUGAUGUGCAUGGACUCAUUGAAGUAUGGAAGCUUAGUGCCCAUAUAUAAGUUUAUUUAUUGGAGUGAUGGAUUUGGUGCCAUGGUCUAUAAUGUUUCAUGCAUCCAUACUUCUGUUUUUGCUUCAAAAUUUUUAGUGCUCCCUACAAAUACGAAUCCUUCUAUCCCACUAACCAAAAUACCUCCUUCAUUAUAAAAUUUUGUCGUAAACAUUAAAGUGCAGGUCAGUGAACAAUAUUCAAUGUAUCAUCAAUUUAUUCAUCUCUUUUAUGCUCUAAAUUCUCUUAAAUACUCAUGAUUAAAGAAUGACUCACACAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-615.78 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -664.19

Frequency: 0.0000

Diversity: 654.79

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.....(((((((((...(((((((...))))).)).))))...(((.............))))))))......(((((((((((((((((..(((((.(((.....))))))))..))))))))...((((((((.(((((((((((((..(((((((((...((((.....))))...)))))...........))))))).))))(((((....))))).)))))).))))))))((((..((((((.(((((..((((..........))))....(((((((...((..((((...))))...))...))))))).(((....)))......))))).))))))))))...................))))))))).((((((((((((((.(((((..(((..((((((..((((....(((((((((((.......)))))))))))....((((....((........))....)))).((((.(((((((..(((((........)).)))..)))))))..)))))))))))))).((((((((((......................(((((((((...............(((..(((((...((((((...............((((...((((((..((((...(((.((((((.....((((((((.(((((...((((.....)))))))))...................((((..((........))..))))))))))))...(((..(((((((((((((..((((.....)).))...))))))))...))))).)))..))))))..)))...))))))))))..))))(((..(((((.(((((.....((((((...........)))))).((((((.(....).)))))).((((((..........)))))).(((....((((((.((..((...))..)).))))))....)))...(((((...)))))......)))))..)))))..)))(((((((((((......)))).)))))))(((((...)))))...............)))))).....)))))..))))))))))))((((((.((((((...((((((.....(((((((((((...........(((((((...((((((.....))))))...))).))))((((((((.(((......))).....(((.(((((.....))))).)))....((((....((.(((((((((.....((((.........)))))))))).))).)))))).........))))))))...((((.(..(((((.((((....))))))))).).))))..((((...((((((.(((((.(((..((...(((((.((...(((((((.((((((.(((..((((((.....((((....)))).......))))))........))).).))))).))).)))))).)))))...))..))))))))....))))))...))))((((((...((((((..........)))))).............((((((((......))))))))))))))........((((((...(((((.((((.....)))).))).))...))))))(((((......)))))...))))))))))).....))))))........)))))).))).)))..((((((((..((..(((....((((..(((((..((((((.((((.....................))))))))))..))))).))))..)))))..)))....))))).)))))))))).((((((....))))))...((((((..((((((.(((...(((.((((.(((((.......)))))..))))((((((.(((...)))))))))...............)))..)))..))))))))))))........((((((((.....))))))))((((...))))((((((((...(((((.(((((.................(((((((((((..........(((((((.(((.((((((..(((....))).((((((((((.(((((..(.((((...((((((((((.........)))))))))).....)))).)..)))........)).)))))))))).....((((..((((((((((((((.................................................))))).)))))))))..))))))))))))).)))))))..........))))))))))))))))))))).))))))))..........................)))))))).)))..)))))))))))...

Thermodynamic Ensemble Prediction

.....{({((((((...{{(((((...))))},}}.)))}.....,...........,,))}))))}......(((((((({((((((((..(((((.(((.....))))))))..))))))))...((((((((.(((((((((({{{..(((((((((.,.((((.....)))).,.))))}..........,))))})}.)))}(((((....))))),)))))).)))))))).,{,..((((((.(((((..((((..{.......))))....(((((((...{{..((((...))))...}}...))))))).(((....)))......))))).)))))),}||{{{............}}}}))))))))).((((((((((({((.(((({..,({..(((((,..{{{.....(((((((((((.......)))))))))))......,,.|,|||,,.,,,.,{{.....,,,.|||{|||,.,.|||||{||...,{{{,||{{||,,|||||}}..|,,}},,,)))))).((((((((((({{,..................(((((((({{({{........{(((.......)))}...{{(.......,,,...............((((((((.....{{{.{{(((({,{{,(({{{{{{..,(({,,.{{((,,,,.||||,.{||..,,,,{|,,.{{|..,..|||,.}||},,.......,,)).,))))})))|,|||{,,(({{{(((((,,...|||||.....(((((.(((((((....,{{,,,.,||,......||,.||{{|,,,,}))))},}..))))))))))))...|||.....,|||||,,,,,.....,)}}}}}.((((((.(....).)))))).,{{{{{......,,..))))))||,.....{{{(({,{{..,,...,}..))}))))}}.,........{((((...)))))........|{((.,,}}}}.}||((((((({{(({.....)))}.)))))))}|.......||||.....}}}}.......,},,,..))))))))..))))))))))))((((((.((((((.((((((((.....(((((((((((............((((((.{{(,,,||,}}}})),|||..{||,{||||((((((((.,,(,,....))).....(((.(((((.....))))).)))....((((....((.(((((((((.....((((.........)))))))))).))).)))))).........)))))))),,,((((,{..(((((.((((....))),)))))..,||}},(((((...((((((.(((((.(((..((...(((((.((,..(((((((.((((((.(((..((((((...,.{(({....,,}},,,....))))))........))).)},)))).)))}}))))).)))))...))..))))))))....))))))...))))}|||,.,}}{{{{({.........,)))))),,,,,,.....,,,(((((((......))))))))},}}}}.......,{(((((...,{,,{,||||.....)))).}|}||}.,.|}}}}}.}}))))))))))}.....))))))))))).....)))))}.....,}})))))).))).))),,((,{((({..,{,.{{,..,,{{{{,.{((((..{(((((.((((.....................))}))))))),.})))),)}}}..))),,..,}}.,,.})))).)))))))))).((((((....))))))...((((((..{(((((,,{(,.,{{,,((((.{{{{|,,,,...))))),.)))){{{{||||{....|||}}},}}........,,,..,,)))},})),,)))))}}))))}.....|||{{{{{{{{.....,}}))))}|||{...))))((((((((...(((((.((((({,...............(((((((((((..........(((((((,({{.(((({(,,({,,,,..,,.((((((((({.((,,,..|,||||,,,|||||||,,,,,.,{{{,||{|((|||||,,,,|||||.},...,.|..,}},))}))))))}})).||,,{(({..{{{{(((({(((((..............,,,....,,.....,,,,,................,},,,.,})))))))..))}})))}}},}).))))))),..,,,,,..))))))))))))))))))))).))))))))..,}.,.....................,,))))).)))..)))))))))))...