Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001371008.1
Sequence Length
4857 nt
GC Content
0.5015
GGGAGGAGGCAGAGAGGGAAGCGAGCUGCGGCCGGGCGGGCUCGGCGCUCGGAGACCCGGUGGAGCCCAAAGUUUCCGCGCAGCCCCUGGGUGGCGGCAGCGCCGGCGGCGCGGGGCGCCCGGGACAGUCUUGAGCGCCGGCCUCGCCCCGCGGGGACCCGCGCCCGCCGCCGGCCACGCCGAGUGUCGCCCGCAGCCACGCGGAGGCGGCGGGGAGCCGCGCGCGGCAGGUGCUGCAGCGCAGUAAAUGUAAUUUGAAGAAGGCAGAAGGAACCCAUGGCUUUAGCCGGCUGCCCAGAUUCCUUUUUGCACCAUCCGUACUACCAGAGGAUGAUGUGGACCUGGAAGCCCUGGUGAACGAUAUGAAUGCAUCCCUGGAGAGCCUGUACUCGGCCUGCAGCAUGCAGUCAGACACGGUGCCCCUCCUGCAGAAUGGCCAGCAUGCCCGCAGCCAGCCUCGGGCUUCAGGCCCUCCUCGGUCCAUCCAGCCACAGGUGUCCCCGAGGCAGAGGGUGCAGCGCUCCCAGCCUGUGCACAUCCUCGCUGUCAGGCGCCUUCAGGAGGAAGACCAGCAGUUUAGAACCUCAUCUCUGCCGGCCAUCCCCAAUCCUUUUCCUGAACUCUGUGGCCCUGGGAGCCCCCCUGUGCUCACGCCGGGUUCUUUACCUCCGAGCCAGGCCGCCGCAAAGCAGGAUGUUAAAGUCUUUAGUGAAGAUGGGACAAGCAAAGUGGUGGAGAUUCUAGCAGACAUGACAGCCAGAGACCUGUGCCAAUUGCUGGUUUACAAAAGUCACUGUGUGGAUGACAACAGCUGGACACUAGUGGAGCACCACCCGCACCUAGGAUUAGAGAGGUGCUUGGAAGACCAUGAGCUGGUGGUCCAGGUGGAGAGUACCAUGGCCAGUGAGAGUAAAUUUCUAUUCAGGAAGAAUUACGCAAAAUACGAGUUCUUUAAAAAUCCCAUGAAUUUCUUCCCAGAACAGAUGGUUACUUGGUGCCAGCAGUCAAAUGGCAGUCAAACCCAGCUUUUGCAGAAUUUUCUGAACUCCAGUAGUUGUCCUGAAAUUCAAGGGUUUUUGCAUGUGAAAGAGCUGGGAAAGAAAUCAUGGAAAAAGCUGUAUGUGUGUUUGCGGAGAUCUGGCCUUUAUUGCUCCACCAAGGGAACUUCAAAGGAACCCAGACACCUGCAGCUGCUGGCCGACCUGGAGGACAGCAACAUCUUCUCCCUGAUCGCUGGCAGGAAGCAGUACAACGCCCCUACAGACCACGGGCUCUGCAUAAAGCCAAACAAAGUCAGGAAUGAAACUAAAGAGCUGAGGUUGCUCUGUGCAGAGGACGAGCAAACCAGGACGUGCUGGAUGACAGCGUUCAGACUCCUCAAGUAUGGAAUGCUCCUUUACCAGAAUUACCGAAUCCCUCAGCAGAGGAAGGCCUUGCUGUCCCCGUUCUCGACGCCAGUGCGCAGUGUCUCCGAGAACUCCCUCGUGGCAAUGGAUUUUUCUGGGCAAACAGGACGCGUGAUAGAGAAUCCGGCAGAGGCCCAGAGCGCAGCCCUGGAGGAGGGCCACGCCUGGAGGAAGCGAAGCACACGGAUGAACAUCCUAGGUAGCCAAAGUCCCCUCCACCCUUCUACCCUAAGUACAGUGAUUCACAGGACACAGCACUGGUUUCACGGGAGGAUCUCCAGGGAGGAAUCCCACAGGAUCAUUAAACAGCAAGGGCUCGUGGAUGGGCUUUUUCUCCUCCGUGACAGCCAGAGUAAUCCAAAGGCAUUUGUACUCACACUGUGUCAUCACCAGAAAAUUAAAAAUUUCCAGAUCUUACCUUGCGAGGACGACGGGCAGACGUUCUUCAGCCUAGAUGACGGGAACACCAAAUUCUCUGACCUGAUCCAGCUGGUUGACUUUUACCAGCUGAACAAAGGAGUCCUGCCUUGCAAACUCAAGCACCACUGCAUCCGAGUGGCCUUAUGACCGCAGAUGUCCUCUCGGCUGAAGACUGGAGGAAGUGAACACUGGAGUGAAGAAGCGGUCUGUGCGUUGGUGAAGAACACACAUCGAUUCUGCACCUGGGGACCCAGAGCGAGAUGGGUUUGUUCGGUGCCAGCCGACCAAGAUUGACUAGUUUGUUGGACUUAAACGACGAUUUGCUGCUGUGAACCCAGCAGGGUCGCCUCCCUCUGCAUCGGCCAAAUUGGGGAGGGCAUGGAAGAUCCAGCGGAAAGUUGAAAAUAAACUGGAAUGAUCAUCUUGGCUUGGGCCGCUUAGGAACAAGAACCGGAGAGAAGUGAUUGGAAAUGAACUCUUGCCCUGGAAUAAUCUUGACAAUUAAAACUGAUAUGUUUACUUUUUUUGUAUUGAUCACUUUUUUGCACUCCUUCUUUGUUUUCAAUAUUGUAUUCAGCCUAUUGUAGGAGGGGGAUGUGGCGUUUCAACUCAUAUAAUACAGAAAGAGUUUUGAAUGGGCAGAUUUCAAACUGAAUAUGGGUCCCCAAAUGUUCCCAGAGGGUCCUCCACACCCUCUGCCGACUACCACGGUGUGGAUUCAGCUCCCAAAUGACAAACCCAGCCCUUCCCAGUAUACUUGAAAAGCUUUCUUGUUAAAAUAAAAGGUGUCACUGUGGUAGGCAUUUGGCAUAUUUUGUGGACUCAGUCAAGCAACCACAGUCUGUUAAUCAUUUCUCUAUGCUCAGAUGUCAGAUCCUCUUGUUAUUAGUGUGUCUUGUUCUGCACAGUGCAGGAGACUUUAUUCCUUUGGAAAAUUCACUGUUCCACAAACAGCAGGCUGAAUGGCCUCGCCUCUAGAUUGACGUGGGCCAGCCUCCUUGAGACACACCUGGCACCCGUCAUCGGCCAGCGGUGGAUGCUGCAUAAUCCACCUGGGUACUUCAGCCUUGCGUUUCCACAGCCUUCAGCCUGUUCUAGAACGAUCACUGCCUUACCCCUGCUGCUGCAGUGGUGUGAGUCGUUUCACGGCUGAUGUCCCUCGGGGGAUUAAAGGAUCUAAAGAGAAAAUGGCACCUGGUUGUCUUCGUGCUGUGUCUCAUGGGUUUCCAUAGUGAUAAAGACAAGGAAACGCUGCAGGGGCCACAGGCACAGGCUGAUAUUUAAAGAUCUUUGCUUGCAGCCCUCCGUCCUGCUGAAAACCCCCAUAAGCCAGUGAACACAGAGCAGCUAGAGGCUCCUCCUCUGCUGGCUUAGGGUCAGAAGUACCUCACAGUGGUUGUGGACAUGGAAGAGUUUUGUCAACACAACACUUUGUCCCCGCUCCGGGAGAUGAGUCAGAUGGUGGCUUGAGUUGUCACUUGGUCCCCUCCGCCCCUCGGGUGGCCCCCUUUGCCACGUCCCCUUAGCUUAGUGAUCAGGUGUGAGAGUGGCCAUUUCCUUACCUUUGAUCCCUGUAAAGCAGAAAGGACUCCUUUGACAGGCGACAAACUACUGUGGUGAGCAGAAUGAUUUCCUUUUUCAAGACAACACCUGCCUGGCUUCUAUUAAUGUGUGCUGGCCAUGAUAUUGCCCCAAAUCCGCCCCACUGAAGUGUUCCCUAAGGAACAGCAUUUCUCUGCUCCUCAGUCAACCCCCGUAGCCUAGAGCAGUGUCACAAGCUUCAGUAAGGCCAGUCAGCUGGAAGUCAGUCUACCGUAUAGUAACACUGUAUGUCAGUCUACAGACCACACUCUAGUUGUUUUCCAUGAAAGGUAUACAAAUGAAGAAUUUUCUAGCAAAACAUGUUUUUAACCAUCAGUGCUCAAUUGCAUUUUCUUCCUUUCGCAGCCAGUCAGUCUUUCAAACUAUUGACAGUAAGAUAAUUCUCACGUUCACACCUGGUGGCAGGCUUCACUGUAGGGACGGACAUUGCAGUUACACCACGAUUCCUUCCUCUUCACUGGCUCGAGGUAAACCCUUUUCAAGGAAAAACAACUCUAGGAUUUCUUUUUUCUGUGUACGUAGACCAGUCCCAUCAGUGUAUAAUCUCUCUCUCACACGCCUCUCUCCAAUAGACAGCUUGUAUUUGCAGUAUUUCAUAUUUAUAAAUAUGCGUUUAUUUAAAAGGAGAACAAAAGCUUGACUCUGAUUCACAGUUUUGUAUGUAGCUGGUUUGACGUAGUCUUUUGUAUUUUCCCUGCCGAAGUGAAUUGUUGGAGAAUGUAAACCGCCUCCACGUGGCGGCAGACUUCCUAAGGCCCCAGCUCGCUGGCCUCGCGCUGGGCGGCUGGGAAUUCCACCUGAGAACAAGUCCCGCAAACCGGGGACGGAAGGACAUUUGACUUUUAUUUUUGUAUUUAAUUGACAUGAAUGUAAAGGGGACAGCUCAGGGUUGUUUUGGAGCCUGUUGACUUUGUAUCUCUGCCUGUGAUUUUCUUUUCUAAAUGAAACUCCAUGUAGCAACCAGGACGAAGUUGAGAAGGAAAACGCCAAAUGCUUUGGUUAUUAGAGUUUAAUAGGUAAGCUCUGUUACACUAGGUGUUAGAGUUCCAGAAUGUUCUUUUGUUUGCUAAACCUUGAAGAAACAUGUGCCUCAGCCUAGAUGUUUUGUCUUCUCUUUUCUGCACUUAAUACCUGACAGUAUGACCGAUCUCUGCGCCUUUCUGGGGGCGGGCAAGCUGGCGGUAGAUUUGUGAUGUCACAGUGCAAACUGCAGUGACUGUAAAUUGGCCUGGCGUGUAUAAACGUUUUCAGGGAAUGCAGAAGGUAUUAAUGAAGAGACAAAACCUUUAUUCCAUGUGCUUUGCUUCAUUCUGUACAUAGCUCUUUGGCUCGUGAACCUAAUUGUAAACUUUCAGGUAUUUUUGUACAAAUAAGGGACUGAUGUUCUGUUUCUUGUAAUUAGAAAUAAACAUUAAUACAGUGUUCUUCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1624.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1715.47
Frequency: 0.0000
Diversity: 1441.80
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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