Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001371392.1

Sequence Length

1531 nt

GC Content

0.3703

GGAAGUGACGCGAGGCGUAGCGGAAGUUACUGCAGCCGCGGUGUUGUGCUGUGGGGAAGGGAGAAGGAUUUGUAAACCCCGGAGCGAGGUUCUGCUUACCCGAGGCCGCUGCUGUGCGGAGACCCCCGGGUGAAGCCACCGUCAUCAUGUCUGACCAGGCAAAACCUUCAACUGAGGACUUGGGGGAUAAGAAGGAAGGUGAAUAUAUUAAACUCAAAGUCAUUGGACAGGAUAGCAGUGAGAUUCACUUCAAAGUGAAAAUGACAACACAUCUCAAGAAACUCAAAGAAUCAUACUGUCAAAGACAGGGUGUUCCAAUGAAUUCACUCAGGUUUCUCUUUGAGGGUCAGAGAAUUGCUGAUAAUCAUACUCCAAAAGAACUGGGAAUGGAGGAAGAAGAUGUGAUUGAAGUUUAUCAGGAACAAACGGGGGGUCAUUCAACAGUUUAGAUAUUCUUUUUAUUUUUUUUCUUUUCCCUCAAUCCUUUUUUAUUUUUAAAAAUAGUUCUUUUGUAAUGUGGUGUUCAAAACGGAAUUGAAAACUGGCACCCCAUCUCUUUGAAACAUCUGGUAAUUUGAAUUCUAGUGCUCAUUAUUCAUUAUUGUUUGUUUUCAUUGUGCUGAUUUUUGGUGAUCAAGCCUCAGUCCCCUUCAUAUUACCCUCUCCUUUUUAAAAAUUACGUGUGCACAGAGAGGUCACCUUUUUCAGGACAUUGCAUUUUCAGGCUUGUGGUGAUAAAUAAGAUCGACCAAUGCAAGUGUUCAUAAUGACUUUCCAAUUGGCCCUGAUGUUCUAGCAUGUGAUUACUUCACUCCUGGACUGUGACUUUCAGUGGGAGAUGGAAGUUUUUCAGAGAACUGAACUGUGGAAAAAUGACCUUUCCUUAACUUGAAGCUACUUUUAAAAUUUGAGGGUCUGGACCAAAAGAAGAGGAAUAUCAGGUUGAAGUCAAGAUGACAGAUAAGGUGAGAGUAAUGACUAACUCCAAAGAUGGCUUCACUGAAGAAAAGGCAUUUUAAGAUUUUUUAAAAAUCUUGUCAGAAGAUCCCAGAAAAGUUCUAAUUUUCAUUAGCAAUUAAUAAAGCUAUACAUGCAGAAAUGAAUACAACAGAACACUGCUCUUUUUGAUUUUAUUUGUACUUUUUGGCCUGGGAUAUGGGUUUUAAAUGGACAUUGUCUGUACCAGCUUCAUUAAAAUAAACAAUAUUUGUAAAAAUCAUACUAAUGCUUAUUUUAUUUUAAUUGUAUAGAAAGAAAAAAAUGCCUAAAAUAAGGUUUUCUUGCAUAAAUACUGGAAAUUGCACAUGGUACAAAUUUUUUCUUCAUUACUGUACAGUGAUGAUGUUAAUGACUUUGAAGCACUGAAAGUUACUGAAGUGCCUUCUGAAUCAAGGAUUUAAUUAAGGCCACAAUACCUUUUUAAUACUCAGUGUUCUGUUUUUUUAAAAACUUGAUAUUCCUGUAUGGUGCAUAUAUGAUACAGUUACCUAAUCAUGUUGAAUAAAUGGGCAUGCCAAAAAUUCUUACUGGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-376.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -408.05

Frequency: 0.0000

Diversity: 391.77

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

...((((.((((..(((((((....))))).))...))))((((((((((.(((((...(.(((....))).)...))))).)))........(((((((((.((((((......))))....)).)))))).)))((((.((.((.(((((..(((((.....((((.....)))).))))).))))).))..)).))))...........((((..((.(((......))).))..)))).((((((....))))))....))))))).((((..((..((((((((......(((((...)))))((....))...(((.((.....)).)))))))))))..)).)))).....(((..((((((...(((((((((((((((..(((((((((((((.....((((..((((..((((....(((......)))....)))).))))..)))).))))))))))))))))))........((((((....)))))).))))))))))...))))))..)))....((((((......(((((.(((((........(((((..((((((((....((.((((((((....((((((..((((((..((((.((((.(((((((((((.....((....((((......((..((((..(((......(((((...((((.(..(((((((...)))))))..).))))...)))))((((((...(((.((((((((((((((.....(((.((((((...........((....))........((((.(((((((...(((((.(((((..((((.......)))))))))...))))).......((((((...(((.(((((((((.(((((.(((....((((((((((((...(((((((...(((..............)))...)))))))...((((...))))......((.(..(((....)))..).)))))).))))))))...))).)))))))))))((((((((...)))))))).........))))))...)))))).........((((..........)))))))))))))))............))))))))).....)))))))))))))))))....)))))))))...))))..))...))))....(((((((.......(((((((((((...((((.(((.......))).)))).....))))))))))).)))))))((((((.....((((......)))))))))))).....))))))))))))))))))).)))))).......((((((((....))))))))...))))))...)).))))))))))))))))...(((((((.((((((...))))))...)))).)))..................((((((..(((((....)))))..)))))).((((((.(((....))).))))))..........)))))......)))))..)))))..))))))))))...

Thermodynamic Ensemble Prediction

...(((({((((.,(({({((,,..}}}}).))..})))}((((((((((.(((((...(,({,....))).)...))))).))),,,.....(((((((((.((((((......))))....)).))))))}}))((((.((.((.(((((..(((((.....{(((,....)))).))))).))))).))..)}.))))...........{{{,..{((((({.....,,,.,)}}))},.{(((((....)))))}....}}}}}}}.{(({..((..{((((({{,,{,..(((((...))))){{||,,{,..,{{{,,|,,||,}},,,.}}})))))..)),))))....,{((..((((((.,.((((((((((((((.,{({(({((((((,,.{{..((((..((((..((((....,{{,.....}))....)))).))))..)))).,))))})))))))}))))}},.}}},{(((((....)))))}.))))))))))...))))))..))}....,|||||......{{{||,|{{{{.,.,||,,,{{{{.,(((({||,.,.{{{,((((((((....((((((..((((((..(((,{((((.(((((((((((.....((....((((......{(..((((..(((......,{{{{...((((.(..(((((((...)))))))..).))))...}}}}}((((((...(((.((((((((((((((.....((,{((((((.....{{{{,,((,.{{,.{{{(((.((((({(,,,((((.....))}|,,||}}|{{{.,}}..}))),)),})}}})))))|.,,...((((((...(((.(({{(((((.(((((.(((....((((((((((({...{((((({..,(((...,,....,....))}...)))))))...((({...})))......,,,(.{(((....,,,.})})))))).))))))))...))).))))))))))}((((((({...}))))))),,,....,,))))))...))))))....|||,,({((..........}})),,|}))},,,}}}},........))))))))).....)))))))))))))))))....)))))))))...))))..))...))))....(((((((.,.....{{(((((((({.{.(((,.(((.......))).}))).}},,))))}}}})}),)))))))((((((.....((((......)))))))))))).....))))))))))))))))))).)))))).......((((((((....)))))))).}.))))))...))}})))))}|},||||,,|,.({(((((.((((((...))))))...))))},}}......,,,.|||...,|||||||,,|{{{,...,))))}..}}},,..((((((.(((....))).)))))).,,,,....,}}}}),}}...}))))..)))))..,}})))))))...